Centrum je vybaveno přístroji pro vysoce propustné (tzv. „high-throughput“) metody analýzy genomu a proteomu i pro přesné analytické měření a morfologické studie. Klíčové přístroje a technické vybavení centra fungují na bázi tzv. „core facility“, tj. centralizovaných sdílených zdrojů obsluhovaných specializovanými pracovníky.
Jedná se o jednotky:

• hmotnostní spektrometrie,
• analýzy nukleových kyselin,
• produkce a purifikace proteinů,
• histologie a mikroskopie,
• průtokové cytometrie,
• tkáňové kultury.

MŠMT, OP JAK; reg. č. CZ.02.01.01/00/22_008/0004644; 2024–2028

Záchrana životů prostřednictvím výzkumu v oblasti včasné detekce a prevence rakoviny: Molekulární, genomické a sociální faktory (SALVAGE)

Řešitel: prof. MUDr. Marek Svoboda, Ph.D.

Horizon Europe (HORIZON-MSCA-2022-DN-01); grant agreement no. 101119464; 01/2024–01/2028

Preventing Therapy Resistance in Esophageal Cancer Using Advanced Models and Molecular Signatures (PRESSURE)

Spoluřešitel: doc. MUDr. Radka Lordick Obermannová, Ph.D.

AZV ČR; NU22-08-00230; 2022–2026

Proteogenomová klasifikace trojitě negativních nádorů prsu ve vztahu k prognóze a cílené terapii

Spoluřešitel: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D.

AZV ČR; NU23J-08-00006; 2023–2026

Nové metody in vitro detekce lidského cytomegaloviru u onkologických pacientů

Řešitel: Mgr. Ludmila Moráňová, Ph.D.

AZV ČR, NW26-03-00300; 2026–2029

Optimalizace a charakterizace selektivních organorutheniových inhibitorů galektinu-1 uplatnitelných při léčbě nádorových onemocnění

Řešitel: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D.

AZV ČR, NW26-08-00046; 2026–2029

Technologie pro molekulární aktivaci platinových léků

Řešitel: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D.

AZV ČR, NW24J-03-00038; 2024–2027

Onkogen nebo tumor supresor? Role TUSC3 v imunitním dohledu a karcinogenezi – potenciální význam v imunotereapii

Řešitel: Mgr. Lukáš Moráň, Ph.D.

AZV ČR, NW24-10-00204; 2024–2027

Evaluace klinických, radiologických a genetických charakteristik u pacientů s orofaciálními anomáliemi v korelaci s onkologickými onemocněními – algoritmus pro zlepšení diagnostiky

Spoluřešitel: RNDr. Ing. Ondřej Bonczek, Ph.D.

GAČR, 26-21679S; 2026–2028

The role of HSF1 in tumor adaptation to proteotoxic stress: synthetic lethality and targeted inhibition strategies

Řešitel: MUDr. Petr Müller, Ph.D.

GAČR, 25-15990S; 2025–2027

Kombinace nových amplifikačních technik nukleových kyselin a elektrodových biočipů pro pokročilou diagnostiku nádorových onemocnění

Řešitel: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D.

• Oleg Aleksandrov (PřF MU) – téma BP: Využití phage display - peptidových knihoven pro analýzu proteinových interakcí.– školitel BP: MUDr. Petr Műller, Ph.D.
• Anna Borisová (PřF MU) – téma BP: Inovativní elektrochemická bioplatforma pro identifikaci fúzních genů. – školitel BP: Nasim Izadi, Ph.D.
• Nina Libová (MU PřF) – téma BP: Modifikace povrchů elektrodových biočipů pro analýzu nukleových kyselin jakožto nádorových biomarkerů. – školitel BP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Romana Kubicová (MU PřF) – téma BP: Analýza protinádorového účinku křemíkových nanočástic funkcionalizovaných titanocenem a jeho deriváty. – školitel BP: Mgr. et Mgr. Petr Voňka, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Lucia Šutvajová (PřF MU) – téma BP: Analýza protinádorového účinku acylovaných fluorovaných analog manosaminů. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Denisa Kučová (MU PřF) – téma BP: Vliv stresu endoplazmatického retikula na imunitní dohled a imunoterapii u ovariálního karcinomu. – školitel BP: Mgr. Kateřina Vašíčková, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Alica Záchejová (MU PřF) – téma BP: In vivo model vlivu stresu endoplazmatického retikula na imunitní dohled v léčbě ovariálního karcinomu. – školitel BP: Mgr. Lukáš Moráň, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Marie Kundratová (MU PřF) – téma BP: In vivo model vlivu stresu endoplazmatického retikula na imunitní dohled v léčbě renálního karcinomu. – školitel BP: Mgr. Lukáš Moráň, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Ema Jochmanová (PřF MU) – téma BP: Význam a uplatnění biobankování v biomedicínském výzkumu. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2023)
• Jana Kopečná (PřF MU) – téma BP: Vliv stresu endoplazmatického retikula na imunoterapii pomocí checkpoint inhibitorů u renálního karcinomu. – školitel BP: Mgr. Kateřina Vašíčková, Ph.D (obhájeno 2022)
• Kateřina Ondrášková (PřF MU) – téma BP: Monitorování minimální reziduální choroby u pacientů s karcinomem pankreatu. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2021)
• Klára Mrázová (PřF MU) – téma BP: Screening karcinomu pankreatu u osob se zvýšeným rizikem. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2022)
• Kamila Dostálová (PřF MU) – téma BP: Analýza protinádorového účinku organokovových komplexů s NSA. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2022)
• Jitka Švandová (PřF MU) – téma BP: Identifikace molekulárních změn, použitelných jako prediktorů prekancerózy a časného stádia karcinomu endometria. - školitel BP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2022)
• Petra Mikušová (PřF MU) – téma BP: Detekce AGR proteinů v extracelulárním prostředí nádorů. – školitel BP: Mgr. Veronika Brychtová, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Andrea Martišová (PřF MU) – téma BP: Úloha transgelinu v nádorových buňkách. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Daniel Nesrsta (PřF MU) – téma BP: Organokovové sloučeniny při léčbě nádorových onemocnění. – školitel BP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Olga Breznická (LF MU) – téma BP: Léčebné výsledky radioterapie u karcinomu prostaty. – školitel BP: MUDr. Pavel Krupa (obhájeno 2017)
• Pavel Kubín (LF MU) – téma BP: Chronická toxicita po radioterapii u karcinomu prostaty. – školitel BP: MUDr. Pavel Krupa (obhájeno 2017)
• Lucia Janáčová (PřF MU) – téma BP: Mechanismy rezistence vůči endokrinní terapii u nádorů prsu. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Matej Hropko (PřF MU) – téma BP: Význam genomiky, transkriptomiky a proteomiky pro určení molekulárních podskupin meduloblastomu. – školitel BP: Mgr. Marta Nekulová, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Ondřej Vacek (PřF MU) – téma BP: Odpověď nádorové buňky na proteotoxický stres. - školitel BP: Mgr. Michal Pastorek, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Lucie Bienová (LF MU) – téma BP: Verifikace platnosti modelů akutní toxicity pro močový měchýř a konečník u radioterapie karcinomu prostaty technikou Rapid Arc. - školitel BP: MUDr. Pavel Krupa. (obhájeno 2015)
• Kateřina Bustová (LF MU) – téma BP: Verifikace platnosti modelů akutní toxicity pro močový měchýř a konečník u radioterapie karcinomu prostaty technikou 3D CRT. - školitel BP: MUDr. Pavel Krupa. (obhájeno 2015)
• Barbora Šustáčková (LF MU) – téma BP: Verifikace platnosti modelů akutní toxicity pro močový měchýř a konečník u radioterapie karcinomu prostaty technikou IMRT. - školitel BP: MUDr. Pavel Krupa. (obhájeno 2015)
• Eliška Stuchlíková (PřF MU) – téma BP: Optimalizace růstu buněčné linie odvozené od nádoru vaječníku rezistentní na cisplatinu. – školitel BP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Oliver Šimončík (PřF MU) – téma BP: Vztah proteinové homeostáze a aktivace transkripčních faktorů HSF. – školitel BP: MUDr. Petr Muller Ph.D. (obhájeno 2015)
• Alena Kopková (PřF MU) – téma BP: Úloha proteinu p53/47 při stresu endoplazmatického retikula. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Sabina Oweisová (PřF MU) – téma BP: Aplikace elektroanalytických metod v molekulární onkologii. – školitel BP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Petr Lapčík (PřF MU) – téma BP: Metoda SWATH-MS a její využití v proteomické analýze nádorů prsu. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Pavlína Mrhálková (PřF MU) – téma BP: Vliv izoforem p63 na chemosensitivitu nádorových buněk. – školitel BP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Václav Hrabal (PřF MU) – téma BP: Úloha proteinu p63 při vzniku a vývoji nádorového onemocnění. – školitel BP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Karolína Zoufalová (PřF MU) – téma BP: Signální dráhy v metastazování nádorů prsu a jejich studium s využitím cílené proteomiky. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2014) 
• Anna Odehnalová (PřF MU) – téma BP: Mechanismy zodpovědné za rezistenci k tamoxifenu a biomarkery s nimi spojené. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Kateřina Ceralová (PřF MU) – téma BP: Vliv hormonů v etiopatogenezi nádorů, úloha androgenního receptoru v signalizaci proteinu Anterior gradient 2 u karcinomu prsu. – školitel BP: Mgr. Veronika Brychtová (obhájeno 2014)
• Helena Ďuríková (PřF MU) – téma BP: Detekce a identifikace malých nekódujících RNA v lidských tělních tekutinách. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2014) 
• Markéta Stejskalová (PřF MU) – téma BP: Přispívá exprese proteinu p63 ke vzniku rakovinné kmenové buňky? – školitel BP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Vendula Šromová (MU PřF) – téma BP: AlphaB-crystallin a jeho vztah k nádorovému onemocnění. – školitel BP: RNDr, Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2014)
• Monika Diblíková (MU PřF) – téma BP: Úloha proteinu CD105 v rozvoji nádorových onemocnění. – školitel: Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Petra Kovaříková (PřF MU) – téma BP: Proteázy extracelulární matrix: Funkce a metody studia. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Zuzana Bábovská (PřF MU) – téma BP: Proteiny rodiny thymosinů a jejich úloha v tumorigenezi. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Michal Řiháček (PřF MU) – téma BP: Imunochemická a mikrobiologická metoda stanovení plazmatických a erytrocytárních folátů a vliv přítomnosti antifolátových terapeutik. – školitel BP: doc. MUDr. Dalibor Valík, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Josef Maryáš (PřF MU) – téma BP: Úloha proteinů regulační dráhy NFkappaB v procesu metastázování nádorů. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Jiřina Čípková (PřF MU) – téma BP: Autofagie a charakterizace epitopů anti-ATG4A protilátek pomocí „phage display“. – školitel BP: Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Lucia Sommerová (PřF MU) – téma BP: Úloha proteinu AGR2 v procesu maligní přeměny buňky. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Lenka Příhodová (PřF MU) – téma BP: Úloha zánětu při vzniku nádorových onemocnění. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Květa Pilařová (PřF MU) – téma BP: Protein p53/47 a jeho úloha v nádorech. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2011)
• Iveta Hynštová (PřF MU) – téma BP: Charakterizace rodina anterior gradient proteinů, analýza exprese proteinu AGR3 ve zdravých tkáních. – školitel BP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2011)
• Jana Nováková (PřF MU) – téma BP: Rodina proteinů 14-3-3: Dvojsečná zbraň v nádorové biologii. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2011)
• Vendula Pernikářová (PřF MU) – téma BP: Vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie s využitím technologie Orbitrap: Nové šance pro proteomiku. – školitel BP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2011)

• Bc. Pavel Müller (PřF MU) – téma DP: Modulace nádorové imunitní odpovědi in vitro: Vliv buněčné konfluence na expresi PD-L1 a dalších regulačních molekul. – školitel DP: Mgr. Pavlína Zatloukalová, Ph.D.
• Zoltán Szabó (LF MU) – téma DP: Studium stresové odpovědi nádorové buňky. – školitel BP: MUDr. Petr Műller, Ph.D.
• Bc. Otakar Fišer (PřF MU) – téma DP: Vliv onkoproteinu MYC na translaci a citlivost k proteotoxickému stresu. – školitel BP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2025)
• Bc. Tomáš Doležal (PřF MU) – téma DP: Výzkum evolučně konzervovaných mechanismů reakce na proteotoxický stres: Studium aktivace HSF1 pomocí fluorescenčních proteinů. – školitel BP: MUDr. Petr Müller, Ph.D.
• Bc. Kristýna Křišťanová (PřF MU) – téma DP: Analýza exozomů u pacientek s gynekologickými malignitami. – školitel DP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D.
• Natálie Kučerová (LF MU) – téma DP: Vývoj nových přístupů v diagnostice karcinomu jícnu. – školitel DP: Mgr. Barbora Vavrušáková 
• Bc. Marie Kundratová (PřF MU) – téma DP: Prevence toxicit imunoterapie a predikce odpovědi pacientů s triple-negativním karcinomem prsu pomocí imunitního profilování a MS fingerprintingu. – školitel DP: Mgr. Lukáš Moráň, Ph.D.
• Bc. Alica Záchejová (PřF MU) – téma DP: Úloha TUSC3 v imunitním dohledu a karcinogenezi - potenciální význam pro imunoterapii.– školitel DP: Mgr. Lukáš Moráň, Ph.D.
• Bc. Eliška Černá (VUT FEKT) – téma DP: Bioinformatická analýza diferenciální exprese u vybraných biologických vzorků. – školitel DP: Mgr. Bc. Filip Zavadil Kokáš, Ph.D. (obájeno 2025)
• Bc. Karolína Itterheimová (MU PřF) - téma DP: Vývoj a porovnání elektroanalytických a elektrochemiluminiscenčních technik pro detekci nádorových biomarkerů. – školitel DP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (obhájeno 2025)
• Bc. Kateřina Magerová (MU PřF) – téma DP: Využití izotermálních amplifikačních technik nukleových kyselin ve vývoji elektrochemických testů pro diagnostiku nádorů. – školitel DP: Mgr. Ludmila Moráňová, Ph.D. (obájeno 2025)
• Bc. Klára Mrázová (PřF MU) – téma DP: Bioanalýzy exozomů. – školitel DP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Bc. Ema Jochmanová (PřF MU) – téma DP: Analýza kvality biologického materiálu uloženého v Bance biologického materiálu MOÚ. – školitel DP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obájeno 2025)
• Bc. Lenka Krejčí (PřF MU) – téma DP: Role stresu endoplazmatického retikula v imunoeditaci u HER2+ karcinomu prsu. – školitel DP: Mgr. Lukáš Moráň, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Bc. Jitka Švandová (PřF MU) – téma DP: Příprava a testování efektivních buněčných modelových systémů pro studium úlohy AGR2 u vybraných lidských malignit. – školitel DP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Bc. Kateřina Ondrášková (PřF MU) – téma DP: Hybridní elektrochemicky aktivní organokovové sloučeniny vykazující protinádorové účinky. – školitel DP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2023)
• Bc. Kristýna Bednárová (FaCh VUT) – téma DP: Využití Hsp90 jako cíle biologické terapie nádorů. - školitel DP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2022)
• Bc. Daniel Nesrsta (PřF MU) – téma DP: Identifikace a evaluace potenciálních prognostických biomarkerů karcinomu endometria. – školitel DP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2021)
• Bc. Andrea Martišová (PřF MU) – téma DP: Analýza významu epigenetická regulace exprese AGR2 ve vztahu ke tvorbě metastáz u kolorektálního karcinomu. – školitel DP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2020)
• Bc. Iveta Klemešová (PřF MU) – téma DP: Identifikace determinant metastatického onemocnění u kolorektálního karcinomu. – školitel DP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2020)
• Bc. Michaela Sládková (PřF MU) – téma DP: Monoklonální B-lymfocytóza. – školitel: Mgr. Kateřina Pilátová, Ph.D. (obhájeno 2019)
• Bc. Václav Hrabal (PřF MU) – téma DP: Identifikace proteinů rodiny p53 a jejich komplexů v nádorových buňkách a v tkáni. – školitel DP: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Bc. Ondřej Vacek (PřF MU) – téma DP: Úloha extracelulárne lokalizovaného chaperonu Hsp90 u nádorových buněk. – školitel DP: Mgr. Michal Pastorek, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Bc. Oliver Šimončík (PřF MU) – téma DP: Regulace stresové odpovědi v nádorových buňkách. – školitel DP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2017)
• Bc. Eliška Stuchlíková (PřF MU) – téma DP: Profilování glykanových struktur izolovaných z buněčných linií odvozených od nádorů vaječníku. – školitel DP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2017)
• Bc. Lukáš Uhrík (PřF MU) – téma DP: Produkce rekombinantních enzymů a jejich využití při studiu strukturních změn proteinů. – školitel DP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2017)
• Bc. Diana Bartáková (PřF MU) – téma DP: Nové elektrochemické přístupy v molekulární onkologii. – školitel DP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Bc. David Dzurický (PřF MU) – téma DP: Studium chaperonových komplexů v nádorových buňkách. – školitel DP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2017)
• Bc. Veronika Martinková (PřF UPOl) – téma DP: Úloha heat-shock proteinu 70 v maligní transformaci a možnosti jeho inhibice. – školitel DP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Bc. Radka Černochová (PřF MU) – téma DP: Vliv deltaNp63alfa na vnitrobuněčný transport proteinů u buněk karcinomu prsu. – školitel: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Bc. Ludmila Jiráková (PřF MU) – téma DP: Příprava a charakterizace buněčných linií kolorektálního karcinomu se sníženou hladinou proteinu AGR2. – školitel DP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2017)
• Bc. Kateřina Ceralová (PřF MU) – téma DP: Charakterizace populace buněk s vysokou hladinou proteinu p63 v buněčných liniích odvozených od karcinomu prsu. – školitel DP: Mgr. Marta Nekulová, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Bc. Helena Ďuríková (PřF MU) – téma DP: Vývoj a otestování jednoduchého rychlého testu vhodného pro detekci HPV virů. – školitel DP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Bc. Hedvika Fraňková (PřF MU) – téma DP: Studium molekulárních mechanismů zodpovědných za karcinogenezi děložního hrdla. – školitel DP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Bc. Ladislava Bačíková (VŠ zdravotníctva a sociálnej práce Sv. Alzbety, SK) – téma DP: Algoritmy flowcytometrických vyšetření v hematologii a imunologii. – školitel DP: RNDr. Lenka Zdražilová Dubská, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Bc. Edita Zemanová (VŠ zdravotníctva a sociálnej práce  Sv. Alzbety, SK) – téma DP: Implementace farmakogenetického a farmakokinetického vyšetření k predikci toxicity spojené s podáním fluoropirimidinů do klinické praxe. – školitel DP: Mgr. Martina Mrkvicová, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Bc. Světlana Lučanová (PřF MU) – téma DP: Studium strukturních změn proteinů metodou H/D exchange spojenés hmotnostní spektrometrií a limitované proteolýzy. – školitel DP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Bc. Jana Matějíková (PřF MU) – téma DP: Bioelektroanalýza mikroRNA a DNA metylace a její aplikace v diagnostice nádorových onemocnění. – školitel DP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (ukončeno bez obhajoby)
• Bc. Karolína Zoufalová (PřF MU) – téma DP: Analýza prometastatických signálních drah u nádorů prsu. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Bc. Petra Kovaříková (PřF MU) – téma DP: Karboxypeptidáza B1 a jeji úloha v nádorové biologii. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2015)
• Bc. Michal Řiháček (PřF MU) – téma DP: Optimalizace a validace stanovení standardních hodnot homocysteinu, methotrexátu a folátu v mozkomíšním moku u onkologicky nemocných dětí, jako biomarkeru terapeutického efektu a toxicity methotrexátu podávaného systémově a intrathekálně. – školitel DP: doc. MUDr. Dalibor Valík, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Bc. Josef Maryáš (PřF MU) – téma DP: Funkční charakterizace prometastatických proteinů u karcinomů prsu. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Bc. Dominika Černá (Fa chem-tech, Univerzita Pardubice) – téma DP: Využití H/D výměny ke studiu strukturních změn proteinového komplexu TOMM34 a Hsp70/90. – školitel DP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Bc. Lucia Sommerová (PřF MU) – téma DP: Úloha proteinu AGR2 při epiteliálně-mezenchymální tranzici. – školitel DP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2014)
• Bc. Tereza Frostová (PřF MU) – téma DP: SELDI-TOF MS profilovaní patogenních bakterií se zaměřením na Enterobacteriaceae. – školitel DP: RNDr. Lenka Dubská, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Bc. Květa Pilařová (PřF MU) – téma DP: Studium úlohy proteinu AGR2 u buněčných linií odvozených od karcinomu slinivky břišní. – školitel DP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Bc. Vendula Pernikářová (PřF MU) – téma DP: Studium buněčného stresu u bakterií pomoci moderních metod kvantitativní proteomiky. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Bc. Iveta Hynštová (PřF MU) – téma DP: Studium mechanismů vedoucích k senescenci nádorové buňky: Úloha a funkce rodiny anterior gradient proteinů. – školitel DP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Bc. Tereza Nehybová (PřF MU) – téma DP: Analýza protinádorových účinků wedelolaktonu. – školitel DP: Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Bc. Gabriea Pavlasová  (PřF MU) – téma DP: Účinky metotrexátu na linie derivované ze solidních nádorů dětského věku. – školitel DP: RNDr. Jakub Neradil, Ph.D. (obhájeno 2013)
• Bc. Pavlína Holešínská (PřF MU) – téma DP: Transmembránové proteiny jako potenciální diagnostické a terapeutické cíle v onkologii. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (Obhájeno 2012)
• Bc. Zuzana Volejníková (FChT UPCE) – téma DP: Funkční vlastnosti krevních destiček u onkologických pacientů. – školitel DP: RNDr. Lenka Dubská, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Bc. Jakub Faktor (PřF MU) – téma DP: Nové kvantitativní proteomické přístupy v onkologickém výzkumu. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2012)
• Bc. Dominika Váňová (PřF MU) – téma DP: Proteinové markery metastatického potenciálu u karcinomu prsu a jejich exprese v závislosti na klinickopatologických charakteristikách. – školitel DP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2011)

• Ing. Tomáš Henek (PřF MU) – téma DisP: Aplikace proteogenomiky v analýze onkologických vzorků. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D.
• Mgr. Karolína Itterheimová (PřF MU) – téma DisP: Bioelektrochemie v molekulární onkologii. – školitel DisP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D.
• Mgr. Johana Strmisková (PřF MU) – téma DisP: Aplikace nádorových biomarkerů v diagnostice gynekologických prekanceróz. – školitel DisP: MUDr. Milan Anton, CSc., Odborný konzultant: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. 
• Mgr. Renata Bartošová (LF MU) – téma DisP: Nádorové mikroprostředí, imunitní dozor a karcinogeneze. – školitel DisP: doc. MUDr. Tomáš Kazda, Ph.D. 
• Mgr. Šárka Ševčíková (PřF MU) – téma DisP: Bioelektrochemie v molekulární onkologii. – školitel DisP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D.
• Mgr. Aneta Fried (PřF MU) – téma DisP: Vývoj bioelektrochemických metod pro detekci nádorových biomarkerů. – školitel DisP: Mgr. Ludmila Moráňová, Ph.D.
• Mgr. Tereza Šošolíková (PřF MU) – téma DisP: Studium interakcí AGR2 a dalších protein disulfid izomeráz v nádorových buňkách. – školitel DisP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D.
• Mgr. Kateřina Ondrášková (PřF MU) – téma DisP: Nádorová biologie. – školitel DisP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (ukončeno)
• Naina Verma, M.Sc. (PřF MU) – téma DisP: Porovnání konformačních změn spojených s holo- a apo- formou trombolytik. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D.
• Ing. Kristína Bednárová (PřF MU) – téma DisP: Mechanismy aktivace transkripčního faktoru HSF1 v nádorové buňce. – školitel DisP: MUDr. Petr Müller, Ph.D.
• Mgr. Barbora Vavrušáková (LF MU) – téma DisP: Vliv stresu ER na imunitní dohled v kancerogenezi. – školitel DisP: prof. MUDr. Marek Svoboda, Ph.D.
• Mgr. Miroslav Bardelčík (PřF MU) – téma DisP: Molekulární mechanismy regulace stresové odpovědi. – školitel DisP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2025)
• Mgr. Martina Kučeríková (PřF MU) – téma DisP: Mechanizmy nemutační inaktivace proteinu p53 v lidských nádorech. – školitel DisP: Mgr. Lucia Martinková, Ph.D.
• Ravery Jovinary Sebuyoya, MSc. (PřF MU) – téma DisP: Bioelektrochemie v molekulární onkologii. – školitel DisP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Mgr. Andrea Martišová (PřF MU) – téma DisP: Úloha RNA-protein interakcí při regulaci fundamentálních procesů v nádorové buňce. – školitel DisP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2024)
• Mgr. Adam Paulin Urminský (PřF MU) – téma DisP: Identifikace a kvantifikace N-glykoproteinů v sérech a tkáních pacientů s onkologickým onemocněním. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D.
• Mgr. Nela Friedlová (PřF MU) – téma DisP: Funkce transmembránových proteinů indukovaných interferonem v nádorových buňkách. – školitel DisP: Mgr. Marta Nekulová, Ph.D. (obhájeno 2025)
• Mgr. Václav Hrabal (PřF MU) – téma DisP: Studium interakcí proteinové rodiny p53 v normálních a nádorových buňkách. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc.
• Ashita Singh, M.Sc. (PřF MU) – téma DisP: Role of lithocholic acid-induced cell signalling in oesophageal cancer progression model. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2023)
• Mgr. Oliver Šimončík (PřF MU) – téma DisP: Regulace genové exprese během proteotoxického stresu. – školitel DisP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2025)
• Mgr. Radovan Krejčíř (PřF MU) – téma DisP: Studium molekulárních a funkčních mechanismů derivátů pentametiniových solí. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2022)
• Mgr. Petr Voňka (PřF UPOl) - téma DisP: Studium molekulárních mechanismů účinku vybraných steroidů v nádorových buňkách. – školitel DisP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2023)
• Mgr. Ludmila Moráňová (PřF MU) – téma DisP: Vývoj bioelektrochemických metod pro in vitro diagnostiku nádorových onemocnění. – školitel DisP: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. (obhájeno 2022)
• Mgr. Lukáš Uhrík (PřF MU) – téma DisP: Proteomická analýza molekulárních podtypů meduloblastomu: odhalení klinicky významných markerů. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2022)
• Mgr. Lenka Dosedělová (PřF MU) – téma DisP: Identifikace nových sekrečních drah řídících metastazování lidských nádorů. - školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (ukončeno)
• Mgr. Veronika Martinková (PřF MU) – téma DisP: Analýza proteotoxického stresu u nádorových buněk. – školitel DisP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (přerušeno)
• Mgr. Michaela Štencková (PřF MU) – téma DisP: Signalizace p63 v nádorech. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc.(obhájeno 2022)
• Mgr. Hana Skoupilová (PřF MU) – téma DisP: Stres endoplasmatického retikula a jeho úloha v nádorové buňce. – školitel DisP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2021)
• MUDr. Beatrix Bencsiková (LF MU) – téma DisP: Angiogeneze u zhoubných nádorů: stanovení prediktivních markerů u pacientů s kolorektálním karcinomem. – školitel DisP: prof. MUDr. Rostislav Vyzula, CSc. (obhájeno 2016)
• Mgr. Lucia Sommerová (PřF MU) – téma DisP: Úloha proteinů rodiny Anterior gradient v procesech EMT. – školitel DisP: doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2018)
• MUDr. Radka Obermannová – (LF MU) – téma DisP: Význam suplementace vitamínu D a vliv hladin metabolitu 25-OHD na dobu do progrese v rámci I. linie léčby metastatického karcinomu prsu, prostaty a kolorektálního karcinomu. – školitel DisP: doc. MUDr. Dalibor Valík, Ph.D. (obhájeno 2017)
• MUDr. Paval Krupa (LF MU) – téma DisP: Hypofrakcionace radioterapie u karcinomu prostaty. školitel DisP: prof. MUDr. Pavel Šlampa, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Mgr. Josef Maryáš (PřF MU) – téma DisP: Molekulární interakce v metastazování nádorů a jejich studium s využitím funkční proteomiky – školitel DisP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (ukončeno)
• Mgr. Dominika Coufalová (PřF MU) – téma DisP: Využití hmotnostní spektrometrie ke studiu strukturních změn onkoproteinů. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2020)
• MUDr. Ján Podhorec (LF MU) – téma DisP: Úloha proteinu AGR2 a jeho regulace ve vztahu k zánětlivým procesům. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (ukončeno)
• Mgr. Adam Krejčí (PřF MU) – téma DisP: Využití globální analýzy peptidových knihoven k hledání nových biomarkerů a protinádorových léčiv. – školitel DisP: MUDr. Petr Müller, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Mgr. Martina Zahradníková (PřF MU) – téma DisP: Studium exprese glykoproteinů na povrchu nádorové buňky. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (ukončeno)
• Mgr. Veronika Brychtová (LF MU) – téma DisP: Analýza role proteinů AGR2 a AGR3 v nádorové buňce a stanovení jejich exprese ve vybraných nádorových tkáních. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2014)
• Mgr. Lucie Kafková (LF MU) – téma DisP: Nádorové multiplicity – etiopatogeneze, diferenciální diagnostika a léčba. – školitel DisP: prof. MUDr. Rostislav Vyzula, CSc. (obhájeno 2016)
• Mgr. Filip Trčka (PřF MU) – téma DisP: Význam chaperonového systému pro nádorovou transformaci buňky. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2015)
• Mgr. Eva Růčková (PřF MU) – téma DisP: Úloha stresových proteinů při stabilizaci a degradaci proteinu p53 a jeho izoforem. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2014)
• Mgr. Marta Nekulová (PřF MU) – téma DisP: Úloha izoforem proteinu p63 v přeměně nádorové buňky. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2014)
• Mgr. Eva Matoulková (PřF MU) – téma DisP: Úloha exprese proteinů AGR2 a AGR3 v nádorové buňce jako odpověď na stres. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2017)
• Mgr. Monika Dvořáková (PřF MU) – téma DisP: Molekulární mechanismy metastazování: Integrované přístupy na bázi genomiky a proteomiky. – školitel DisP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Mgr. Iva Procházková (PřF MU) – téma DisP: Studium molekulárních regulačních mechanismů pomocí proteomických technik. – školitel DisP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2019)
• Mgr. Michal Ďurech (PřF MU) – téma DisP: Využití inhibice proteinů chaperonového systému pro terapii nádorových onemocnění. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2016)
• MUDr. Pavlína Vrtělová (LF MU) – téma DisP: Nežádoucí následky chirurgických výkonů na mízních uzlinách u pacientek s karcinomem prsu. – školitel DisP: doc. MUDr. Oldřich Coufal, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Mgr. Kateřina Pilátová (LF MU) – téma DisP: Využití proteomiky při studiu nádorové angiogeneze. – školitel DisP: doc. MUDr. Dalibor Valík, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Joanna Obacz, MSc. (PřF MU) – téma DisP: Studium funkce proteinu AGR3 a mechanismů zodpovědných za regulaci jeho exprese v nádorové buňce. – školitel DisP: Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (obhájeno 2016)
• Paulina Orzol, MSc. (PřF MU) – téma DisP: Protein p63 a jeho příspěvek k fenotypu kmenové nádorové buňky. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2016)
• Mgr. Mariana Pjechová (PřF MU) – téma DisP: Analýza nových imunomodulačních funkcí lidského cytomegaloviru (HCMV) a jejich vlivu na patogenezi proteomickými metodami a fágovým displayem. – školitel DisP: RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (obhájeno 2020)
• Mgr. Jakub Faktor (MU PřF) – téma DisP: Cílená proteomika – nový přístup ke kvantifikaci proteinů v nádorové biologii - školitel DisP: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (obhájeno 2018)
• Mgr. Michal Dřevínek (Univ Obrany, Fa Voj Zdrav) – téma DisP: Vužití hmotnostně spektrometrických metod k tvorbě databáze biologických agens kompatibilní s evropským datovým systémem. – školitel DisP: prof. Ing. Lenka Hernychová, Ph.D. (obhájeno 2012)

Adam Krejčí (RECAMO, Masarykův onkologický ústav, 2016)

Hammock is a tool for peptide sequence clustering. It is able to cluster extremely large amounts of short peptide sequences into groups sharing sequence motifs. Typical Hammock applications are NGS-based experiments using large combinatorial peptide libraries, e.g. Phage display.

Filip Zavadil-Kokáš (RECAMO, Masarykův onkologický ústav, 2018)

TransPEM (Software for Translation sequence into peptide based on mutation information) is a novel bioinformatics tool which was developed for providing mutated and wild type sequences based on bioinformatics analysis of single nucleotide polymorphisms. Protein sequences can serve as an input for proteomics analysis. This software provides fast and reliable extracting of coding sequences (CDS) from genome and their translation into proteins with respect to the information about mutations. It is suitable for any number of sequences and as an user-friendly software requires only the basic knowledge of a Linux operating system.

Iveta Selingerová, Marie Langrová (RECAMO)

Kernhaz je balíček vytvořený pro statistické výpočetní prostředí R, dostupný z oficiálního repozitáře CRAN. Tento balíček implementuje odhady rizikové funkce pro pravostranně cenzorovaná data. Tyto odhady jsou hladké funkce vytvořené pomocí jádrového vyhlazování. Riziko sledované události (úmrtí, relapsu,…) je odhadnuto v závislosti na čase, případně v závislosti na další sledované proměnné (věku, velikosti tumoru,…). Součástí balíčku jsou také dvě metody pro výběr vyhlazovacích parametrů.

Další infomace a soubory ke stažení najdete ZDE.

Iveta Selingerová (RECAMO, Ústav matematiky a statistiky, PřF MU)

Kernhaz for MATLAB je balíček M-funkcí vytvořený jako alternativa R balíčku kernhaz pro uživatele MATLABu. Tento balíček implementuje odhady rizikové funkce pro pravostranně cenzorovaná data. Tyto odhady jsou hladké funkce vytvořené pomocí jádrového vyhlazování. Riziko sledované události (úmrtí, relapsu,…) je odhadnuto v závislosti na čase, případně v závislosti na další sledované proměnné (věku, velikosti tumoru,…). Součástí balíčku jsou také dvě metody pro výběr vyhlazovacích parametrů.

Iveta Selingerová, Kateřina Pilátová, Michal Řiháček, Martina Mrkvicová, Lenka Zdražilová Dubská

Balíček výpočetních nástrojů vytvořených v prostředí MS Excel s využitím VBA. Nástroje jsou vytvořeny v souladu s doporučeními odborných společností (Česká společnost klinické biochemie, Česká hematologická společnost, SEKK) a mohou sloužit jako formuláře pro vyhodnocení nejistot či porovnatelnosti výsledků měření v klinických laboratořích. Součástí sady je také podrobný návod na vyplnění a ukázkové příklady použití. Nástroj pro hodnocení porovnatelnosti výsledků měření je zahrnut ve dvou variantách – pro 20 a 50 měřených hodnot.

Filip Zavadil Kokáš (RECAMO, Masarykův onkologický ústav, 2024)

PhAL (Phage Display Alignment software) is a novel bioinformatics tool which was developed for alignment of short sequences from phage display on the reference sequence of the protein which is intended as an target for antibody which is being investigated. Software uses algorithm of local alignment and provides template-based analysis of the phage display for antibodies. A text file containing short nucleotide sequences serves as input for the software. 

The nucleotide sequences are subsequently converted to peptide sequences and subsequently analyzed using local alignment to a reference protein sequence. The output is a text file with the protein sequence and the number of reads aligned for each amino acid. The maximum values ​​determine the antibody binding site.

​​

• Siegl F, Garcia-Borja E, Mateu R, Trachtova K, Jasik M, Kopecky M, Vecera M, Radova L, Hendrych M, Kazda T, Fadrus P, Sedo A, Slaby O, Busek P, Sana J. Differential Expression of PIWI-interacting RNAs in Glioblastoma Stem Cells Affects Their Biological Features: Implications for Tumor Progression and Patient Survival. Lab Invest. 2026 Jan 13:106072. doi: 10.1016/j.labinv.2026.106072. Epub ahead of print.
• Tylichova Z, Krkoska M, Hrabal V, Stenckova M, Vojtesek B, Coates PJ. Heterogeneity of glucose metabolism and uptake identifies distinct cancer cell and cancer stem cell phenotypes. Cell Mol Biol Lett. 2026 Jan 17;31(1):8. doi: 10.1186/s11658-025-00837-0.
• Tomášik R, Kussel T, Dudová Z, Kacová R, Hrstka R, Lablans M, Holub P. Privacy-preserving data quality assessment for federated health data networks. BMC Med Inform Decis Mak. 2026 Jan 27. doi: 10.1186/s12911-025-03328-6. Epub ahead of print. 
• Stojaspal M, Brom T, Nečasová I, Janovič T, Veverka P, Verma N, Uhrík L, Hernychova L, Hofr C. Anemia-associated mutations disrupt the CDIN1-Codanin1 complex in inherited congenital dyserythropoietic anemia I (CDA-I) disease. FEBS J. 2026 Jan 29. doi: 10.1111/febs.70421. Epub ahead of print.
• Ondraskova K, Cwik M, Horky O, Berkovcova J, Holcakova J, Bartosik M, Kazda T, Mrazova K, Uher M, Kiss I, Hrstka R. Detection of KRAS, NRAS and BRAF Mutations in Liquid Biopsy from Patients with Colorectal Cancer. Oncol Res  2026 Jan 19;34(2):12. doi: 10.32604/or.2025.070116.
• Ehret F, Williamson A, Kazda T, Seidel C. Treating brainstem metastases with stereotactic radiosurgery after whole-brain radiotherapy - Precision strike or risky gamble? Radiother Oncol. 2026 Aug 15:111099. doi: 10.1016/j.radonc.2025.111099. Epub ahead of print.
• Krejcir R, Arcimowicz L, Martinkova L, Hrabal V, Zavadil Kokas F, Henek T, Kucerikova M, Bonczek O, Zatloukalova P, Hernychova L, Coates PJ, Vojtesek B, Lane DP. CDK11 inhibition induces cytoplasmic p21WAF1 splice variant by p53 stabilisation and SF3B1 inactivation. Mol Oncol. 2025 Oct 17. doi: 10.1002/1878-0261.70143. Epub ahead of print. 
• Ráliš V, Dostálová K, Kubišta J, Gyepes R, Hamala  V, Hrstka R, Pinkas J. Ibuprofen-conjugated cyclopentadienyl–arene ruthenium complexes induce cytostatic effects and COX inhibition in colorectal cancer cells. Polyhedron. 2026;287:117954. doi: 10.1016/j.poly.2025.117954. 
• Brydon J, Krejcir R, Grima M, Zavadil-Kokas F, Kuncova Z, Sousan S, Pflughaupt RL, Thomson JR, Davies P, Senior E, Wood GA, Ball KL, Saliba D, Argyle DJ, Vojtesek B, Hupp T, Parys M. Towards Canine Immunotherapy Models: Monoclonal Antibodies with Redox Regulated Epitopes Targeting TIM3 Attenuate Galectin-9 Binding. Anal Biochem. 2026 Dec 15:717:116033. doi: 10.1016/j.ab.2025.116033. 
• Bilavčíková K, Vašinová Galiová M, Hrstka R, Hamala V, Karban J. Novel multimodal approach of LA-ISC-MS exploring innovative Ru-tetrazene: in situ tracking and bioimaging-guided cancer treatment. Anal Chim Acta. 2026;1383:344883. doi: 10.1016/j.aca.2025.344883. 

​​

• Pečinka L  Pantůčková J, Vlachová M, Moráň M, Růžičková T, Weselá P, Prokeš L, Havel J, Pour L, Ševčíková S, Vaňhara P. End-to-end workflows for liquid biopsy biotyping analysis using combined MALDI MS and machine learning approach. Anal Methods. 2025;17:9909-9914. doi: 10.1039/D5AY01299F. (IF2024: 2,7; Q3)
• Thermou A, Daskalogianni C, Wang L, Malbert-Colas L, Dinh VT, Lavigne M, Blondel M, Fahraeus R, Habault J. The codon context provides cis-acting immune evasion for the human papilloma virus (HPV) E6. RNA. 2025 Nov 17;31(12):1735-1748. doi: 10.1261/rna.080390.125. (IF2024: 5,0; Q1)
• Al-Radi O, Ingelshed K, Eichhorn L, Josefsson H, Krkoska M, Bräutigam L, Lindström S, Végvári Á, Kheder S, Cerrato CP, Fermé S, Bosdotter C, Allalou A, Levander F, Vojtesek B, Lane DP, Kannan P. Pharmacological activation of p53 induces dose-dependent changes in endothelial cell fate during angiogenic sprouting. Cell Death Dis. 2025 Dec 8;16(1):883. doi: 10.1038/s41419-025-08292-7. (IF2024: 9,6; Q1) 
• Kucerikova M, Bonczek O, Olivares-Illana V, Rodriguez-Rodriguez A, Sampedro JG, Hernychova L, Hrabal V, Zatloukalova P, Krejcir R, Fahraeus R, Coates PJ, Vojtesek B, Martinkova L. Reduced structural rigidity of MDMX protein enhances binding to TP53 mRNA. Biosci Rep. 2025 Nov 25;45(11):BSR20253646. doi: 10.1042/BSR20253646. (IF2024: 4,7; Q1)
• Hnidáková L, Pospíšil P, Garčic J, Grell P, Belanová R, Hynková L, Maistryszinová J, Bílek O, Turčáni P, Burkoň P, Slávik M, Šlampa P, Kazda T. Stereotaktická radioterapie (SIMT FSRT) mozkových metastáz u pacienta s ALK pozitivním adenokarcinomem plic. Klin Onkol 2025;38(5):398-400. doi: 10.48095/ccko2025398. (bez IF; Q4)
• Hnidakova L, Selingerova I, Pospisil P, Halamkova J, Belanova R, Nikl T, Sana J,  Vavrusakova B, Bartosova R, Slaby O, Slampa P, Jancalek R, Minniti G, Kazda T. Lymphopenia in glioblastoma and its association with brain vessel irradiation: pilot retrospective evaluation of dose-volume parameters. Neoplasma. 2025;72(5):371-378. doi:10.4149/neo_2025_250730N330. (IF2024: 2,2; Q4) 
• Hendrych M, Vana F, Hermanova M, Lakomy R, Kazda T, Matulova K, Kopkova A, Jelinkova M, Jancalek R, Smrcka M, Vybihal V, Sana J. PD-L1 Clones and Their Relevance in Glioblastoma, IDH-Wildtype: A Comparative Analysis. Bratisl Med J. 2025;126:2233-2240. doi: 10.1007/s44411-025-00245-y. (IF2025: 1,1; Q2) 
• Černocká H, Kasalová V, Tihlaříková E, Neděla V, Hrstka R, Ostatná V. Effects of Charged Surface on Electrochemical Sensitivity to Protein Dimerization. Anal Chem. 2025 Oct 31;97(44):24787-24794. doi: 10.1021/acs.analchem.5c05281. (IF2024: 6,7; Q1) 
• Izadi N, Fried A, Ševčíková Š, Strmisková J, Moráňová L, Campuzano S, Bartošík M. Electrochemical detection of fusion genes: Advancing cancer diagnosis and therapy. Electrochim Acta 2025;542:147472. doi: 10.1016/j.electacta.2025.147472. (IF2024: 5,6; Q1) 
• Gupta R, Leibman-Markus M, Anand G, Sela N, Zavadil-Kokáš F, Perničkoví K, Bryksová M, Plíhalová L, Plíhal O, Bar M. Cytokinin arabinosides show increased efficacy in priming tomato immunity and inhibiting the fungal phytopathogen B. cinerea. Plant stress. 2025;18:101055. doi: 10.1016/j.stress.2025.101055. (IF2024: 6,9; Q1) 
• Prokeš L, Pečinka L. Leveraging R for advanced interpretation of LDI-TOF mass spectra: a computational approach. Anal Methods 2025 Oct 15;41(17):8502. doi: 10.1039/d5ay01246e. (IF2024: 2,7; Q3) 
• Chen S, Wang L, Malbert-Colas L, Karakostis K, Olivares-Illana V, Vadivel Gnanasundram S, Fahraeus R. The p53 mRNA exhibits riboswitch-like features under DNA damage conditions. iScience. 2025 Sep 12;28(10):113555. doi: 10.1016/j.isci.2025.113555. (IF2024: 4,1; Q1)
• Kazda T, Hnidakova L, Minniti G. Reirradiation in recurrent glioblastoma. Curr Opin Oncol. 2025 Nov 1;37(6):580-588. doi: 10.1097/CCO.0000000000001192. (IF2024:2,4; Q3)
• Topa J, Richert J, Stokowy T, Staśczak A, Szajewski M, Ciesielski M, Grešner PM, Tomasik B, Arcimowicz Ł, Stankiewicz A, Suchodolska G, Senkus E, Kruszewski W, Żaczek AJ, Markiewicz A. Characterizing epithelial-mesenchymal transition-linked heterogeneity in breast cancer circulating tumor cells at a single-cell level. Mol Oncol. 2025 Dec;19(12):3685-3705. doi: 10.1002/1878-0261.70132. (IF2024: 4,5; Q2) 
• Tomasik R, Konar S, Eklund N, Engels C, Dudova Z, Kacova R, Hrstka R, Holub P. Definitions to data flow: Operationalizing MIABIS in HL7 FHIR. J Biomed Inform. 2025 Sep 27: 171:104919. doi: 10.1016/j.jbi.2025.104919. (IF2024: 4,5; Q2)
• Fried A, Strmisková J, Magerová K, Hendrych M, Bartošík M, Moráňová L. Vliv a stanovení lidského cytomegaloviru u onkologických onemocnění. Klin Onkol 2025; 38(4): 254-263. DOI: 10.48095/ccko2025254. (bez IF; Q4) 
• Vavrušáková B, Bartošová R, Svoboda M, Moráň L. Od tradiční čínské medicíny po molekulární onkologii – pleiotropní účinky tauroursodeoxycholové kyseliny.  Klin Onkol 2025; 38(4): 270-281. DOI: 10.48095/ccko2025270. (bez IF; Q4)
• Gu X, Coates PJ, Wang L, Gnanasundram SV, Sgaramella N, Attaran N, Erdogan B, Magan M, Nylander K. A Unique Plasma Protein Signature Characterizes Squamous Cell Carcinoma of the Oral Tongue in Young Adults. J Oral Pathol Med. 2025 Sep;54(8):706-714. doi: 10.1111/jop.70020. (IF2024: 2,3; Q2)
• Sajwan R, Wang L, Casar-Borota O, Karakostis K, Chen S, Fahraeus R, Gu X, Vadivel Gnanasundram S. A cancer-associated TP53 synonymous mutation induces synthesis of the p53 isoform p53/47. Br J Cancer. 2025 Oct;133(7):970-975. doi: 10.1038/s41416-025-03127-w. (IF2024: 6,8; Q1) 
• Rödl S, Hoffman Y, Jung F, Egeler A, Nutz A, Šimončík O, Jung M, Räschle M, Muller P, Storchova Z, Mühlhaus T, Herrmann JM. A protein-specific priority code in presequences determines the efficiency of mitochondrial protein import. PLoS Biol. 2025 Jul 21;23(7):e3003298. doi: 10.1371/journal.pbio.3003298. (IF2024: 7,2; Q1)
• Wang L, Sörensen K, Coates PJ, Gu X, Sgaramella N, Barre MM, Nylander K. Automated tumor-stroma ratio estimation for improved prognostic stratification of squamous cell carcinoma of the oral tongue. J Pathol Clin Res. 2025 Jul;11(4):e70036. doi: 10.1002/2056-4538.70036. (IF2024: 3,7; Q1)
• Krkoška M, Tylichová Z, Zatloukalová P, Müller P, Vojtěšek B, Coates PJ. Heterogeneous protein dynamics links to mitochondrial activity, glucose transporter, and ALDH cancer stem cell properties. BMC Cancer. 2025 Jul 1;25(1):1085. doi: 10.1186/s12885-025-14460-x. (IF2024: 3,9; Q1)
• Bardelcik M, Simoncik O, Bednarova K, Bonczek O, Vojtesek B, Muller P. SUMOylation is not a prerequisite for HSF1's role in stress protection and transactivation. Sci Rep. 2025 Jul 5;15(1):24077. doi: 10.1038/s41598-025-08735-3. (IF2024: 3,9; Q1) 
• Cerrato CP, Krkoška M, Sun Y, Liaño-Pons J, Neo QY, Vosselman T, Alzrigat M, Vojtěšek B, Lane DP, Arsenian Henriksson M, Miserez A, Landreh M. Engineered Peptide Coacervates Enable Efficient Intracellular Delivery of the MYC Inhibitor omoMYC. Mol Pharm. 2025 Apr 30;22(6):3479-3490. doi: 10.1021/acs.molpharmaceut.5c00468. (IF2024: 4,5; Q1)
• Friedlová N, Bortlíková L, Dosedělová L, Uhrík L, Hupp TR, Hernychová L, Vojtěšek B, Nekulová M. IFITM1 as a modulator of surfaceome dynamics and aggressive phenotype in cervical cancer cells. Oncol Rep. 2025 Jun;53(6):71. doi: 10.3892/or.2025.8904. (IF2024: 3,9; Q2)
• Fiser O, Muller P. Role of HSF1 in cell division, tumorigenesis and therapy: a literature review. Cell Div. 2025 Apr 26;20(1):11. doi: 10.1186/s13008-025-00153-1. (IF2024: 2,2; Q4)
• Kaynak A, Vallabhapurapu SD, Smith EP, Davis HW, Lewis CS, Ahn J, Muller P, Vojtesek B, Stringer KF, Franco RS, Bogdanov VY, Shao WH, Qi X. Targeting Hsp70 Immunosuppressive Signaling Axis with Lipid Nanovesicles: A Novel Approach to Treat Pancreatic Cancer. Cancers (Basel). 2025 Apr 4;17(7):1224. doi: 10.3390/cancers17071224. (IF2024: 4,4; Q2)
• Lisowska M, Worrall EG, Zavadil-Kokas F, Charlton K, Murray E, Mohtar MA, Krejcir R, Hrabal V, Brydon J, Urionabarrenetxea AG, Saliba DG, Grima M, Kalathiya U, Muller P, Krejci A, Vojtesek B, Ball KL, Fahraeus R, Argyle DJ, Parys M, Hupp TR. The development of a canine single-chain phage antibody library to isolate recombinant antibodies for use in translational cancer research. Cell Rep Methods. 2025 Mar 24;5(3):101008. doi: 10.1016/j.crmeth.2025.101008. (IF2024: 4,5; Q1)
• Hrstka R, Zavadil-Kokas F, Moukova L, Kolarova T, Shahidianakbar M, Anton M, Ovesna P, Munzova D, Bednarikova M, Bretova P, Minar L, Hausnerova J, Weinberger V. Genetic analysis of uterine lavage fluids to identify women at high risk of endometrial cancer. BMC Res Notes. 2025 Mar 18;18(1):117. doi: 10.1186/s13104-025-07173-8. (IF2024: 1,7; Q2)
• Kacová R, Houfek T, Horký O, Kuráň J, Tomášik R, Růžička M, Hrstka R, Nováček V, Dudová Z. Integration, Cataloguing and Management of Biobanking and Clinical Data Using FAIR Genomes Metadata Schema. Data Intelligence. 2025;7(1):163-184. doi: 10.3724/2096-7004.di.2025.0005. (IF2024: 1,9; Q3)
• Zavadil F, Henek T, Habault J, Chemali R, Tovar-Fernandez MC, Daskalogianni C, Malbert-Colas L, Wang L, Gnanasundram SV, Vojtesek B, Hernychova L, Apcher S, Fahraeus R. Translation of bi-directional transcripts enhances MHC-I peptide diversity. Front Immunol. 16:1554561. doi: 10.3389/fimmu.2025.1554561. (IF2024: 5,9; Q1)  
• Way L, Hernychova L, Vialaret J, Ruidong L, Vojtesek B, Hupp T, Mannaa AM. Monitoring Changes in the Levels of Newly Synthesized Proteins in Response to Nutlin-3 Treatment. Proteomics. 2025 Apr;25(8):e202400333. doi: 10.1002/pmic.202400333. (IF2024: 3,9; Q1)   
• Sebuyoya R, Sevcikova S, Yusuf B, Bartosik M. Integrating isothermal amplification techniques and LNA-based AI-assisted electrochemical bioassay for analysis of KRAS G12V point mutation. Talanta. 2025 Feb 7;288:127709. doi: 10.1016/j.talanta.2025.127709. (IF2024: 6,1; Q1)
• Acimovic I, Gabrielová V, Martínková S, Eid M, Vlažný J, Moravčík P, Hlavsa J, Moráň L, Cakmakci RC, Staňo P, Procházka V, Kala Z, Trnka J, Vaňhara P. Ex-Vivo 3D Cellular Models of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: From Embryonic Development to Precision Oncology. Pancreas. 2025 Jan 1;54(1):e57-e71. doi: 10.1097/MPA.0000000000002393.(IF2024: 1,7; Q3)
• Kaynak A, Vallabhapurapu SD, Davis HW, Smith EP, Muller P, Vojtesek B, Franco RS, Shao WH, Qi X. TLR2-Bound Cancer-Secreted Hsp70 Induces MerTK-Mediated Immunosuppression and Tumorigenesis in Solid Tumors. Cancers (Basel). 2025 Jan 28;17(3):450. doi: 10.3390/cancers17030450. (IF2024: 4,4; Q2)
• Růžičková T, Vlachová M, Pečinka L, Brychtová M, Večeřa M, Radová L, Ševčíková S, Jarošová M, Havel J, Pour L, Ševčíková S. Detection of early relapse in multiple myeloma patients. Cell Div. 2025 Jan 29;20(1):4. doi: 10.1186/s13008-025-00143-3. (IF2024: 2,2; Q4)
• Moranova L, Strmiskova J, Ondraskova K, Bardelcik M, Cwik M, Kiss I, Hrstka R, Bartosik M. Electrochemical Detection of BRAF V600E Mutation in a Liquid Biopsy Format: LAMPing the Way to an Improved Diagnostics and Treatment. Adv Mater Technol. 2025;10(7):2401404. doi: 10.1002/admt.202401404. (IF2024: 6,2; Q2)
• Zapletal O, Žatecký J, Gabrielová L, Selingerová I, Holánek M, Burkoň P, Coufal O. Axillary Overtreatment in Patients with Breast Cancer After Neoadjuvant Chemotherapy in the Current Era of Targeted Axillary Dissection. Cancers. 2025 Jan 8;17:178. doi: 10.3390/cancers17020178. (IF2024: 4,4; Q2)
• Burkon P, Selingerova I, Vrzal M, Holanek M, Coufal O, Polachova K, Andraskova V, Jhawar SR, Slampa P, Kazda T, Slavik M. Quality of life in early breast cancer patients after adjuvant accelerated partial-breast irradiation (APBI) in randomized trial. Sci Rep. 2025 Jan 9;15(1):1387. doi: 10.1038/s41598-025-85342-2. (IF2024: 3,9; Q1)
• Izadi N, Solár P, Hašanová K, Zamani A, Akbar MS, Mrázová K, Bartošík M, Kazda T, Hrstka R, Joukal M. Breaking boundaries: role of the brain barriers in metastatic process. Fluids Barriers CNS. 2025 Jan 8;22(1):3. doi: 10.1186/s12987-025-00618-z. (IF2024: 6,2; Q1)  
• Staroňová T, Holčáková J, Voňka P, Hrstka R, Ostatná V. Impact of galectin-1's redox state on its lectin activity and monomer-dimer equilibrium. Focusing on oxidized Gal-1. Int J Biol Macromol. 2025 Jan 2:295:139452. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.139452. (IF2023: 8,5; Q1)
• Capandova M, Sedlakova V, Vorac Z, Kotasova H, Dumkova J, Moran L, Jaros J, Antol M, Bohaciakova D, Hampl A. Using Polycaprolactone Nanofibers for the Proof-of-Concept Construction of the Alveolar-Capillary Interface. J Biomed Mater Res A. 2025 Jan;113(1):e37824. doi: 10.1002/jbm.a.37824. (IF2023: 3,9; Q2)

• Bílek O, Selingerová I, Kysela M, Jedlička V, Kazda T, Berkovcová J, Turčáni P, Poprach A, Kiss I, Svoboda M, Zdražilová Dubská L. Aktuální klinické charakteristiky a léčebné postupy karcinomu plic v onkologickém centru v České republice z reálné praxe – data z registru Masarykova onkologického ústavu z let 2018–2022. Klin Onkol 2024;37(6):433-444. doi: 10.48095/ccko2024433. (IF2023: bez IF; Q4)
• Chalova P, Jankovicova B, Dvorakova V, Zelinkova E, Bilkova Z, Slovakova M, Korecka L, Muller P, Danchenko M, Minichova L, Lakota J, Skultety L. Inhibitory Effect of Human Anti-CA I Autoantibodies and Development of Monoclonal Antibody mAb 2B8 Targeting Carbonic Anhydrase I. Mediators Inflamm. 2024 Dec 30;2024:9981131. doi: 10.1155/mi/9981131. 
• Borilova S, Grell P, Selingerova I, Gescheidtova L, Mlnarikova M, Bilek O, Lakomy R, Poprach A, Podhorec J, Kiss I, Vyzula R, Vavrusakova B, Nevrlka J, Zdrazilova-Dubska L. Early changes of peripheral circulating immune subsets induced by PD-1 inhibitors in patients with advanced malignant melanoma and non-small cell lung cancer. BMC Cancer. 2024 Dec 30;24(1):1590. doi: 10.1186/s12885-024-13351-x. 
• Moranova L, Strmiskova J, Ondraskova K, Bardelcik M, Cwik M, Kiss I, Hrstka R, Bartosik M. Electrochemical Detection of BRAF V600E Mutation in a Liquid Biopsy Format: LAMPing the Way to an Improved Diagnostics and Treatment. Adv Mater Technol. 2024;2401404. doi: 10.1002/admt.202401404. epub (IF2023: 6,4; Q1) 
• Pawlicka K, Henek T, Uhrik L, Hernychova L, Padariya M, Faktor J, Makowiec S, Vojtesek B, Goodlett D, Hupp T, Kalathiya U. Misincorporations of amino acids in p53 in human cells at artificially constructed termination codons in the presence of the aminoglycoside Gentamicin. Front Genet. 2024 Nov 5;15:1407375. doi: 10.3389/fgene.2024.1407375. (IF2023: 2,8; Q2) 
• Hrabal V, Stenckova M, Zavadil Kokas F, Muller P, Nenutil R, Vojtesek B, Coates PJ. TAp73 and ΔTAp73 isoforms show cell-type specific distributions and alterations in cancer. Sci Rep. 2024 Dec 2;14(1):29949. doi: 10.1038/s41598-024-80927-9. (IF2023: 3,8; Q1) 
• Simoncik O, Tichy V, Durech M, Hernychova L, Trcka F, Uhrik L, Bardelcik M, Coates PJ, Vojtesek B, Muller P. Direct activation of HSF1 by macromolecular crowding and misfolded proteins. PLoS One. 2024 Nov 4;19(11):e0312524. doi: 10.1371/journal.pone.0312524. (IF2023: 2,9; Q1)
• Capandova M, Sedlakova V, Vorac Z, Kotasova H, Dumkova J, Moran L, Jaros J, Antol M, Bohaciakova D, Hampl A. Using Polycaprolactone Nanofibers for the Proof-of-Concept Construction of the Alveolar-Capillary Interface. J Biomed Mater Res A. 2024 Oct 30. doi: 10.1002/jbm.a.37824. Epub ahead of print. (IF2023: 3,9 ; Q2)
• Deulofeu M, Peña-Méndez EM, Vaňhara P, Havel J, Moráň L, Pečinka L, Bagó-Mas A, Verdú E, Salvadó V, Boadas-Vaello P. Discriminating fingerprints of chronic neuropathic pain following spinal cord injury using artificial neural networks and mass spectrometry analysis of female mice serum. Neurochem Int. 2024 Oct 23;181:105890. doi: 10.1016/j.neuint.2024.105890. (IF2023: 4,4 ; Q1)
• López I, Valdivia IL, Vojtesek B, Fåhraeus R, Coates PJ. Re-appraising the evidence for the source, regulation and function of p53-family isoforms. Nucleic Acids Res. 2024 Oct 15:gkae855. doi: 10.1093/nar/gkae855. Epub ahead of print. (IF2023: 16,6; Q1)
• ​​​​​​Izadi N, Strmiskova J, Anton M, Hausnerova J, Bartosik M. LAMP-based electrochemical platform for monitoring HPV genome integration at the mRNA level associated with higher risk of cervical cancer progression. J Med Virol. 2024 Oct;96(10):e70008. doi: 10.1002/jmv.70008. (IF2023: 6,8; Q1)
• Attaran N, Coates PJ, Zborayova K, Sgaramella N, Nylander K, Gu X. Upregulation of Apoptosis Related Genes in Clinically Normal Tongue Contralateral to Squamous Cell Carcinoma of the Oral Tongue, an Effort to Maintain Tissue Homeostasis. Head Neck Pathol. 2024 Sep 30;18(1):89. doi: 10.1007/s12105-024-01695-6. (IF2023; 3,2; Q2)
• Hamala V, Kurfiřt M, Červenková Šťastná L, Hujerová H, Bernášková J, Parkan K, Kaminský J, Habanová N, Kozák J, Magdolenová A, Zavřel M, Staroňová T, Ostatná V, Žaloudková L, Daňhel A, Holčáková J, Voňka P, Hrstka R, Karban J. Ferrocene- and ruthenium arene-containing glycomimetics as selective inhibitors of human galectin-1 and -3. Inorg Chem Front 2024;11:7588. doi: 10.1039/d4qi01555j. (IF2023: 6,1; Q1) 
• Martisova A, Faktor J, Sosolikova T, Klemesova I, Kolarova T, Holcakova J, Hrstka R. Characterization of the AGR2-NPM3 axis uncovers the AGR2 involvement in PD-L1 regulation in colorectal cancer. Sci Rep. 2024 Sep 20;14(1):21926. doi: 10.1038/s41598-024-72990-z. (IF2023: 3,8; Q1)
• Švajdová M, Dubinský P, Jeremić B, Vojtek V, Barilíková G, Selingerová I, Kazda T. Trends in the treatment of human papillomavirus-associated oropharyngeal carcinoma in Slovakia. Neoplasma. 2024 Aug;71(4):402-413. doi: 10.4149/neo_2024_240306N96. (IF2023: 2,0; Q3) 
• Šimčíková D, Gardáš D, Pelikán T, Moráň L, Hruda M, Hložková K, Pivetta T, Hendrych M, Starková J, Rob L, Vaňhara P, Heneberg P. Metabolism of primary high-grade serous ovarian carcinoma (HGSOC) cells under limited glutamine or glucose availability. Cancer Metab. 2024 Sep 16;12(1):27. doi: 10.1186/s40170-024-00355-1. (IF2023: 6,0; Q1)
• Martinkova L, Zatloukalova P, Kucerikova M, Friedlova N, Tylichova Z, Zavadil-Kokas F, Hupp TR, Coates PJ, Vojtesek B. Inverse correlation between TP53 gene status and PD-L1 protein levels in a melanoma cell model depends on an IRF1/SOX10 regulatory axis. Cell Mol Biol Lett. 2024 Sep 5;29(1):117. doi: 10.1186/s11658-024-00637-y. (IF2023: 9,2; Q1)
• Vana F, Szabo Z, Masarik M, Kratochvilova M. The interplay of transition metals in ferroptosis and pyroptosis. Cell Div. 2024 Aug 3;19(1):24. doi: 10.1186/s13008-024-00127-9. (IF2023: 2,8; Q3)
• Vlachová M, Pečinka L, Gregorová J, Moráň L, Růžičková T, Kovačovicová P, Almáši M, Pour L, Štork M, Hájek R, Jelínek T, Popková T, Večeřa M, Havel J, Vaňhara P, Ševčíková S. Liquid biopsy of peripheral blood using mass spectrometry detects primary extramedullary disease in multiple myeloma patients. Sci Rep. 2024 Aug 13;14(1):18777. doi: 10.1038/s41598-024-69408-1. (IF2023: 3,8; Q1) 
• Karakostis K, Padariya M, Thermou A, Fåhraeus R, Kalathiya U, Vollrath F. Thermal stress, p53 structures and learning from elephants. Cell Death Discov. 2024 Aug 7;10(1):353. doi: 10.1038/s41420-024-02109-w. (IF2024: 6,1; Q1)
• Faktor J, Henek T, Hernychova L, Singh A, Vojtesek B, Polom J, Bhatia R, Polom K, Cuschieri K, Cruickshank M, Gurumurthy M, Goodlett DR, Al Shboul S, Samal SK, Hupp T, Kalampokas E, Kote S. Metaproteomic analysis from cervical biopsies and cytologies identifies proteinaceous biomarkers representing both human and microbial species. Talanta. 2024 Jun 22;278:126460. doi: 10.1016/j.talanta.2024.126460. (IF2023: 5,6; Q1)
• Nguyen DT, Zavadil Kokáš F, Gonin M, Lavarenne J, Colin M, Gantet P, Bergougnoux V. Transcriptional changes during crown-root development and emergence in barley (Hordeum vulgare L.). BMC Plant Biol. 2024 May 22;24(1):438. doi: 10.1186/s12870-024-05160-y. (IF2023: 4,3; Q1)
• Preusser M, Kazda T, Le Rhun E, Sahm F, Smits M, Gempt J, Koekkoek JA, Monti AF, Csanadi M, Pitter JG, Bulbek H, Fournier B, Quoilin C, Gorlia T, Weller M, Minniti G; European Organisation for Research, Treatment of Cancer (EORTC) Brain Tumor Group. Lomustine with or without reirradiation for first progression of glioblastoma, LEGATO, EORTC-2227-BTG: study protocol for a randomized phase III study. Trials. 2024 Jun 7;25(1):366. doi: 10.1186/s13063-024-08213-7. (IF2023: 2,1; Q3) 
• Lakomý R, Lojová M, Souckova L, Hynkova L, Polachova K, Vasina J, Demlová R, Poprach A, Sana J, Prochazka T, Smrcka M, Fadrus P, Jancalek R, Selingerova I, Belanova R, Slampa P, Pospisil P, Kazda T. 11C-methionine in the diagnostics and management of glioblastoma patients with rapid early progression: nonrandomized, open label, prospective clinical trial (GlioMET). BMC Cancer. 2024 Jun 15;24(1):736. doi: 10.1186/s12885-024-12469-2. (IF2023: 3,4; Q2) 
• Kocikowski M, Dziubek K, We˛grzyn K, Hrabal V, Zavadil-Kokas F, Vojtesek B, Alfaro JA, Hupp T, Parys M. Comparative characterization of two monoclonal antibodies targeting canine PD-1. Front. Immunol. 2024;15:1382576. doi: 10.3389/fimmu.2024.1382576.  (IF2023 5,7; Q1) 
• Pečinka L, Moráň L, Kovačovicová P, Meloni F, Havel J, Pivetta T, Vaňhara P. Intact cell mass spectrometry coupled with machine learning reveals minute changes induced by single gene silencing. Heliyon. 2024 Apr 22;10(9):e29936. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e29936. (IF2023: 3,4; Q1) 
• Buosi S, Timilsina M, Torrente M, Provencio M, Fey D, Nováček V. Boosting predictive models and augmenting patient data with relevant genomic and pathway information. Comput Biol Med. 2024 May;174:108398. doi: 10.1016/j.compbiomed.2024.108398. (IF2023; 7,0; Q1) 
• Holikova K, Selingerova I, Pospisil P, Bulik M, Hynkova L, Kolouskova I, Hnidakova L, Burkon P, Slavik M, Sana J, Holecek T, Vanicek J, Slampa P, Jancalek R, Kazda T. Hippocampal subfield volumetric changes after radiotherapy for brain metastases. Neurooncol Adv. 2024 Mar 20;6(1):vdae040. doi: 10.1093/noajnl/vdae040. (IF2023: 3,5; Q3)
• Fadrus J, Vybíhal V, Roskova I, Selingerová I, Smrcka M, Jancalek R, Šána J, Slabý O, Pospíšil P, Hynková L, Garčic J, Belanová R, Křístek J, Sprlakova-Pukova A, Mackerle Z, Juran V, Sova M, Neuman E, Valekova H, Lakomý R, Holánek M, Hrstka R, Svajdova M, Poláchová K, Kolouskova I, Šlampa P, Kazda T. Adjuvant radiotherapy after brain metastasectomy: analysis of consecutive cohort of 118 patients from real world practice. Rep Pract Oncol Radiother. 2024, 29(1), 30-41. doi: 10.5603/rpor.99362. (IF2023: 1,2; Q3) 
• Pokorná Z, Tylichová Z, Vojtesek B, Coates PJ. Complex and variable regulation of ΔNp63 and TAp63 by TGFβ has implications for the dynamics of squamous cell epithelial to mesenchymal transition. Sci Rep. 2024 Mar 27;14(1):7304. doi: 10.1038/s41598-024-57895-1. (IF2023: 3,8; Q1)
• Novotný K, Krempl I, Pečinka L, Moráň L, Vaňhara P, Havel J. Pulsed laser ablation synthesis of fresh Te nanoparticles for matrix assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS) applications. Talanta. 2024 Apr 5;274:126061. doi: 10.1016/j.talanta.2024.126061. (IF2023: 5,6; Q1) 
• O'Neill JR, Yébenes Mayordomo M, Mitulović G, Al Shboul S, Bedran G, Faktor J, Hernychova L, Uhrik L, Gomez-Herranz M, Kocikowski M, Save V, Vojtěšek B, Arends M; OCCAMS consortium; Hupp T, Alfaro J. Multi-omic analysis of Esophageal Adenocarcinoma uncovers candidate therapeutic targets and cancer-selective post-transcriptional regulation. Mol Cell Proteomics. 2024 Jun;23(6):100764. doi: 10.1016/j.mcpro.2024.100764. (IF2023: 6,1; Q1) 
• Selingerova I, Holikova K, Chodur T, Hynkova L, Pospisil P, Bulik M, Belanova R, Siffelova K, Kolouskova I, Slavik M, Burkon P, Hrstka R, Jancalek R, Sana J, Slampa P, Kazda T. Challenges with hippocampal MR spectroscopy as a surrogate for pre-radiotherapy assessment of neurocognitive impairment in patients with brain metastasis. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub. 2024 Apr 15. doi: 10.5507/bp.2024.012. Epub ahead of print. (IF2023: 0,7; Q4)  
• Padariya M, Vojtesek B, Hupp T, Kalathiya U. In Vitro Cross-Linking MS Reveals SMG1–UPF2–SMG7 Assembly as Molecular Partners within the NMD Surveillance. Int J Mol Sci. 2024;25:3182. doi: 10.3390/ijms25063182. (IF2023: 4,9; Q1) 
• Bielcikova Z, Holanek M, Selingerova I, Sorejs O, Kolarova I, Soumarova R, Proks J, Reifova L, Cmejlova V, Linkova L, Zabojnikova M, Chodacka M, Janovska L, Lisnerova L, Kasparova K, Pohankova D, Petruzelka L. Treatment and Prognosis of Male Breast Cancer: A Multicentric, Retrospective Study Over 11 Years in the Czech Republic. Oncologist. 2024 Jun 3;29(6):e750-e762. doi: 10.1093/oncolo/oyae031. (IF2023: 4,8; Q1)
• Hamala V, Ondrášková K, Červenková Šťastná L, Krčil A, Müllerová M, Kurfiřt M, Hiršová K, Holčáková J, Gyepes R, Císařová I, Bernášková J, Hrstka R, Karban J. Improving the anticancer activity of fluorinated glucosamine and galactosamine analogs by attachment of a ferrocene or ruthenium tetrazene motif. Appl Organomet Chem. 2024;38(5):e7399. doi: 10.1002/aoc.7399. (IF2023: 3,7; Q2)
• Salehi AM, Wang L, Gu X, Coates PJ, Norberg Spaak L, Sgaramella N, Nylander K. Patients with oral tongue squamous cell carcinoma and co‑existing diabetes exhibit lower recurrence rates and improved survival: Implications for treatment. Oncol Lett. 2024 Feb 6;27(4):142. doi: 10.3892/ol.2024.14275. (IF2023: 2,5; Q3)
• Nekulová M, Wyszkowska M, Friedlová N, Uhrík L, Zavadil Kokáš F, Hrabal V, Hernychová L, Vojtěšek B, Hupp TR, Szymański MR. Biochemical evidence for conformational variants in the anti-viral and pro-metastatic protein IFITM1. Biol Chem. 2024 Feb 22;405(5):311-324. doi: 10.1515/hsz-2023-0327. (IF2023: 2,9; Q3)
• Povedano E, Ruiz-Valdepeñas Montiel V, Sebuyoya R, Torrente-Rodríguez RM, Garranzo-Asensio M, Montero-Calle A, Pingarrón JM, Barderas R, Bartosik M, Campuzano S. Bringing to Light the Importance of the miRNA Methylome in Colorectal Cancer Prognosis Through Electrochemical Bioplatforms. Anal Chem. 2024 Feb 13;96(11):4580–4588. doi: 10.1021/acs.analchem.3c05474. (IF2023: 6,7; Q1)
• Burkon P, Selingerova I, Slavik M, Holanek M, Vrzal M, Coufal O, Polachova K, Muller P, Slampa P, Kazda T. Toxicity of external beam accelerated partial-breast irradiation (APBI) in adjuvant therapy of early-stage breast cancer: prospective randomized study. Radiat Oncol. 2024 Feb 3;19(1):17. doi: 10.1186/s13014-024-02412-x. (IF2023: 3,3; Q1)
• Peterka O, Maccelli A, Jirásko R, Vaňková Z, Idkowiak J, Hrstka R, Wolrab D, Holčapek M. HILIC/MS quantitation of low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum: Dysregulation in pancreatic cancer. Anal Chim Acta. 2024 Feb 1;1288:342144. doi: 10.1016/j.aca.2023.342144. (IF2023: 5,7; Q1)
• Karakostis K, Malbert‑Colas L, Thermou A, Vojtesek B, Fåhraeus R. The DNA damage sensor ATM kinase interacts with the p53 mRNA and guides the DNA damage response pathway. Mol Cancer. 2024 Jan 23;23(1):21. doi: 10.1186/s12943-024-01933-z. (IF2023: 27,7; Q1)
• Bartosik M, Moranova L, Izadi N, Strmiskova J, Sebuyoya R, Holcakova J, Hrstka R. Advanced technologies towards improved HPV diagnostics. J Med Virol. 2024 Feb;96(2):e29409. doi: 10.1002/jmv.29409. (IF2023: 6,8; Q1) 
• Benesova I, Nenutil R, Urminsky A, Lattova E, Uhrik L, Grell P, Kokas FZ, Halamkova J, Zdrahal Z, Vojtesek B, Novotny MV, Hernychova L. N-glycan profiling of tissue samples to aid breast cancer subtyping. Sci Rep. 2024 Jan 3;14(1):320. doi: 10.1038/s41598-023-51021-3. (IF2023: 3,8; Q1)  
• Buosi S, Timilsina M, Janik A, Costabello L, Torrente M, Provencio M, Fey D, Nováček V. Machine learning estimated probability of relapse in early-stage non-small-cell lung cancer patients with aneuploidy imputation scores and knowledge graph embeddings. Expert Syst Appl. 2024;235(January 2024):121127. doi: 10.1016/j.eswa.2023.121127. (IF2023: 7,5; Q1)
• Fåhraeus R. Has translation in the nucleus found its purpose? Nat Rev Mol Cell Biol. 2024 Jan;25(1):1-2. doi: 10.1038/s41580-023-00651-6. (IF2023: 81,3; Q1)

• Dostálová A, Vlachová M, Gregorová J, Moráň L, Pečinka L, Gabrielová V, Vaňhara P, Ševčíková S. Nový cíl specifické protinádorové léčby mnohočetného myelomu – endoplazmatické retikulum a jeho signální dráhy. Klin Onkol. 2023;36(6):440-446. doi: 10.48095/ccko2023440. (bez IF; Q4)
• Forejt M, Pokorová K, Uher M, Novák J, Čermáková E. Changes in Segmental Impedances and Selected Body Composition Parameters Assessed by Multi-Frequency Bioimpedance Analysis after Fluid Consumption in Healthy Young Population. Int J Med Sci. 2023 Nov 7;20(13):1783-1790. doi: 10.7150/ijms.77396. (IF2022: 3,6; Q2) 
• Stenckova M, Liu Y, Nekulova M, Holcakova J, Pokorna Z, Nenutil R, Thompson AM, Vojtesek B, Coates PJ. ΔNp63 is regulated by insulin/IGF-1 signaling in normal basal/progenitor mammary cells and in luminal-type breast cancer cells. Neoplasma. 2023 Oct;70(5):621-632. doi: 10.4149/neo_2023_230719N376. (IF2022: 3,0; Q3)
• Moráňová L, Bartošík M, Strmisková J, Nováková K. Elektrochemická analýza klinických vzorků – cesta k translačnímu výzkumu. Chem. Listy 2023;117(10):595-603. doi: 10.54779/chl20230595. (IF2022: 0,6; Q4)
• Pečinka L, Vlachová M, Moráň L, Gregorová J, Porokh V, Kovačovicová P, Almáši M, Pour L, Štork M, Havel J, Ševčíková S, Vaňhara P. Improved Screening of Monoclonal Gammopathy Patients by MALDI-TOF Mass Spectrometry. J Am Soc Mass Spectrom. 2023 Dec 6;34(12):2646-2653. doi: 10.1021/jasms.3c00166. (IF2022: 3,2; Q2)
• Masuri S, Cabiddu, MG, Moran L, Vesselá T, Bartosik M, Havel J, Meloni F, Cadoni E, Vanhara P, Pivetta T. Ternary copper(ii) complexes of 1,10-phenanthroline and coumarin-based oxylacetates as pro-apoptotic UPR CHOP inducers. New J Chem. 2023;47:15125-15136. doi: 10.1039/D3NJ01317K. (IF2022: 3,3; Q2) 
• Jones JL, Poulsom R, Coates PJ. Recent Advances in Pathology: the 2023 Annual Review Issue of The Journal of Pathology. J Pathol. 2023 Aug;260(5):495-497. doi: 10.1002/path.6192. (IF2022: 7,3; Q1) 
• Toul M, Slonkova V, Mican J, Urminsky A, Tomkova M, Sedlak E, Bednar D, Damborsky J, Hernychova L, Prokop Z. Identification, characterization, and engineering of glycosylation in thrombolytics. Biotechnol Adv. 2023 Sep;66:108174. doi: 10.1016/j.biotechadv.2023.108174. (IF2022: 16,0; Q1) 
• Timilsina M, Fey D, Buosi S, Janik A, Costabello L, Carcereny E, Abreu DR, Cobo M, Castro RL, Bernabé R, Minervini P, Torrente M, Provencio M, Nováček V. Synergy between imputed genetic pathway and clinical information for predicting recurrence in early stage non-small cell lung cancer. J Biomed Inform. 2023 Aug;144:104424. doi: 10.1016/j.jbi.2023.104424. (IF2022: 4,5; Q2) 
• Zelina P, Halamkova J, Novacek V. Extraction, labelling, clustering, and semantic mapping of segments from clinical notes. IEEE Trans Nanobioscience. 2023 Oct;22(4):781-788. doi: 10.1109/TNB.2023.3275195. (IF2022: 3,9; Q2) 
• Lapcik P, Sulc P, Janacova L, Jilkova K, Potesil D, Bouchalova P, Müller P, Bouchal P. Desmocollin-1 is associated with pro-metastatic phenotype of luminal A breast cancer cells and is modulated by parthenolide. Cell Mol Biol Lett. 2023 Aug 24;28(1):68. doi: 10.1186/s11658-023-00481-6. (IF2022: 8,300; Q1) 
• Sebuyoya R, Valverde A, Moranova L, Strmiskova J, Hrstka R, Ruiz-Valdepeñas Montiel V, Pingarrón JM, Barderas R, Campuzano S, Bartosik M. Dual detection system for cancer-associated point mutations assisted by a multiplexed LNA-based amperometric bioplatform coupled with rolling circle amplification. Sens Actuators B Chem. 2023; 394:134375. doi: 10.1016/j.snb.2023.134375. (IF2022: 8,4; Q1) 
• Vonka P, Rarova L, Bazgier V, Tichy V, Kolarova T, Holcakova J, Berka K, Kvasnica M, Oklestkova J, Kudova E, Strnad M, Hrstka R. Small Change - Big Consequence: The Impact of C15-C16 Double Bond in a D‑ring of Estrone on Estrogen Receptor Activity. J Steroid Biochem Mol Biol. 2023;233:106365. doi: 10.1016/j.jsbmb.2023.106365. (IF2022: 4,1; Q2) 
• Janik A, Torrente M, Costabello L, Calvo V, Walsh B, Camps C, Mohamed SK, Ortega AL, Nováček V, Massutí B, Minervini P, Campelo MRG, Del Barco E, Bosch-Barrera J, Menasalvas E, Timilsina M, Provencio M. Machine Learning-Assisted Recurrence Prediction for Patients With Early-Stage Non-Small-Cell Lung Cancer. JCO Clin Cancer Inform. 2023 Jul;7:e2200062. doi: 10.1200/CCI.22.00062. (IF2022: 4,2; Q2)
• Gu X, Salehi A, Wang L, Coates PJ, Sgaramella N, Nylander K. Early detection of squamous cell carcinoma of the oral tongue using multidimensional plasma protein analysis and interpretable machine learning. J Oral Pathol Med. 2023 Aug;52(7):637-643. doi: 10.1111/jop.13461. (IF2022: 3,3; Q2) 
• Masuri S, Moráň L, Vesselá T, Cadoni E, Cabiddu MG, Pečinka L, Gabrielová V, Meloni F, Havel J, Vaňhara P, Pivetta T. A novel heteroleptic Cu(II)-phenanthroline-UDCA complex as lipoxygenase inhibitor and ER-stress inducer in cancer cell lines. J Inorg Biochem. 2023 Sep;246:112301. doi: 10.1016/j.jinorgbio.2023.112301. (IF2022: 3,9; Q1)
• Musilova P, Kadlcikova D, Hradska H, Vozdova M, Selingerova I, Cernohorska H, Salat D, Rubes J. Chromosome damage in regions with different levels of air pollution. Environ Mol Mutagen. 2023 Jul;64(6):326-334. doi: 10.1002/em.22562. (IF2022: 2,8; Q3)
• Nemergut M, Marques SM, Uhrik L, Vanova T, Nezvedova M, Gadara DC, Jha D, Tulis J, Novakova V, Planas-Iglesias J, Kunka A, Legrand A, Hribkova H, Pospisilova V, Sedmik J, Raska J, Prokop Z, Damborsky J, Bohaciakova D, Spacil Z, Hernychova L, Bednar D, Marek M. Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer's Disease drug candidate. Mol Neurodegener. 2023 Jun 6;18(1):38. doi: 10.1186/s13024-023-00620-9. (IF2022: 15,1; Q1)
• Apcher S, Vojtesek B, Fahraeus R. In search of the cell biology for self- versus non-self- recognition. Curr Opin Immunol. 2023 May 19;83:102334. doi: 10.1016/j.coi.2023.102334. (IF2022: 7,0; Q1)
• Valková N, Kratochvilová L, Martinková L, Brázda V. Dual mode of IFI16 binding to supercoiled and linear DNA: A closer insight. Biochem Biophys Res Commun. 2023 May 15;667:89-94. doi: 10.1016/j.bbrc.2023.05.049. (IF2022: 3,1; Q2)
• Uhrik L, Henek T, Planas-Iglesias J, Kucera J, Damborsky J, Marek M, Hernychova L. Study of Protein Conformational Dynamics Using Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry. In: Sousa, Â., Passarinha, L. (eds) Advanced Methods in Structural Biology. Methods Mol Biol. 2023;2652:293-318. doi: 10.1007/978-1-0716-3147-8_18. Humana, New York, NY. Online ISBN 978-1-0716-3147-8. (bez IF; Q3) (kapitola v knize)
• Mulholland C, Jestřábová I, Sett A, Ondruš M, Sýkorová V, Manzanares CL, Šimončík O, Muller P, Hocek M. The selection of a hydrophobic 7-phenylbutyl-7-deazaadenine-modified DNA aptamer with high binding affinity for the Heat Shock Protein 70. Commun Chem. 2023 Apr 6;6(1):65. doi: 10.1038/s42004-023-00862-0. (IF2022: 5,9; Q2)
• Grell P, Borilova S, Fabian P, Selingerova I, Novak D, Muller P, Kiss I, Vyzula R. FoxP3 Expression in Tumor-Infiltrating Lymphocytes as Potential Predictor of Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Patients with Advanced Melanoma and Non-Small Cell Lung Cancer. Cancers 2023;15(6):1901. doi: 10.3390/cancers15061901. (IF2022: 5,2; Q2) 
• Lerma Clavero A, Boqvist PL, Ingelshed K, Bosdotter C, Sedimbi S, Jiang L, Wermeling F, Vojtesek B, Lane DP, Kannan P. MDM2 inhibitors, nutlin-3a and navtemadelin, retain efficacy in human and mouse cancer cells cultured in hypoxia. Sci Rep. 2023 Mar 20;13(1):4583. doi: 10.1038/s41598-023-31484-0. (IF2022: 4,6; Q2) 
• Deulofeu M, Peña-Méndez EM, Vaňhara P, Havel J, Moráň L, Pečinka L, Bagó-Mas A, Verdú E, Salvadó V, Boadas-Vaello P. Artificial Neural Networks Coupled with MALDI-TOF MS Serum Fingerprinting To Classify and Diagnose Pathological Pain Subtypes in Preclinical Models. ACS Chem Neurosci. 2023 Jan 18;14(2):300-311. doi: 10.1021/acschemneuro.2c00665. (IF2022: 5,0; Q2)
• Halámková J, Bohovicová L, Pehalová L, Kazda T, Goněc R, Staněk T, Mouková L, Adámková Krákorová D, Kozáková Š, Svoboda M, Demlová R, Gabrielová L, Hernychová L, Kiss I. The risk of second primary malignancies in colorectal cancer patients using calcium channel blockers. Sci Rep. 2023 Mar 1;13(1):3490. doi: 10.1038/s41598-023-29535-7. (IF2022: 4,6; Q2)  
• Fusée L, Salomao N, Ponnuswamy A, Wang L, López I, Chen S, Gu X, Polyzoidis S, Vadivel Gnanasundram S, Fahraeus R. The p53 endoplasmic reticulum stress-response pathway evolved in humans but not in mice via PERK-regulated p53 mRNA structures. Cell Death Differ. 2023 Apr;30(4):1072-1081. doi: 10.1038/s41418-023-01127-y. (IF2022: 12,4; Q1)
• Idkowiak J, Jirásko R, Kolářová D, Bártl J, Hájek T, Antonelli M, Vaňková Z, Wolrab D, Hrstka R, Študentová H, Melichar B, Pešková K, Holčapek M. Robust and high-throughput lipidomic quantitation of human blood samples using flow injection analysis with tandem mass spectrometry for clinical use. Anal Bioanal Chem. 2023 Feb;415(5):935-951. doi: 10.1007/s00216-022-04490-w. (IF2022: 4,3; Q1)
• Gu X, Wang L, Coates PJ, Gnanasundram SV, Sgaramella N, Sörlin J, Erdogan B, Magan M, Nylander K. Evidence for etiologic field changes in tongue distant from tumor in patients with squamous cell carcinoma of the oral tongue. J Pathol. 2023 Jan;259(1):93-102. doi: 10.1002/path.6025. (IF2022: 7,3; Q1)
• Janacova L, Stenckova M, Lapcik P, Hrachovinova S, Bouchalova P, Potesil D, Hrstka R, Müller P, Bouchal P. Catechol-O-methyl transferase suppresses cell invasion and interplays with MET signaling in estrogen dependent breast cancer. Sci Rep. 2023 Jan 23;13(1):1285. doi: 10.1038/s41598-023-28078-1. (IF2022: 4,6; Q2)
• Ondraskova K, Sebuyoya R, Moranova L, Holcakova J, Vonka P, Hrstka R, Bartosik M. Electrochemical biosensors for analysis of DNA point mutations in cancer research. Anal Bioanal Chem. 2023 Mar;415(6):1065-1085. doi: 10.1007/s00216-022-04388-7.  (IF2022: 4,3; Q1)
• Salomao N, Maslah N, Giulianelli A, Drevon L, Aguinaga L, Gu X, Cassinat B, Giraudier S, Fenaux P, Fahraeus R. Reduced murine double minute 2 and 4 protein, but not messenger RNA, expression is associated with more severe disease in myelodysplastic syndromes and acute myeloblastic leukaemia. Br J Haematol. 2023 Apr;201(2):234-248. doi: 10.1111/bjh.18608. (IF2022: 6,5; Q1)
• Chevet E, Bassal F, Beq S, Bonhomme B, Boisteau E, Calloch J, Cazals-Hatem D, Delom F, Fessart D, Evrard S, Hrstka R, Hupp T, Lièvre A, Louis E, Mariau J, Meuwis MA, Ogier-Denis E, Paradis V, Pernot S, Pineau R, Treton X, Velasco V, Vieujean S. AGR2 protein expression in colorectal tumour epithelialcompartment. Gut. 2023;72(12):2385-2386. doi: 10.1136/gutjnl-2022-328739. (IF2022: 24,5; Q1)
• Timilsina M, Buosi S, Fey D, Janik A, Torrente M, Provencio M, Bermu Dez AC, Carcereny E, Costabello L, Abreu DRI, Cobo M, Castro RLP, Bernabe R, Guirado DM, Minervini P, Nova Cˇek VI. Integration of Clinical Information and Imputed Aneuploidy Scores to Enhance Relapse Prediction in Early Stage Lung Cancer Patients. AMIA Annu Symp Proc. 2023 Apr 29;2022:1062-1071. (článek ve sborníku)
• Bartáková A, Koloušková I, Holánek M, Selingerová I, Stračina T, Kazda T, Nováková M. Kardiovaskulární farmakoterapie u pacientek s triple negativním karcinomem prsu před a po léčbě antracykliny. In: Klin Onkol 2023;36(Suppl 1):S123-S126: XLVII. Brněnské onkologické dny, XXXVII. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky Laboratorní diagnostika v onkologii 2023, 01.-03.11.2023, Brno, Česká republika. (článek ve sborníku)

• Lisowska M, Lickiss F, Gil-Mir M, Huart AS, Trybala Z, Way L, Hernychova L, Krejci A, Muller P, Krejcir R, Zhukow I, Jurczak P, Rodziewicz-Motowidło S, Ball K, Vojtesek B, Hupp T, Kalathiya U. Next-generation sequencing of a combinatorial peptide phage library screened against ubiquitin identifies peptide aptamers that can inhibit the in vitro ubiquitin transfer cascade. Front Microbiol. 2022 Dec 2;13:875556. doi: 10.3389/fmicb.2022.875556. (IF2021: 6,064; Q1)
• Minoli L, Licenziato L, Kocikowski M, Cino M, Dziubek K, Iussich S, Fanelli A, Morello E, Martano M, Hupp T, Vojtesek B, Parys M, Aresu L. Development of Monoclonal Antibodies Targeting Canine PD-L1 and PD-1 and Their Clinical Relevance in Canine Apocrine Gland Anal Sac Adenocarcinoma. Cancers (Basel). 2022 Dec 14;14(24):6188. doi: 10.3390/cancers14246188. (IF2021: 6,575; Q1)
• Friedlová N, Zavadil Kokáš F, Hupp TR, Vojtěšek B, Nekulová M. IFITM protein regulation and functions: Far beyond the fight against viruses. Front Immunol. 2022 Nov 18;13:1042368. doi: 10.3389/fimmu.2022.1042368. (IF2021: 8,787; Q1)
• Singh A, Padariya M, Faktor J, Kote S, Mikac S, Dziadosz A, Lam TW, Brydon J, Wear MA, Ball KL, Hupp T, Sznarkowska A, Vojtesek B, Kalathiya U. Identification of novel interferon responsive protein partners of human leukocyte antigen A (HLA-A) using cross-linking mass spectrometry (CLMS) approach. Sci Rep. 2022 Nov 12;12(1):19422. doi: 10.1038/s41598-022-21393-z. (IF2021: 4,997; Q1)
• Angrand G, Quillévéré A, Loaëc N, Dinh VT, Le Sénéchal R, Chennoufi R, Duchambon P, Keruzoré M, Martins RP, Teulade-Fichou MP, Fåhraeus R, Blondel M. Type I arginine methyltransferases are intervention points to unveil the oncogenic Epstein-Barr virus to the immune system. Nucleic Acids Res. 2022 Nov 11;50(20):11799-11819. doi: 10.1093/nar/gkac915. (IF2021: 19,160; Q1)
• Timilsina M, Tandan M, Nováček V. Machine learning approaches for predicting the onset time of the adverse drug events in oncology. Machine Learn Appl 2022;9:100367. (bez IF)
• Timilsina M, Nováček V, d'Aquin M, Yang H. Boundary heat diffusion classifier for a semi-supervised learning in a multilayer network embedding. Neural Netw. 2022 Oct 13;156:205-217. doi: 10.1016/j.neunet.2022.10.005. (IF2021: 9,657; Q1)
• Attaran N, Coates PJ, Zborayova K, Erdogan B, Magan M, Sgaramella N, Nylander K, Gu X. Antigen peptide transporters are upregulated in squamous cell carcinoma of the oral tongue and show sex-specific associations with survival. Oncol Lett. 2022 Sep 21;24(5):390. doi: 10.3892/ol.2022.13510. (IF2021: 3,111; Q3)
• Salehi A, Wang L, Coates PJ, Norberg Spaak L, Gu X, Sgaramella N, Nylander K. Reiterative modeling of combined transcriptomic and proteomic features refines and improves the prediction of early recurrence in squamous cell carcinoma of head and neck. Comput Biol Med. 2022 Oct;149:105991. doi: 10.1016/j.compbiomed.2022.105991. (IF2021: 6,698; Q1)
• Martisova A, Sommerova L, Krejci A, Selingerova I, Kolarova T, Zavadil Kokas F, Holanek M, Podhorec J, Kazda T, Hrstka R. Identification of AGR2 Gene-Specific Expression Patterns Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition. Int J Mol Sci. 2022 Sep 16;23(18):10845. doi: 10.3390/ijms231810845. (IF2021: 6,208; Q2)
• Slavik H, Balik V, Kokas Zavadil F, Slavkovsky R, Vrbkova J, Rehulkova A, Lausova T, Ehrmann J, Gurska S, Uberall I, Hajduch M, Srovnal J. Transcriptomic Profiling Revealed Lnc-GOLGA6A-1 as a Novel Prognostic Biomarker of Meningioma Recurrence. Neurosurgery. 2022 Aug 1;91(2):360-369. doi: 10.1227/neu.0000000000002026. (IF2021: 5,315; Q1)
• Boisteau E, Posseme C, Di Modugno F, Edeline J, Coulouarn C, Hrstka R, Martisova A, Delom F, Treton X, Eriksson LA, Chevet E, Lièvre A, Ogier-Denis E. Anterior gradient proteins in gastrointestinal cancers: from cell biology to pathophysiology. Oncogene. 2022 Sep 6. doi: 10.1038/s41388-022-02452-1. Epub ahead of print. (IF2021: 8,756; Q1)
• Zheng AJL, Thermou A, Daskalogianni C, Malbert-Colas L, Karakostis K, Le Sénéchal R, Trang Dinh V, Tovar Fernandez MC, Apcher S, Chen S, Blondel M, Fahraeus R. The nascent polypeptide-associated complex (NAC) controls translation initiation in cis by recruiting nucleolin to the encoding mRNA. Nucleic Acids Res. 2022 Sep 23;50(17):10110-10122. doi: 10.1093/nar/gkac751. (IF2021; 16,971; Q1)
• Sebuyoya R, Moranova L, Izadi N, Moran L, Hrstka R, Anton M, Bartosik M. Electrochemical DNA biosensor coupled to LAMP reaction for early diagnostics of cervical precancerous lesions. Biosens Bioelectron X 2022;12:100224. doi: 10.1016/j.biosx.2022.100224.
• Bielik P, Bonczek O, Krejčí P, Zeman T, Izakovičová-Hollá L, Šoukalová J, Vaněk J, Vojtěšek B, Lochman J, Balcar VJ, Šerý O. WNT10A variants: following the pattern of inheritance in tooth agenesis and self-reported family history of cancer. Clin Oral Investig. 2022 Aug 24. doi: 10.1007/s00784-022-04664-x. Epub ahead of print. (IF2021: 3,608; Q1)
• Kotasová H, Capandová M, Pelková V, Dumková J, Koledová Z, Remšík J, Souček K, Garlíková Z, Sedláková V, Rabata A, Vaňhara P, Moráň L, Pečinka L, Porokh V, Kučírek M, Streit L, Havel J, Hampl A. Expandable Lung Epithelium Differentiated from Human Embryonic Stem Cells. Tissue Eng Regen Med. 2022 Oct;19(5):1033-1050. doi: 10.1007/s13770-022-00458-0. (IF2021: 4,451; Q1)
• Bonczek O, Wang L, Gnanasundram SV, Chen S, Haronikova L, Zavadil-Kokas F, Vojtesek B. DNA and RNA Binding Proteins: From Motifs to Roles in Cancer. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(16):9329. doi: 10.3390/ijms23169329. (IF2021: 6,208; Q1)
• Gómez-Herranz M, Faktor J, Yébenes Mayordomo M, Pilch M, Nekulova M, Hernychova L, Ball KL, Vojtesek B, Hupp TR, Kote S. Emergent Role of IFITM1/3 towards Splicing Factor (SRSF1) and Antigen-Presenting Molecule (HLA-B) in Cervical Cancer. Biomolecules. 2022;12(8):1090. doi: 10.3390/biom12081090. (IF2021: 6,064; Q2)
• Stenckova M, Nenutil R, Vojtesek B, Coates PJ. Stat3 Tyrosine 705 and Serine 727 Phosphorylation Associate With Clinicopathological Characteristics and Distinct Tumor Cell Phenotypes in Triple-Negative Breast Cancer. Pathol. Oncol. Res. 2022;28:1610592. doi: 10.3389/pore.2022.1610592. (IF2021: 2,874; Q2)
• Pokorna Z, Hrabal V, Tichy V, Vojtesek B, Coates PJ. DNA Demethylation Switches Oncogenic ΔNp63 to Tumor Suppressive TAp63 in Squamous Cell Carcinoma. Front Oncol. 2022 Jul 14;12:924354. doi: 10.3389/fonc.2022.924354. (IF2021: 5,738; Q2)
• Padariya M, Jooste ML, Hupp T, Fåhraeus R, Vojtesek B, Vollrath F, Kalathiya U, Karakostis K. The Elephant Evolved p53 Isoforms that Escape MDM2-Mediated Repression and Cancer. Mol Biol Evol. 2022 Jul 2;39(7):msac149. doi: 10.1093/molbev/msac149. (IF2021: 8,800; Q1)
• Herrington CS, Poulsom R, Pillay N, Bankhead P, Coates PJ. Recent Advances in Pathology: the 2022 Annual Review Issue of The Journal of Pathology. J Pathol. 2022 Jul;257(4):379-382. doi: 10.1002/path.5972. (IF2021: 9,883; Q1)
• Holanek M, Selingerova I, Fabian P, Coufal O, Zapletal O, Petrakova K, Kazda T, Hrstka R, Poprach A, Zvarikova M, Bilek O, Svoboda M. Biomarker Dynamics and Long-Term Treatment Outcomes in Breast Cancer Patients with Residual Cancer Burden after Neoadjuvant Therapy. Diagnostics (Basel). 2022 Jul 18;12(7):1740. doi: 10.3390/diagnostics12071740. (IF2021: 3,992; Q1)
• Calderon-González KG, Medina-Medina I, Haronikova L, Hernychova L, Bonczek O, Uhrik L, Hrabal V, Vojtesek B, Fahraeus R, Hernández-Monge J, Olivares-Illana V. Cryptic in vitro ubiquitin ligase activity of HDMX towards p53 is probably regulated by an induced fit mechanism. Biosci Rep. 2022 Jul 29;42(7):BSR20220186. doi: 10.1042/BSR20220186. (IF2021: 3,976; Q3)
• Benešová I, Paulin Urminský A, Halámková J, Hernychová L. Změny N-glykosylací na sérových proteinech při nádorových onemocněních. Klin Onkol 2022;35(3):174-180. doi: 10.48095/ccko2022174. (bez IF; Q4)
• Tovar Fernandez MC, Sroka EM, Lavigne M, Thermou A, Daskalogianni C, Manoury B, Prado Martins R, Fahraeus R. Substrate-specific presentation of MHC class I-restricted antigens via autophagy pathway. Cell Immunol. 2022 Feb 17;374:104484. doi: 10.1016/j.cellimm.2022.104484. (IF2021: 4,178; Q2)
• Kaldmäe M, Vosselman T, Zhong X, Lama D, Chen G, Saluri M, Kronqvist N, Siau JW, Ng AS, Ghadessy FJ, Sabatier P, Vojtesek B, Sarr M, Sahin C, Österlund N, Ilag LL, Väänänen VA, Sedimbi S, Arsenian-Henriksson M, Zubarev RA, Nilsson L, Koeck PJB, Rising A, Abelein A, Fritz N, Johansson J, Lane DP, Landreh M. A "spindle and thread" mechanism unblocks p53 translation by modulating N-terminal disorder. Structure. 2022 May 5;30(5):733-742.e7. doi: 10.1016/j.str.2022.02.013. (IF2021: 5,871; Q1)
• Pokorna Z, Vyslouzil J, Vojtesek B, Coates PJ. Identifying pathways regulating the oncogenic p53 family member ΔNp63 provides therapeutic avenues for squamous cell carcinoma. Cell Mol Biol Lett. 2022 Feb 23;27(1):18. doi: 10.1186/s11658-022-00323-x. (IF2021: 8,702; Q2)
• Mandal G, Moráň L, Pečinka L, Vaňhara P, Havel J. Matrix enrichment by black phosphorus improves ionization and reproducibility of mass spectrometry of intact cells, peptides, and amino acids. Sci Rep. 2022 Jan 21;12(1):1175. doi: 10.1038/s41598-022-05197-9. (IF2021: 4,996; Q1) 
• Zheng AJ, Thermou A, Guixens Gallardo P, Malbert-Colas L, Daskalogianni C, Vaudiau N, Brohagen P, Granzhan A, Blondel M, Teulade-Fichou MP, Martins RP, Fahraeus R. The different activities of RNA G-quadruplex structures are controlled by flanking sequences. Life Sci Alliance. 2021 Nov 16;5(2):e202101232. doi: 10.26508/lsa.202101232.  (IF2021: 5,781; Q1) 
• Masuri S, Vaňhara P, Cabiddu MG, Moráň L, Havel J, Cadoni E, Pivetta T. Copper(II) Phenanthroline-Based Complexes as Potential AntiCancer Drugs: A Walkthrough on the Mechanisms of Action. Molecules. 2022;27(1):49. doi: 10.3390/molecules27010049. (IF2021: 4,927; Q2) 
• Bouchalova, P., Sommerova, L., Potesil, D., Martisova, A., Lapcik, P., Koci, V., Scherl, A., Vonka, P., Planas-Iglesias, J., Chevet, E., Bouchal, P., Hrstka, R. Characterization of the AGR2 interactome uncovers new players of Protein Disulfide Isomerase network in cancer cells. Mol Cell Proteomics 2022:21(2):100188. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100188. (IF2021: 7,381; Q1)
• Chmielewska AM, Gómez-Herranz M, Gach P, Nekulova M, Bagnucka MA, Lipińska AD, Rychłowski M, Hoffmann W, Król E, Vojtesek B, Sloan RD, Bieńkowska-Szewczyk K, Hupp T, Ball K. The Role of IFITM Proteins in Tick-Borne Encephalitis Virus Infection. J Virol. 2022 Jan 12;96(1):e0113021. doi: 10.1128/JVI.01130-21. (IF2021: 6,549; Q1)
• Karagiannakos A, Adamaki M, Tsintarakis A, Vojtesek B, Fåhraeus R, Zoumpourlis V, Karakostis K. Targeting Oncogenic Pathways in the Era of Personalized Oncology: A Systemic Analysis Reveals Highly Mutated Signaling Pathways in Cancer Patients and Potential Therapeutic Targets. Cancers (Basel). 2022 Jan 28;14(3):664. doi: 10.3390/cancers14030664. (IF2021: 6,575; Q1)
• Obermannova R, Selingerova I, Rehak Z, Jedlicka V, Slavik M, Fabian P, Novotny I, Zemanova M, Studentova H, Grell P, Zdrazilova Dubska L, Demlova R, Harustiak T, Hejnova R, Kiss I, Vyzula R. PET/CT-tailored treatment of locally advanced oesophago-gastric junction adenocarcinoma: a report on the feasibility of the multicenter GastroPET study. Ther Adv Med Oncol. 2022 Jan 5;13:17588359211065153. doi: 10.1177/17588359211065153. (IF2021: 5,485; Q2)
• Hernychova L, Alexandri E, Tzakos AG, Zatloukalová M, Primikyri A, Gerothanassis IP, Uhrik L, Šebela M, Kopečný D, Jedinák L, Vacek J. Serum albumin as a primary non-covalent binding protein for nitro-oleic acid. Int J Biol Macromol 2022;203:116-129. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2022.01.050. (IF2021: 8,025; Q1)
• Wolrab D, Jirásko R, Cífková E, Höring M, Mei D, Chocholoušková M, Peterka O, Idkowiak J, Hrnčiarová T, Kuchař L, Ahrends R, Brumarová R, Friedecký D, Vivo-Truyols G, Škrha P, Škrha J, Kučera R, Melichar B, Liebisch G, Burkhardt R, Wenk MR, Cazenave-Gassiot A, Karásek P, Novotný I, Greplová K, Hrstka R, Holčapek M. Lipidomic profiling of human serum enables detection of pancreatic cancer. Nat Commun. 2022 Jan 10;13(1):124. doi: 10.1038/s41467-021-27765-9. (IF2021: 17,694; Q1) 
• Apcher, S., Tovar-Fernadez, M., Ducellier, S., Thermou, A., Nascimento, M., Sroka, E., Fahraeus, R. mRNA translation from an antigen presentation perspective: A tribute to the works of Nilabh Shastri. Mol Immunol 2022;141:305-308. doi: 10.1016/j.molimm.2021.12.010. (IF2021: 4,174; Q2) 
• Moranova, L., Stanik, M., Hrstka, R., Campuzano, S., Bartosik, M. Electrochemical LAMP-based assay for detection of RNA biomarkers in prostate cancer. Talanta. 2022 Feb 1;238(Pt 2):123064. doi: 10.1016/j.talanta.2021.123064. (IF2021: 6,556; Q1) 

• Holcakova, J., Bartosik, M., Anton, M., Minar, L., Hausnerova, J., Bednarikova, M., Weinberger, V., Hrstka, R. New Trends in the Detection of Gynecological Precancerous Lesions and Early-Stage Cancers. Cancers (Basel) 2021;13(24):6339. doi: 10.3390/cancers13246339. (IF2020: 6,639; Q1)
• Bouchalova, P., Sommerova, L., Potesil, D., Martisova, A., Lapcik, P., Koci, V., Scherl, A., Vonka, P., Planas-Iglesias, J., Chevet, E., Bouchal, P., Hrstka, R. Characterization of the AGR2 interactome uncovers new players of Protein Disulfide Isomerase network in cancer cells. Mol Cell Proteomics 2021:100188. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100188. Epub ahead of print. (IF2020: 5,911; Q1)
• Borsky, M., Hrabcakova, V., Novotna, J., Brychtova, Y., Doubek, M., Panovska, A., Muller, P., Mayer, J., Trbusek, M., Mraz, M. Rituximab induces rapid blood repopulation by CLL cells mediated through their release from immune niches and complement exhaustion. Leuk Res 2021;111:106684. doi: 10.1016/j.leukres.2021.106684. (IF2020: 3,15; Q2)
• Haronikova, L., Bonczek, O., Zatloukalova, P., Kokas-Zavadil, F., Kucerikova, M., Coates, P. J., Fahraeus, R., Vojtesek, B. Resistance mechanisms to inhibitors of p53-MDM2 interactions in cancer therapy: can we overcome them? Cell Mol Biol Lett 2021;26(1):53. doi: 10.1186/s11658-021-00293-6. (IF2020: 5,787; Q1)
• Zheng, A. J-L., Thermou, A., Guixens Gallardo, P., Malbert-Colas, L., Deskalogianni, C., Vaudiau, N., Brohagen, P., Granzhan, A., Blondel, M., Teulade-Fichou, M-P., Prado Martins, R., Fahraeus, R. The different activities of RNA G-quadruplex structures are controlled by flanking sequences. Life Sci Alliance 2021;5(2):e2021101232. (IF2020: 4,591; Q1)
• Izadi, N., Sebuyoya, R., Moranova, L., Hrstka, R., Anton, M., Bartosik, M. Electrochemical bioassay coupled to LAMP reaction for determination of high-risk HPV infection in crude lysates. Anal Chim Acta 2021;1187:339145. doi: 10.1016/j.aca.2021.339145. (IF2020: 6,558; Q1)
• Zwinsová, B., Petrov, V. A., Hrivňáková, M., Smatana, S., Micenková, L., Kazdová, N., Popovici, V., Hrstka, R., Šefr, R., Bencsiková, B., Zdražilová-Dubská, L., Brychtová, V., Nenutil, R., Vídeňská, P., Budinská, E. Colorectal Tumour Mucosa Microbiome Is Enriched in Oral Pathogens and Defines Three Subtypes That Correlate with Markers of Tumour Progression. Cancers (Basel) 2021;13(19):4799. doi: 10.3390/cancers13194799. (IF2020: 6,639; Q1)
• Al Shboul, S., Curran, O. E., Alfaro, J. A., Lickiss, F., Nita, E., Kowalski, J., Naji, F., Nenutil, R., Ball, K. L., Krejcir, R., Vojtesek, B., Hupp, T. R., Brennan, P. M. Kinomics platform using GBM tissue identifies BTK as being associated with higher patient survival. Life Sci Alliance 2021;4(12):e202101054. doi: 10.26508/lsa.202101054. (IF2020: 4,591; Q1)
• Chmielewska, A. M., Gómez-Herranz, M., Gach, P., Nekulova, M., Tyrakowska, M., Lipińska, A. D., Rychłowski, M., Hoffmann, W., Król, E., Vojtesek, B., Sloan, R. D., Bieńkowska-Szewczyk, K., Hupp, T., Ball, K. The role of IFITM proteins in tick-borne encephalitis virus infection. J Virol 2021. doi: 10.1128/JVI.01130-21. (advance online) (IF2020: 5,103; Q1)
• Padariya, M., Kote, S., Mayordomo, M., Dapic, I., Alfaro, J., Hupp, T., Fahraeus, R., Kalathiya, U. Structural determinants of peptide-dependent TAP1-TAP2 transit passage targeted by viral proteins and altered by cancer-associated mutations. Comput Struct Biotechnol J 2021;19:5072-5091. doi: 10.1016/j.csbj.2021.09.006. (IF2020: 7,271; Q1)
• Gnanasundram, V. S., Bonczek, O., Wang, L., Chen, S., Fahraeus, R. p53 mRNA Metabolism Links with the DNA Damage Response. Genes (Basel) 2021;12(9):1446. doi: 10.3390/genes12091446. (IF2020: 4,096; Q2)
• Bilek, O., Holanek, M., Jurica, J., Stepankova, S., Vasina, J., Selingerova, I., Poprach, A., Borilova, S., Kazda, T., Kiss, I., Zdrazilova-Dubska, L. Drug interaction profile of TKI alectinib allows effective and safe treatment of ALK+ lung cancer in the kidney transplant recipient. Int Immunopharmacol 2021;99:108012. doi: 10.1016/j.intimp.2021.108012. (IF2020: 4,932; Q2)
• Dias, C., Nita, E., Faktor, J., Tynan, A. C, Hernychova, L., Vojtesek, B., Nylandsted, J., Hupp, T. R, Kunath, T., Ball, K. L. CHIP-Dependent Regulation of the Actin Cytoskeleton is Linked to Neuronal Cell Membrane Integrity. iScience 2021;24(8):102878. doi: 10.1016/j.isci.2021.102878. (IF2020: 5,458; Q1).
• Wilms, T., Boldrup, L., Gu, X., Coates, P. J., Sgaramella, N., Nylander, K. High Levels of Low-Density Lipoproteins Correlate with Improved Survival in Patients with Squamous Cell Carcinoma of the Head and Neck. Biomedicines 2021;9(5):506. doi: 10.3390/biomedicines9050506. (IF2020: 6,081; Q1)
• Herrington, C. S., Poulsom, R., Koeppen, H., Coates, P. J. Recent Advances in Pathology: the 2021 Annual Review Issue of The Journal of Pathology. J Pathol 2021;254(4):303-306. doi: 10.1002/path.5687. (IF2020: 7,996; Q1)
• Kurkowiak, M., Grasso, G., Faktor, J., Scheiblecker, L., Winniczuk, M., Yebenes Mayordomo, M., O’Neill, J. R., Oster, B., Vojtesek, B., Al-Saadi, A., Marek-Trzonkowska, N., Hupp, T. R. An integrated DNA and RNA variant detector identifies a highly conserved three base exon in the MAP4K5 kinase locus. RNA Biol 2021 (advance online) (IF2020: 4,652; Q2)
• Schenkmayerova, A., Pinto, G. P., Toul, M., Marek, M., Hernychova, L., Planas-Iglesias, J., Daniel Liskova, V., Pluskal, D., Vasina, M., Emond, S., Dörr, M., Chaloupkova, R., Bednar, D., Prokop, Z., Hollfelder, F., Bornscheuer, U. T., Damborsky, J. Engineering the protein dynamics of an ancestral luciferase. Nat Commun 202;12(1):3616. doi: 10.1038/s41467-021-23450-z. (IF2020: 14,919; Q1)
• Pirog, A., Faktor, J., Urban-Wojciuk, Z., Kote, S., Chrusciel, E., Arcimowicz, L, Marek-Trzonkowska, N., Vojtesek, B., Hupp, T. R., Al Shboul, S., Brennan, P. M., Smolenski, R. T, Goodlett, D. R., Dapic, I. Comparison of different digestion methods for proteomic analysis of isolated cells and FFPE tissue samples. Talanta 2021;233:122568. (IF2020: 6,057; Q1)
• Białobrzeska, W., Dziabowska, K., Lisowska, M., Mohtar, M. A., Muller, P., Vojtesek, B., Krejcir, R., O’Neill, R., Hupp, T. R., Malinowska, N., Biega, E., Bigus, D., Cebula, Z., Pala, K., Czaczyk, E., Zołedowska, S., Nidzworski, D. An Ultrasensitive Biosensor for Detection of Femtogram Levels of the Cancer Antigen AGR2 Using Monoclonal Antibody Modified Screen-Printed Gold Electrodes. Biosensors 2021;11(6):184. (IF2020: 5,519; Q1)
• Mikac, S., Rychłowski, M., Dziadosz, A., Szabelska-Beresewicz, A., Fahraeus, R., Hupp, T., Sznarkowska, A. Identification of a Stable, Non-Canonically Regulated Nrf2 Form in Lung Cancer Cells. Antioxidants (Basel) 2021;10(5):786. (IF2020: 6,312; Q1) 
• Padariya, M., Sznarkowska, A., Kote, S., Gómez-Herranz, M., Mikac, S., Pilch, M., Alfaro, J., Fahraeus, R., Hupp, T., Kalathiya, U. Functional Interfaces, Biological Pathways, and Regulations of Interferon-Related DNA Damage Resistance Signature (IRDS) Genes. Biomolecules 2021;11(5):622. (IF2020: 4,879; Q2)
• Boldrup, L., Coates, P., Gu, X., Wang, L., Fåhraeus, R., Wilms, T., Sgaramella, N., Nylander, K. Low potential of circulating interleukin 1 receptor antagonist as a prediction marker for squamous cell carcinoma of the head and neck. J Oral Pathol Med 2021;50(8):785-794. (IF2020: 4,253; Q1)
• Koukalová, R., Selingerová, I, Řehák, Z., Adam, Z., Szturz, P. FDG-PET/CT v dia­gnostice a hodnocení léčebné odpovědi Castlemanovy choroby – retrospektivní studie 29 případů z jednoho centra. Klin Onkol 2021;34(2):120-127. (bez IF; Q4)
• Hamala, V., Červenková Šťastná, L., Kurfiřt, M., Cuřínová, P., Balouch, M., Hrstka, R., Voňka, P., Karban, J. The effect of deoxyfluorination and O-acylation on the cytotoxicity of N-acetyl-D-gluco- and D-galactosamine hemiacetals. Org Biomol Chem 2021;19(20):4497-4506. (IF2020: 3,876; Q1)
• Martisova, A., Holcakova, J., Izadi, N., Sebuyoya, R., Hrstka, R., Bartosik, M. DNA Methylation in Solid Tumors: Functions and Methods of Detection. Int J Mol Sci 2021;22(8):4247. (IF2020: 5,923; Q1)
• Černocká, H., Voňka, P., Kasalová, V., Sommerová, L., Vandová, V., Hrstka, R., Ostatna, V. AGR2-AGR3 hetero-oligomeric complexes: Identification and characterization. Bioeletrochemistry 2021;140:107808. (IF2020: 5,373; Q1)
• Salomao, N., Karakostis, K., Hupp, T., Vollrath, F., Vojtesek, B., Fahraeus, R. What do we need to know and understand about p53 to improve its clinical value? J Pathol 2021;254(4):443-453. (IF2020: 7,996; Q1)
• Selingerova, I., Katina, S., Horova, I. Comparison of parametric and semiparametric survival regression models with kernel estimation. J Stat Comput Sim 2021;91(13): 2717-2739. (IF2020: 1,424; Q3) 
• Holanek, M., Selingerova, I., Bilek, O., Kazda, T., Fabian, P., Foretova, L., Zvarikova, M., Obermannova, R., Kolouskova, I., Coufal, O., Petrakova, K., Svoboda, M., Poprach, A. Neoadjuvant Chemotherapy of Triple-Negative Breast Cancer: Evaluation of Early Clinical Response, Pathological Complete Response Rates, and Addition of Platinum Salts Benefit Based on Real-World Evidence. Cancers (Basel) 2021;13(7):1586. (IF2020: 6,639; Q1)
• Burkon, P., Selingerova, I., Slavik, M., Pospisil, P., Bobek, L., Kominek, L., Osmera, P., Prochazka, T., Vrzal, M., Kazda, T., Slampa, P. Stereotactic Body Radiotherapy for Lymph Node Oligometastases: Real-World Evidence From 90 Consecutive Patients. Front Oncol 2021;10:616494. (IF2020: 6,244; Q2)
• Padariya, M., Kalathiya, U., Mikac, S., Dziubek, K., Tovar Fernandez, M. C., Sroka, E., Fahraeus, R., Sznarkowska, A. Viruses, cancer and the non-self-recognition. Open Biol 2021;11(3):200348. (IF2020: 6,411; Q1)
• Dymackova, R., Selingerova, I., Kazda, T., Slavik, M., Halamkova, J., Svajdova, M., Slampa, P., Slama, O. Effect of Acupuncture in Pain Management of Head and Neck Cancer Radiotherapy: Prospective Randomized Unicentric Study. J Clin Med 2021;10(5):1111. (IF2020: 4,241; Q1)
• Karakostis, K., López, I., Peña-Balderas, A. M., Fåhareus, R., Olivares-Illana, V. Molecular and Biochemical Techniques for Deciphering p53-MDM2 Regulatory Mechanisms. Biomolecules 2021;11(1):36. (IF2020: 4,879; Q2)
• Pokorná, Z., Vysloužil, J., Hrabal, V., Vojtěšek, B., Coates, P. J. The foggy world(s) of p63 isoform regulation in normal cells and cancer. J Pathol 2021;254(4):454-473. (IF2020: 7,996; Q1)
• Iscan, E., Ekin, U., Yildiz, G., Oz, O., Keles, U., Suner, A., Cakan-Akdogan, G., Ozhan, G., Nekulova, M., Vojtesek, B., Uzuner, H., Karakülah, G., Alotaibi, H., Ozturk, M. TAp73β Can Promote Hepatocellular Carcinoma Dedifferentiation. Cancers (Basel) 2021;13(4):783. (IIF2020: 6,639; Q1)
• Mistrik, M., Skrott, Z., Muller, P., Panacek, A., Hochvaldova, L., Chroma, K., Buchtova, T., Vandova, V., Kvitek, L., Bartek, J. Microthermal-induced subcellular-targeted protein damage in cells on plasmonic nanosilver-modified surfaces evokes a two-phase HSP-p97/VCP response. Nat Commun 2021;12(1):713. (IF2020: 14,919; Q1)
• Vlcnovska, M., Stossova, A., Kuchynka, M., Dillingerova, V., Polanska, H., Masarik, M., Hrstka, R., Adam, V., Kanicky, V., Vaculovic, T., Vaculovicova, M. Comparison of Metal Nanoparticles (Au, Ag, Eu, Cd) Used for Immunoanalysis Using LA-ICP-MS Detection. Molecules 2021;26(3):630. (IF2020: 4,411; Q2)
• Weke, K., Singh, A., Uwugiaren, N., Alfaro, J. A., Wang, T., Hupp, T. R., O'Neill, J. R., Vojtesek, B., Goodlett, D. R., Williams, S. M., Zhou, M., Kelly, R. T., Zhu, Y., Dapic, I. MicroPOTS Analysis of Barrett's Esophageal Cell Line Models Identifies Proteomic Changes after Physiologic and Radiation Stress. J Proteome Res 2021;20(5):2195-2205. (IF2020: 4,466; Q1)
• Zahradnikova, M., Ihnatova, I., Lattova, E., Uhrik, L., Stuchlikova, E., Nenutil, R., Valik, D., Nalezinska, M., Chovanec, J., Zdrahal, Z., Vojtesek, B., Hernychova, L., Novotny, M. V. N-Glycome changes reflecting resistance to platinum-based chemotherapy in ovarian cancer. J Proteomics 2021;230:103964 (IF2020: 4,044; Q2)
• Uhrik, L., Hernychova, L., Muller, P., Kalathiya, U., Lisowskam, M. M., Kocikowski, N., Parys, M., Faktor, J., Nekulova, M., Nortcliffe, C., Zatloukalova, P., Ruetgen, B., Fahraeus, R., Ball, K. L., Argyle, D. J., Vojtesek, B., Hupp, T. R. Hydrogen Deuterium Exchange Mass Spectrometry identifies the dominant paratope in CD20 antigen binding to the NCD1.2 monoclonal antibody. Biochem J 2021;478(1):99–120. (IF2020: 3,857; Q3)
• Bonczek, O. Krejci, P., Izakovicova-Holla, L., Cernochova, P., Kiss, I., Vojtesek, B. Tooth agenesis: What do we know and is there a connection to cancer? Clin Genet 2021;99(4):493-502. (IF2020: 4,438; Q2) 
• Galoczova, M., Nenutil, R., Pokorna, Z., Vojtesek, B., Coates, P. J. TAp63 and ΔNp63 (p40) in prostate adenocarcinomas: ΔNp63 associates with a basal-like cancer stem cell population but not with metastasis. Virchows Arch 2021;478(4):627-636. (IF2020: 4,064; Q2)
• Vaňhara, P, Moráň, L., Pečinka, L., Porokh, V., Pivetta, T., Masuri, S., Peña-Méndez, E. M., Conde, J. E., Hampl, A., Havel, J. Intact Cell Mass Spectrometry for Embryonic Stem Cell Biotyping. In: Mitulovic, G. Mass Spectrometry in Life Sciences and Clinical Laboratory. 2021, IntechOpen ISBN: 978-1-83881-862-3.

• Beirão, B. C. B., Raposo, T. P., Imamura, L. M., Ingberman, M., Hupp, T., Vojtěšek, B., Argyle, D. J. A blocking antibody against canine CSF-1R maturated by limited CDR mutagenesis. Antib Ther 2020;3(3):193-204. (IF2019: 1,091; Q3)
• Dvorakova, M., Lapcik, P., Bouchalova, P., Bouchal, P. Transgelin Silencing Induces Different Processes in Different Breast Cancer Cell Lines. Proteomics 2020 Apr;20(7):e1900383. (IF2019: 3,254; Q1)
• Bryksová, M., Dabravolski, S., Kučerová, Z., Zavadil Kokáš, F., Špundová, M., Plíhalová, L., Takáč, T., Grúz, J., Hudeček, M., Hloušková, V., Koprna, R., Novák, O., Strnad, M., Plíhal, O., Doležal, K. Aromatic Cytokinin Arabinosides Promote PAMP-like Responses and Positively Regulate Leaf Longevity. ACS Chem Biol 2020;15(7):1949-1963. (IF2019: 4,434; Q2)
• Attaran, N., Gu, X., Coates, P. J., Fåhraeus, R., Boldrup, L., Wilms, T., Wang, L., Sgaramella, N., Zborayova, K., Nylander, K. Downregulation of TAP1 in Tumor-Free Tongue Contralateral to Squamous Cell Carcinoma of the Oral Tongue, an Indicator of Better Survival. Int J Mol Sci 2020;21(17):6220. (IF2019: 4,556; Q1)
• Hamala, V., Martišová, A., Červenková Šťastná, L., Karban, J., Dančo, A., Šimarek, A., Lamač, M., Horáček, M., Kolářová, T., Hrstka, R., Gyepes, R., Pinkas, J. Ruthenium tetrazene complexes bearing glucose moieties on their periphery: Synthesis, characterization, and in vitro cytotoxicity. Appl Organomet Chem 2020;34:e5896. (IF2019: 2,740; Q2)
• Lakomy, R., Kazda, T., Selingerova, I., Poprach, A., Pospisil, P., Belanova, R., Fadrus, P., Smrcka, M., Vybihal, V., Jancalek, R., Kiss, I., Muckova, K., Hendrych, M., Knight, A., Sana, J., Slampa, P., Slaby, O. Pre-Radiotherapy Progression after Surgery of Newly Diagnosed Glioblastoma: Corroboration of New Prognostic Variable. Diagnostics 2020;10:676. (IF2019: 2,360; Q2)
• Faktor, J., Grasso, G., Zavadil-Kokáš, F., Kurkowiak, M., Mayordomo, M. Y., Kote, S., Singh, A., Ruidong, L., O’Neill, R., Muller, P., Goodlett, D., Vojtesek, B., Hupp, T. R. The effects of p53 gene inactivation on mutant proteome expression in a human melanoma cell model. Biochim Biophys Acta - General Subjects 2020;1864(12):129722.(IF2019: 3,422; Q2)
• Li, R., Zatloukalova, P., Muller, P., Gil-Mir, M., Kote, S., Wilkinson, S., Kemp, A. J., Hernychova, L., Wang, Y., Ball, K. L., Tao, K., Hupp, T., Vojtesek, B. The MDM2 ligand Nutlin-3 differentially alters expression of the immune blockade receptors PD-L1 and CD276. Cell Mol Biol Lett 2020;25:41. (IF2019: 3,451; Q2)
• Náležinská, M., Zdražilová Dubská, L., Valík, D., Hernychová, L., Pavlík, T., Mazalová, M., Chovanec, J., Fait, V. Úskalí laboratorních metod v ovariálním skríninku - doba "-omická"? Onkologie 2020;14(2):88-92. (bez IF)
• Boldrup, L., Coates, P. J., Gu, X., Wang, L., Fahraeus, R., Wilms, T., Sgaramella, N., Baumgarth, J., Norberg-Spaak, L., Nylander, K. Levels of MUC1 in tumours and serum of patients with different sub-types of squamous cell carcinoma of the head and neck. Oncol Lett 2020;20(2):1709-1718. (IF2019: 1,910; Q3)
• Spiegelberg, D., Lundgren Mortensen, A. C., Dyah Palupi, K., Micke, P., Wong, J., Vojtesek, B., Lane, D. P., Nestor, M. The novel anti-cMet antibody seeMet 12 potentiates sorafenib therapy and radiotherapy in a colorectal cancer model. Front Oncol 2020 (Epub ahead of print) (IF2019: 4,250; Q1)
• Herrington, C. S., Poulsom, R., Coates, P. J. Recent Advances in Pathology: the 2020 Annual Review Issue of The Journal of Pathology. J Pathol 2020;250:475-479. (IF2019: 5,780; Q1)
• Skoupilova, H., Rak, V., Pinkas, J., Karban, J., Hrstka, R. The Cytotoxic Effect of Newly Synthesized Ferrocenes against Cervical Carcinoma Cells Alone and in Combination with Radiotherapy. Appl Sci 2020;10(11):3728. (IF2019: 2,490; Q1)
• Gelle, D., Lamač, M., Mach, K., Šimková, L., Gyepes, R., Sommerová, L., Martišová, A., Bartošík, M., Vaculovič, T., Kanický, V., Hrstka, R., Pinkas, J. Enhanced Intracellular Accumulation and Cytotoxicity of Ferrocene-Ruthenium Arene Conjugates. ChemPlusChem 2020;85(5):1034-1043. (IF2019: 3,350; Q1)
• Dymackova, R., Kazda, T., Slavik, M., Selingerova, I., Slampa, P., Slama, O. Acupuncture in the treatment of acute toxicity during and after head and neck cancer radiotherapy: Interim analysis of randomized prospective open-label trial. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2020. Epub ahead of print. (IF2019: 1,130; Q3) 
• Kadlcikova, D., Musilova, P., Hradska, H., Petrovova, M., Selingerova, I., Vozdova, M., Svoboda, M., Rubes, J. Different chromosome damage in lymphocytes of newly diagnosed gastrointestinal and breast cancer patients. Neoplasma 2020;67(3):668-676. (IF2019: 1,780; Q3)
• Lakomy, R., Kazda, T., Selingerova, I., Poprach, A., Pospisil, P., Belanova, R., Fadrus, P., Vybihal, V., Smrcka, M., Jancalek, R., Hynkova, L., Muckova, K., Hendrych, M., Sana, J., Slaby, O., Slampa, P. Real-World Evidence in Glioblastoma: Stupp’s Regimen After a Decade. Front Oncol 2020;10:840. (IF2019: 4,250; Q1)
• Krejcir, R., Briza, T., Sterba, M., Simoncik, O., Muller, P., Coates, P. J., Martasek, P., Vojtesek, B., Zatloukalova, P. Anticancer Pentamethinium Salt Is a Potent Photosensitizer Inducing Mitochondrial Disintegration and Apoptosis upon Red Light Illumination. J Photoch Photobio B 2020;209:111939. (IF2019: 4,170; Q1)
• Sommerova L, Ondrouskova E, Martisova A, Zoumpourlis V, Galtsidis S, Hrstka R. ZEB1/miR-200c/AGR2: A New Regulatory Loop Modulating the Epithelial-Mesenchymal Transition in Lung Adenocarcinomas. Cancers (Basel) 2020;12(6):E1614. (IF2019: 6,370; Q1)
• Gurin, D., Slavik, M., Hermanova, M., Selingerova, I., Kazda, T., Hendrych, M., Shatokhina, T., Vesela, M. The Tumor Immune Microenvironment and Its Implications for Clinical Outcome in Patients with Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma. J Oral Pathol Med 2020;49(9):886-896. (IF2019: 2,140; Q2)
• Gnanasundram, S. V., Malbert-Colas, L., Chen, S., Fusee, L., Daskalogianni, C., Muller, P., Salomao, N., Fahraeus, R. MDM2’s dual mRNA binding domains co-ordinate its oncogenic and tumour suppressor activities. Nucleic Acids Res 2020;48(12):6775-6787. (IF2019: 11,140; Q1)
• Janacova, L., Faktor, J., Capkova, L., Paralova, V., Pospisilova, A., Podhorec, J., Ebhardt, H. A., Hrstka, R., Nenutil, R., Aebersold, R., Bouchal, P. SWATH-MS Analysis of FFPE Tissues Identifies Stathmin as a Potential Marker of Endometrial Cancer in Patients Exposed to Tamoxifen. J Proteome Res 2020;19(7):2617-2630. (IF2019: 3,80; Q1)
• Trcka, F., Durech, M., Vankova, P., Vandova, V., Simoncik, O., Kavan, D., Vojtesek, B., Muller, P., Man, P. The interaction of the mitochondrial protein importer TOMM34 with HSP70 is regulated by TOMM34 phosphorylation and binding to 14-3-3 adaptors. J Biol Chem 2020;295(27):8928-8944. (IF2019: 3,960; Q1)
• Wilms, T., Gu, X., Boldrup, L., Coates, P. J., Fahraeus, R., Wang, L., Sgaramella, N., Nielsen, N. H., Norberg-Spaak, L., Nylander, K. PD-L1 in squamous cell carcinoma of the oral tongue shows gender-specific association with prognosis. Oral Dis 2020;26(7):1414-1423. (IF2019: 2,430; Q1)
• Fusée, L. T. S., Marín, M., Fåhraeus, R., López, I. Alternative Mechanisms of p53 Action During the Unfolded Protein Response. Cancers (Basel) 2020;12(2):401. (IF2019: 6,370; Q1)
• Kajanova, I., Zatovicova, M., Jelenska, L., Sedlakova, O., Barathova, M., Csaderova, L., Debreova, L., Lukacikova, L., Grossmannova, K., Labudova, M., Golias, T., Svastova, E., Ludwig, A., Muller, P., Vojtesek, B., Pastorek, J., Pastorekova, S. Impairment of carbonic anhydrase IX ectodomain cleavage reinforces tumorigenic and metastatic phenotype of cancer cells. Brit J Cancer 2020;122(11):1590-1603. (IF2019: 5,490; Q1)
• Díaz-García, D., Sommerova, L., Martisova, A., Skoupilova, H., Prashar, S., Vaculovic, T., Kanicky, V., del Hierro, I., Hrstka, R., Gómez-Ruiza, S. Mesoporous silica nanoparticles functionalized with a dialkoxide diorganotin(IV) compound: In search of more selective systems against cancer cells. Micropor Mesopor Mat 2020;300:110154. (IF2019: 4,280; Q1)
• Brychtova, V., Coates, P. J., Hrabal, V., Boldrup, L., Fabian, P., Vojtesek, B., Sgaramella, N., Nylander, K. Keratin 36, a specific marker of tongue filiform papillae, is downregulated in squamous cell carcinoma of the mobile tongue. Mol Clin Oncol 2020;12(5):421-428. (IF2018: 0,63; Q n/a)
• Anton, M., Jirakova Moranova, L., Hrstka, R., Bartosik, M. Application of electrochemical LAMP-based assay for screening of HPV16/HPV18 infection in cervical samples. Anal Methods 2020;12(6):822-829. (IF2019: 2,390; Q1)
• Lamač, M., Horáček, M., Červenková Šťastná, L., Karban, J., Sommerová, L., Skoupilová, H., Hrstka, R., Pinkas, J. Harmless glucose‐modified ruthenium complexes suppressing cell migration of highly invasive cancer cell lines. Appl Organomet Chem 2020;31(1):e5318. (IF2019: 2,740; Q2)
• Liu, Y., Nekulova, M., Nenutil, R., Horakova, I., Appleyard, M. V., Murray, K., Holcakova, J., Galoczova, M., Quinlan, P., Jordan, L. B., Purdie, C. A., Vojtesek, B., Thompson, A. M., Coates, P. J. ∆Np63/p40 correlates with the location and phenotype of basal/mesenchymal cancer stem-like cells in human ER+ and HER2+ breast cancers. J Pathol Clin Res 2020;6(1):83-93. (IF2019: 3,489; Q4)
• Skoupilova, H., Bartosik, M., Sommerova, L., Pinkas, J., Vaculovic, T., Kanicky, V., Karban, J., Hrstka, R. Ferrocenes as new anticancer drug candidates: Determination of the mechanism of action. Eur J Pharmacol 2020;867:172825. (IF2019: 3,240; Q1)
• Vandova, V., Vankova, P., Durech, M., Houser, J., Kavan, D., Man, P., Muller, P., Trcka, F. HSPA1A conformational mutants reveal a conserved structural unit in Hsp70 proteins. Biochim Biophys Acta Gen Subj 2020;1864(1):129458. (IF2019: 3,740; Q1)
• Polaskova, K., Merta, T., Martincekova, A., Zapletalova, D., Kyr, M., Mazanek, P., Krenova, Z., Mudry, P., Tuma, J., Skotakova, J., Cervinkova, I., Valik, D., Zdrazilova-Dubska, L., Noskova, H., Pal, K., Slaby, O., Fabian, P., Kozakova, S., Neradil, J., Veselska, R., Kanderova, V., Hrusak, O., Freiberger, T., Klement, G. L., Sterba, J. Comprehensive molecular profiling for relapsed/refractory pediatric Burkitt lymphomas – retrospective analysis of three real life clinical cases – addressing issues on randomization and customization at the bedside…. Front Oncol 2020;9:1531. (IF2019: 4,250; Q1)
• Povedano, E., Ruiz-Valdepeñas Montiel, V., Gamella, M., Serafín, V., Pedrero, M., Moranova, L., Bartosik, M., Montoya, J. J., Yáñez-Sedeño, P., Campuzano, S., Pingarrón, J. M. A novel zinc finger protein–based amperometric biosensor for miRNA determination. Anal Bioanal Chem 2020;412(21):5031-5041. (IF2019: 3,210; Q1)
• Moore, A., …Foretova, L. et al. Genetically Determined Height and Risk of Non-hodgkin Lymphoma. Front Oncol 2020;9:1539. (IF2019: 4,250; Q1)
• Mavaddat, N., …Foretova, L. et al. Risk-reducing salpingo-oophorectomy, natural menopause, and breast cancer risk: an international prospective cohort of BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Breast Cancer Res 2020;22(1):8. (IF2019: 5,740; Q1)
• Li, H.,… Foretova, L. et al. Alcohol Consumption, Cigarette Smoking, and Risk of Breast Cancer for BRCA1 and BRCA2 Mutation Carriers: Results from The BRCA1 and BRCA2 Cohort Consortium. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2020;29(2):368-378. (IF2019: 5,080; Q1)
• Kýr, M., Klement, G. L., Zdrazilova-Dubska, L., Demlova, R., Valik, D., Slaby, O., Slavc, I., Sterba, J. Editorial: Precision/Personalized Pediatric Oncology and Immune Therapies: Rather Customize Than Randomize. Front Oncol 2020;10:377. (IF2019: 4,250; Q1)

• Yewdell, J. W., Dersh, D., Fåhraeus, R. Peptide Channeling: The Key to MHC Class I Immunosurveillance? Trends Cell Biol 2019;29(12):929-939. (IF2018:16,558; Q1)
• Zapletal, O., Sirotek, L., Coufal, O. Žilní vstupy v onkologii. Rozhl Chir 2019;98(11):427-433. (bez IF)
• Mužlayová, P., Coufal, O., Fabian, P., Svobodník, A., Zapletal, O. Fyloidné nádory prsníka - retrospektívny prehľad 83 klinických prípadov. Rozhl Chir 2019;98(9):362-369. (bez IF)
• Koukalová, R., Lakomý, R., Fabián, P., Řehák, Z., Szturz, P. 18 F-FDG-pozitivní kolorektální polyp připomínající metastázu pokročilého melanomu léčeného ipilimumabem. Nukl Med 2019;8(4):76-79. (bez IF)
• Faktor, J., Knopfova, L., Lapcik, P., Janacova, L., Paralova, V., Bouchalova, P., Muller, P., Benes, P., Bouchal, P. Proteomics Identification and Validation of Desmocollin-1 and Catechol-O-Methyltransferase as Proteins Associated with Breast Cancer Cell Migration and Metastasis. Proteomics 2019;19(21-22):e1900073. (IF2018: 3,106; Q2)
• Fedorova, L., Mudry, P., Pilatova, K., Selingerova, I., Merhautova, J., Rehak, Z., Valik, D., Hlavackova, E., Cerna, D., Faberova, L., Mazanek, P., Pavelka, Z., Demlova, R., Sterba, J., Zdrazilova-Dubska, L. Assessment of immune response following dendritic cell-based immunotherapy in pediatric patients with relapsing sarcoma. Front Oncol 2019;9:1169. (IF2018: 4,416; Q2)
• Hlavackova, E., Pilatova, K., Cerna, D., Selingerova, I., Mudry, P., Mazanek, P., Fedorova, L., Merhautova, J., Jureckova, L., Semerad, L., Pacasova, R., Flajsarova, L., Souckova, L., Demlova, R., Sterba, J., Valik, D., Zdrazilova-Dubska, L. Dendritic Cell-Based Immunotherapy in Advanced Sarcoma and Neuroblastoma Pediatric Patients: Anti-cancer Treatment Preceding Monocyte Harvest Impairs the Immunostimulatory and Antigen-Presenting Behavior of DCs and Manufacturing Process Outcome. Front Oncol 2019;9:1034. (IF2018: 4,416; Q2)
• Šimková, L, Svoboda, J., Pinkas, J., Skoupilová, H., Hrstka, R., Dunlop, D., Lamač, M., Gyepes, R., Ludvík, J. Electrochemical Study of Highly Substituted Titanocene Dihalides. Electroanal 2019;31(10):2067-2073. (IF2018: 2,691; Q2)
• Bílek, O., Holánek, M., Berkovcová, J., Horký, O., Kazda, T., Čoupková, H., Špelda, S., Kristková, L., Zvaríková, M., Podhorec, J., Bořilová, S., Bohovicová, L., Zdražilová Dubská, L. Méně časté mutace EGFR v kontextu léčby nemalobuněčného karcinomu plic. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S6–3S12. (bez IF)
• Zatloukalová, P., Krejčíř, R., Valík, D., Vojtěšek, B. CRISPR-Cas9 jako nástroj v terapii nádorových onemocnění. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S13–3S18. (bez IF)
• Bortlíková, L., Müller, P., Vojtěšek, B., Rak, V., Svoboda, M. Syntetická letalita – její současné využití a potenciál v onkologické léčbě. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S19–3S24. (bez IF)
• Skoupilová H., Hrstka R. Pokroky ve využití organokovových sloučenin při vývoji protinádorových léčiv. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S25–3S33. (bez IF)
• Voňka P., Hrstka R. Souhrn aktuálních poznatků o úloze estrogenového receptoru α v nádorové buněčné signalizaci. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S34–3S38. (bez IF)
• Hernychová, L., Uhrík, L., Nenutil, R., Miloš V. Novotný. Glykoproteiny v sérech onkologických pacientů. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S39–3S45. (bez IF)
• Uhrík, L., Hernychová, L., Vojtěšek, B. Glykozylácia ako dôležitý regulátor funkcie protilátok. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S46–3S55. (bez IF)
• Faktor, J., Pjechová, M., Hernychová, L., Vojtěšek, B. Výskum ubikvitinácie proteínov v onkológii. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S56–3S64. (bez IF)
• Moráňová, L., Bartošík, M. Dlouhé nekódující RNA - současné možnosti detekce a využití v klinické praxi. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S65–3S71. (bez IF)
• Brychtová, V., Hrabal, V., Vojtěšek, B. Interakce onkogenních virových proteinů s proteiny rodiny p53. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S72–3S77. (bez IF)
• Zavadil Kokáš, F., Faktor, J., Vojtěšek, B. Kooperace genomických, transkriptomických a proteomických metod v detekci mutovaných proteinů. Klin Onkol 2019;32(Suppl 3):3S78–3S84. (bez IF)
• Uhrik, L., Wang, L., Haronikova, L., Medina-Medina, I., Rebolloso-Gomez, Y., Chen, S., Vojtesek, B., Fahraeus, R., Hernychova, L., Olivares-Illana, V. Allosteric changes in HDM2 by the ATM phospho-mimetic S395D mutation: Implications on HDM2 function. Biochem J 2019;476(21):3401-3411. (IF2018: 4,331; Q1)
• Obacz, J., Sommerova, L., Sicari, D., Durech, M., Avril, T., Iuliano, F., Pastorekova, S., Hrstka, R., Chevet, E., Delom, F., Fessart, D. Extracellular AGR3 regulates breast cancer cells migration via Src signaling. Oncol Lett 2019;18(5):4449-4456. (IF2018: 1,871; Q4)
• Rimankova, L., Ostatna, V., Bartosik, M. Intrinsic Electrocatalysis of RNA as a Label‐free and Reagent‐less Tool for Detection of MicroRNAs. Electroanal 2019;31(10):1895-1900. (IF2018: 2,691; Q2)
• Zdražilová‑Dubská, L., Bencsiková, B., Valík, D. Jak se vypořádat s nespecificitou nádorových markerů? Interní Med 2019;21(3):184-186. (bez IF)
• Krejcir, R., Krcova, L., Zatloukalova, P., Briza, T., Coates, P. J., Sterba, M., Muller, P., Kralova, J., Martasek, P., Kral, V., Vojtesek, B. A Cyclic Pentamethinium Salt Induces Cancer Cell Cytotoxicity through Mitochondrial Disintegration and Metabolic Collapse. Int J Mol Sci 2019;20(17):4208. (IF2018: 4,183; Q2)
• Holánek, M., Bílek, O., Nenutil, R., Kazda, T., Selingerová, I., Zvaríková, M., Palácová, M., Vyzula, R., Petráková, K. Zhodnocení účinnosti neoadjuvantní chemoterapie s platinovým derivátem u pacientek se zárodečnou mutací v genech BRCA1 a BRCA2 – retrospektivní analýza souboru pacientek s karcinomem prsu léčených v MOÚ Brno. Klin Onkol 2019;32(Suppl 2):31-35. (bez IF)
• Zwinsová, B., Brychtová, V., Hrivňáková, M., Zdražilová Dubská, L., Bencsiková, B., Šefr, R., Nenutil, R., Vídeňská, P., Budinská, E. Vliv mikrobiomu na vznik a vývoj kolorektálního karcinomu. Klin Onkol 2019;32(4):261-269. (bez IF)
• Kote, S., Faktor, J., Dapic, I., Mayordomo, M. Y., Kocikowski, M., Kagansky, A., Goodlett, D., Vojtesek, B., Hupp, T., Wilcockson, D., Piper, R. Analysis of venom sac constituents from the solitary, hunting wasp Cerceris rybyensis. Toxicon 2019;169:1-4. (IF2018: 2,276; Q3)
• Bouchal, P., Schubert, O. T., Faktor, J., Capkova, L., Imrichova, H., Zoufalova, K., Paralova, V., Hrstka, R., Liu, Y., Ebhardt, H. A., Budinska, E., Nenutil, R., Aebersold, R. Breast Cancer Classification Based on Proteotypes Obtained by SWATH Mass Spectrometry. Cell Rep 2019;28(3):832-843. (IF2018: 7,815; Q1)
• Bencsikova B, Budinska E, Selingerova I, Pilatova K, Fedorova L, Greplova K, Nenutil R, Valik D, Obermannova R, Sheard MA, Zdrazilova-Dubska L. Circulating T cell subsets are associated with clinical outcome of anti-VEGF-based 1st-line treatment of metastatic colorectal cancer patients: a prospective study with focus on primary tumor sidedness. BMC Cancer 2019;19(1):687. (IF2018: 2,933; Q3)
• Vyskocil, J., Tucek, S., Kiss, I., Fedorova, L., Nevrlka, J., Zdrazilova-Dubska, L. Type II hypersensitivity reactions after oxaliplatin rechallenge can be life threatening. Int Immunopharmacol 2019;74:105728. (IF2018: 3,361; Q2)
• Qian, F., …Foretova, L., et al. Mendelian randomisation study of height and body mass index as modifiers of ovarian cancer risk in 22,588 BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Br J Cancer 2019;121:180-192. (IF2018: 5,416; Q1)
• Král Z, Adam Z, Folber F, Moulis M, Tomíška M, Říhová L, Štork M, Buliková A, Pour L, Krejčí M, Sandecká V, Koukalová R, Řehák Z, Čermáková Z. Systémová zánětlivá reakce s vysokými hodnotami CRP jako dominantní příznak mnohočetného myelomu. Vnitr Lek 2019;65(1):37-44. (bez IF)
• Martisova, A., Sommerova, L., Kuricova, K., Podhorec, J., Vojtesek, B., Kankova, K., Hrstka, R. AGR2 silencing contributes to metformin-dependent sensitization of colorectal cancer cells to chemotherapy. Oncol Lett 2019;18(5):4964-4973. (IF2018: 1,871; Q4)
• Gu, X., Boldrup, L., Coates, P. J., Fahraeus, R., Wang, L., Wilms, T., Norberg-Spaak, L., Sgaramella, N., Nylander, K. High immune cytolytic activity in tumor-free tongue tissue confers better prognosis in patients with squamous cell carcinoma of the oral tongue. J Pathol Clin Res 2019;5(4):240-247. (IF2018: 5,942; Q n/a)
• Chaloupkova, R., Liskova, V., Toul, M., Markova, K., Sebestova, E., Hernychova, L., Marek, M., Pinto, G. P., Pluskal, D., Waterman, J., Prokop, Z., Damborsky, J. Light-emitting Dehalogenases: Reconstruction of Multi-functional Biocatalysts. ACS Catal 2019;9(6):4810-4823. (IF2018: 12,221; Q1)
• Gómez-Herranz, M., Nekulova, M., Faktor, J., Hernychova, L., Kote, S., Sinclair, E. H., Nenutil, R.., Vojtesek, B., Ball, K. L., Hupp, T. R. The effects of IFITM1 and IFITM3 gene deletion on IFNγ stimulated protein synthesis. Cell Signal 2019;60:39-56. (IF2018: 3,388; Q3)
• Gu, X., Wang, L., Boldrup, L., Coates, P. J., Fahraeus, R., Sgaramella, N., Wilms, T., Nylander, K. AP001056.1, A Prognosis-Related Enhancer RNA in Squamous Cell Carcinoma of the Hea+B34d and Neck. Cancers (Basel) 2019;11(3):pii:E347. (IF2018: 6,162; Q1)
• Coufalova, D., Remnant, L., Hernychova, L., Muller, P., Healy, A., Kannan, S., Westwood, N., Verma, C. S., Vojtesek, B., Hupp, T. R., Houston, D. R. An inter-subunit protein-peptide interface that stabilizes the specific activity and oligomerization of the AAA+ chaperone Reptin. J Proteomics 2019;199:89-101. (IF2018: 3,537; Q1)  
• Muller, P., Coates, P. J., Nenutil, R., Trcka, F., Hrstka, R., Chovanec, J., Brychtova, V., Vojtesek, B. Tomm34 is commonly expressed in epithelial ovarian cancer and associates with tumour type and high FIGO stage. J Ovarian Res 2019;12(1):30. (IF2018: 2,469; Q3)
• Bartošík, M., Jiráková, L. Electrochemical analysis of nucleic acids as potential cancer biomarkers. Curr Opin Electrochem 2019;14:96–103. (bez IF)
• Haronikova, L., Olivares-Illana, V., Wang, L., Karakostis, K., Chen, S., Fåhraeus, R. The p53 mRNA: an integral part of the cellular stress response. Nucleic Acids Res 2019;47(7):3257-3271 (IF2018: 11,147; Q1)
• Sommerova, L., Anton, M., Bouchalova, P., Jasickova, H., Rak, V., Jandakova, E., Selingerova, I., Bartosik, M., Vojtesek, B., Hrstka, R. The role of miR-409-3p in regulation of HPV16/18-E6 mRNA in human cervical high-grade squamous intraepithelial lesions. Antiviral Res 2019;163:185-192. (IF2018: 4,130; Q1)
• Qian F, ..., Foretova L, et al. Height and Body Mass Index as Modifiers of Breast Cancer Risk in BRCA1/2 Mutation Carriers: A Mendelian Randomization Study. J Natl Cancer Inst 2019;111(4):djy132. (IF2018: 10,211; Q1)
• Ostatna, V., Hason, S., Kasalova, V., Durech, M., Hrstka, R. Anterior gradient-3 protein-antibody interaction at charged interfaces. Label-free chronopotentiometric sensing. Electrochim Acta 2019;297:974e979. (IF2018: 5,383; Q1)
• Prado Martins, R., Malbert-Colas, L., Lista, M. J., Daskalogianni, C., Apcher, S., Pla, M., Findakly, S., Blondel, M., Fåhraeus, R. Nuclear processing of nascent transcripts determines synthesis of full-length proteins and antigenic peptides. Nucleic Acids Res 2019;47(6):3086-3100. (IF2018: 11,147; Q1)
• Trcka, F., Durech, M., Vankova, P., Chmelik, J., Martinkova, V., Hausner, J., Kadek, A., Marcoux, J., Klumpler, T., Vojtesek, B., Muller, P., Man, P. Human stress-inducible Hsp70 has a high propensity to form ATP dependent antiparallel dimers that are differentially regulated by cochaperone binding. Mol Cell Proteomics 2019;18(2):320-33.(IF2018: 4,828; Q1)
• Gu, X., Coates, P. J., Boldrup, L., Wang, L., Krejci, A., Hupp, T., Fahraeus, R., Norberg-Spaak, L., Sgaramella, N., Wilms, T., Nylander, K. Copy number variation: a prognostic marker for young patients with squamous cell carcinoma of the oral tongue. J Oral Pathol Med 2019;48(1):24-30. (IF2018: 2,030; Q2)
• Jiráková, L., Hrstka, R., Campuzano, S., Pingarron, M., Bartošík, M. Multiplexed Immunosensing Platform Coupled to Hybridization Chain Reaction for Electrochemical Determination of MicroRNAs in Clinical Samples. Electroanalysis 2019;31(2):293-302. (IF2018: 2,691; Q2)
• Burkon, P., Kazda, T., Pospisil, P., Slavik, M., Kominek, L., Selingerova, I., Blakaj, D. M., Prochazka, T., Vrzal, M., Rehak, Z., Slampa, P. Ablative dose stereotactic body radiation therapy for oligometastatic disease: a prospective single institution study. Neoplasma 2019;66(2):315-325. (IF2018: 1,771; Q4)

• Fabian, P., Němeček, R. Predikce odpovědi metastatického kolorektálního karcinomu na cílenou anti-EGFR léčbu. Čes-slov Patol 2018;54(1):17-21. (bez IF)
• Obermannová, R. Sekvenční léčba metastatického karcinomu žaludku: trufluridin/tipiracil - budoucí standard třetí linie. Acta Medicinae 2018;13:21-27. (bez IF)
• Terry, M. B., …Foretova, L. et al. The Influence of Number and Timing of Pregnancies on Breast Cancer Risk for Women With BRCA1 or BRCA2 Mutations. JNCI Cancer Spectr 2018 Dec;2(4):pky078. (bez IF)
• Coufal, O., Zapletal, O., Gabrielová, L., Fabian, P., Schneiderová, M. Cílená axilární disekce a sentinelová biopsie u pacientek s karcinomem prsu po neoadjuvantní chemoterapii – retrospektivní studie. Rozhl Chir 2018;97(12):551-557. (bez IF)
• Gnanasundram, S. V., Fahraeus, R. Translation Stress Regulates Ribosome Synthesis and Cell Proliferation. Int J Mol Sci 2018;19(12):E3757. (IF2017: 3,687)
• Prado Martins, R., Findakly, S., Daskalogianni, C., Teulade-Fichou, M. P., Blondel, M., Fåhraeus, R. In Cellulo Protein-mRNA Interaction Assay to Determine the Action of G-Quadruplex-Binding Molecules. Molecules 2018;23(12):pii: E3124. (IF2017: 3,098)
• Adam, Z., Krejčí, M., Chovancová, Z., Řehák, Z., Koukalová, R., Štork, M., Čermák, A., Říhová, L., Pour, L. S imunoglobulinem IgG4 asociované onemocnění. Transfuze Hematol Dnes 2018;24(2):79-86. (bez IF)
• Adam, Z., Volfová, P., Krejčí, M., Koukalová, R., Řehák, Z., Čermák, A., Pour, L. Neinfekční a nemaligní lymfadenopatie – idiopatická (HHV-8 negativní) multicentrická forma Castlemanovy nemoci. Transfuze Hematol Dnes 2018;24(3):152-165. (bez IF)
• Kazda, T., Misove, A., Burkon, P., Pospisil, P., Hynkova, L., Selingerova, I., Dziacky, A., Belanova, R., Bulik, M., Rehak, Z., Poprach, A., Slama, O., Slampa, P., Slaby, O., Jancalek, R., Lakomy, R. Incidence of Hippocampal Metastases: Laterality and Implications for Unilateral Hippocampal Avoiding Whole Brain Radiotherapy. BioMed Research Int 2018;2018:2459608. (IF2017: 2,583)
• Sgaramella, N., Wilms, T., Boldrup, L., Loljung, L., Gu, X., Coates, P. J., Hassellöf, P., Califano, L., Lo Muzio, L., Fåhraeus, R., Norberg Spaak, L., Franco, R., Tartaro, G., Colella, G., Santagata, M., Dell'Aversana Orabona, G., Chirico, F., Danielsson, K., Troiano, G., Ardito, F., Nylander, K. Ethnicity based variation in expression of E-cadherin in patients with squamous cell carcinoma of the oral tongue. Oncol Lett 2018;16(5):6603-6607. (IF2017: 1,664)
• Řehák, Z., Fojtík, Z., Němec, P., Vašina, J., Koukalová, R., Bortlíček, Z., Vavrušová, A. Možnosti diagnostiky revmatické polymyalgie a obrovskobuněčné arteritidy pomocí FDG PET a PET/CT zobrazení – 12leté zkušenosti jednoho diagnostického centra. Česk Revmatol 2018;26(3):123-131. (bez IF) 
• Rebbeck, T. R…. Foretova, L. et al. Mutational Spectrum in a Worldwide Study of 29,700 Families with BRCA1 or BRCA2 Mutations. Hum Mutat 2018;39(5):593-620. (IF2017: 5,359)
• McMaster, M. L., ..., Foretova, L. et al. Two high-risk susceptibility loci at 6p25.3 and 14q32.13 for Waldenström macroglobulinemia. Nat Commun 2018 Oct 10;9(1):4182. (IF2017: 12,353)
• Schrijver, LH.. Foretova, L. et al. Oral Contraceptive Use and Breast Cancer Risk: Retrospective and Prospective Analyses From a BRCA1 and BRCA2 Mutation Carrier Cohort Study. JNCI Cancer Spectrum 2018;2(2):pky023. (IF2017: 11,238)
• Brychtová, V., Valík, D., Vojtěšek, B. Variabilita buněčné populace solidních nádorů a její význam pro dia gnostiku a terapii nádorových onemocnění. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S5–2S13. (bez IF)
• Krejčíř, R., Valík, D., Vojtěšek, B. Využití mitochondriálních procesů v cílené terapii nádorových onemocnění. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S14–2S20. (bez IF)
• Skoupilová, H., Michalová, E., Hrstka, R. Ferroptóza jako nový typ buněčné smrti a její role v léčbě rakoviny. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S21–2S26. (bez IF)
• Galoczová, M., Nenutil, R., Coates, P. J., Vojtěšek, B. Možnosti využití p63 v bioptické diagnostice. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S27–2S31. (bez IF)
• Dosedělová, L., Nekulová, M., Zahradníková, M., Faktor, J., Vojtěšek, B., Hernychová, L. Význam membránových proteinů v léčbě nádorových onemocnění a možnosti jejich dalšího studia. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S32–2S40. (bez IF)
• Holčáková, J. Vliv metylace DNA na vznik nádorových onemocnění. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S41–2S45. (bez IF)
• Martinková, V., Trčka, F., Vojtěšek, B., Müller, P. Úloha proteinu HSP70 v nádorech a jeho využití jako terapeutický cíl. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S46–2S54. (bez IF)
• Šimončík, O., Pastorek, M., Vojtěšek, B., Müller, P. Úloha proteínu HSF1 v nádorovej transformácii. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S55–2S62. (bez IF)
• Hároníková, L., Vojtěšek, B. Proteíny HDM2 a HDMX v ľudských nádoroch. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S63–2S70. (bez IF)
• Zatloukalová, P., Galoczová, M., Vojtěšek, B. Prima-1 a APR-246 v léčbě nádorových onemocnění. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S71–2S76. (bez IF)
• Podhorec, J., Hrstka, R., Bílek, O., Tuček, Š., Navrátil, J., Michalová, E., Vojtěšek, B. Acetylsalicylová kyselina a její potenciál v chemoprevenci kolorektálního karcinomu. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S77–2S81. (bez IF)
• Sommerová, L., Fraňková, H., Anton, M., Jandáková, E., Hrstka, R. Exprese a funkční charakterizace miR-34c u karcinomu děložního hrdla. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S82–2S87. (bez IF)
• Fědorová, L., Pilátová, K., Selingerová, I., Bencsiková, B., Budinská, E., Zwinsová, B., Brychtová, V., Langrová, M., Šefr, R., Valík, D., Zdražilová Dubská, L.Circulating Myeloid-Derived Suppressor Cell Subsets in Patients with Colorectal Cancer – Exploratory Analysis of Their Biomarker Potential. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S88–2S92. (bez IF)
• Bartošík, M., Jiráková, L. Současné metody analýzy mikroRNA. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S93–2S101. (bez IF)
• Faktor, J., Hernychová, L., Vojtěšek, B., Hupp, T. Proteogenomická platforma na identifikáciu nádorovo špecifických antigénov. Klin Onkol 2018;31(Suppl 2):2S102-2S107. (bez IF)
• Knizek, J., Pavliska, L., ProchAzka, V., VrtkovA, A., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Kuba, M. Computation of Identification of a Gnostical Regression Model, Robust to Both Input and Output Disturbances with the Help of Parallel Computing – Basic Version. Int J Math Comp 2018;29(2):29-57. (bez IF)
• Maryáš, J., Faktor, J., Čápková, L., Müller, P., Skládal, P., Bouchal, P. Pull-down Assay on Streptavidin Beads and Surface Plasmon Resonance Chips for SWATH-MS-based Interactomics. Cancer Genomics Proteomics 2018;15(5):395-404. (IF2017: 2,432)
• Řehák, Z., Koukalová, R. , Vašina, J., Ptáčník, V., Szturz, P., Karban, J., Polívka, J., Adam, Z. 18F-FDG PET/CT obraz Erdheimovy-Chesterovy nemoci – přehled českých pacientů. Nukl Med 2018;7(3):50-56. (bez IF)
• Bartosik, M., Jirakova, L., Anton, M., Vojtesek, B., Hrstka, R. Genomagnetic LAMP-based electrochemical test for determination of high-risk HPV16 and HPV18 in clinical samples. Anal Chim Acta 2018;1042:37-43. (IF2017: 5,123)
• Pastorek, M., Muller, P., Coates, P. J., Vojtesek, B. Intrinsic proteotoxic stress levels vary and act as a predictive marker for sensitivity of cancer cells to Hsp90 inhibition. PLoS One 2018;13(8):e0202758. (IF2017: 2,766)
• Wang, S. S., ..., Foretova, L., et al. HLA class I and II diversity contributes to the etiologic heterogeneity of non-Hodgkin lymphoma subtypes. Cancer Res 2018;78(14):4086-4096. (IF2017: 9,13)
• Roman, R., Řehák, Z., Poprach, A., Němec, P. Revmatická polymyalgie jako komplikace léčby maligního melanomu nivolumabem. Čes Revmatol 2018;26(2):80-86. (bez IF)
• Pácal, L., Chalásová, K., Pleskačová, A., Řehořová, J., Tomandl, J., Kaňková, K. Deleterious Effect of Advanced CKD on Glyoxalase System Activity not Limited to Diabetes Aetiology. Int J Mol Sci 2018;19(5):1517. (IF2017: 3,687)
• Kazda, T., Dziacky, A., Burkon, P., Pospisil, P., Slavik, M., Rehak, Z., Jancalek, R., Slampa, P., Slaby, O., Lakomy, R. Radiotherapy of glioblastoma 15 years after the landmark Stupp’s trial: more controversies than standards? Radiol Oncol 2018;52(2):121-128. (IF2017: 1,722)
• Sgaramella, N., Gu, X., Boldrup, L., Coates, P. J., Fahraeus, R., Califano, L., Tartaro, G., Colella, G., Spaak, L. N., Strom, A., Wilms, T., Muzio, L. L., Orabona, G. D., Santagata, M., Loljung, L., Rossiello, R., Danielsson, K., Strindlund, K., Lillqvist, S., Nylander, K. Searching For New Targets And Treatments In The Battle Against Squamous Cell Carcinoma Of The Head And Neck, With Specific Focus On Tumours Of The Tongue. Curr Top Med Chem 2018;18(3):214-218. (IF2017: 3,374)
• Pilatova, K., Bencsikova, B., Demlova, R., Valik, D., Zdrazilova-Dubska, L. Myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) in patients with solid tumors: considerations for granulocyte colony-stimulating factor treatment. Cancer Immunol Immunother 2018;67(12):1919-1929. (IF2017: 4,225)
• Demlova, R., Zdrazilova-Dubska, L., Sterba, J., Stanta, G., Valik, D. Host-dependent variables: the missing link to personalized medicine. Eur J Surg Oncol 2018:44(9):1289-1294. (IF2017: 3,688)
• Wang, E. C. Y., Pjechova, M., Nightingale, K., Vlahava, V.-M., Patel, M., Ruckova, E., Forbes, S. K., Nobre, L., Antrobus, R., Roberts, D., Fielding, C. A., Seirafian, S., Davies, J., Murrell, I., Lau, B., Wilkie, G. S., Suárez, N. M., Stanton, R. J., Vojtesek, B., Davison, A., Lehner, P. J., Weekes, M. P., Wilkinson, G. W. G., Tomasec, P. Suppression of co-stimulation by human cytomegalovirus promotes evasion of cellular immune defenses. Proc Natl Acad Sci U S A 2018;115(19):4998-5003. (IF2017: 9,504)
• Medina-Medina, I., Martínez-Sánchez, M., Hernández-Monge, J., Fahraeus, R., Muller, P., Olivares-Illana, V. p53 promotes its own polyubiquitination by enhancing the HDM2 and HDMX interaction. Protein Sci 2018;27(5):976-986. (IF2017: 2,41)
• Gaspar, N., Marshall, L. V., Binner, D., Herold, R., Rousseau, R., Blanc, P., Capdeville, R., Carleer, J., Copland, C., Kerloeguen, Y., Norga, K., Pacaud, L., Sevaux, M. A., Spadoni, C., Sterba, J., Ligas, F., Taube, T., Uttenreuther-Fischer, M., Chioato, S., O'Connell, M. A., Geoerger, B., Blay, J. Y., Soria, J. C., Kaye, S., Wulff, B., Brugières, L., Vassal, G., Pearson, A. D. J. Joint Adolescent - Adult Early Phase Clinical Trials to Improve Access to New Drugs for Adolescents with Cancer Proposals from the Multi-stakeholder Platform - ACCELERATE. Ann Oncol 2018;29(3):766-771. (IF2017: 13,926)
• Ladds, M. J. G. W., van Leeuwen, I. M. M., Drummond, C. J., Chu, S., Healy, A. R., Popova, G., Pastor Fernández, A., Mollick, T., Darekar, S., Sedimbi, S. K., Nekulova, M., Sachweh, M. C. C., Campbell, J., Higgins, M., Tuck, C., Popa, M., Safont, M. M., Gelebart, P., Fandalyuk, Z., Thompson, A. M., Svensson, R., Gustavsson, A. L., Johansson, L., Färnegårdh, K., Yngve, U., Saleh, A., Haraldsson, M., D'Hollander, A. C. A., Franco, M., Zhao, Y., Håkansson, M., Walse, B., Larsson, K., Peat, E. M., Pelechano, V., Lunec, J., Vojtesek, B., Carmena, M., Earnshaw, W. C., McCarthy, A. R., Westwood, N. J., Arsenian-Henriksson, M., Lane, D. P., Bhatia, R., McCormack, E., Laín, S. A DHODH inhibitor increases p53 synthesis and enhances tumor cell killing by p53 degradation blockage. Nat Commun 2018;9(1):1107. (IF2017: 12,353)
• Galoczova, M., Coates, P. J., Vojtesek, B. STAT3, stem cells, cancer stem cells and p63. Cell Mol Biol Lett 2018;23:12. (IF2017: 1,291)
• Ostatna, V., Kasalova, V., Sommerova, L., Hrstka, R. Electrochemical sensing of interaction of anterior gradient-2 protein with peptides at a charged interface. Electrochim Acta 2018;269:70-75. (IF2017: 5,116)
• Coates, P. J., Nenutil, R., Holcakova, J., Nekulova, M., Podhorec, J., Svoboda, M., Vojtesek, B. p63 isoforms in triple-negative breast cancer: ΔNp63 associates with the basal phenotype whereas TAp63 associates with androgen receptor, lack of BRCA mutation, PTEN and improved survival. Virchows Arch 2018;472(3):351-359. (IF2017: 2,936)
• Bartošík, M., Jiráková, L., Hrstka, R., Vojtěšek, B. Lidský papilomavirus - role v karcinogenezi cervixu a možnosti jeho detekce. Klin Onkol 2018;31(2):89-94. (bez IF)
• Rehulka, P., Zahradnikova, M., Rehulkova, H., Dvorakova, P., Nenutil, R., Valik, D., Vojtesek, B., Hernychova, L., Novotny, M. V. Microgradient separation technique for purification and fractionation of permethylated N-glycans prior to mass spectrometric analyses. J Sep Sci 2018;41(9):1973-1982. (IF2017: 2,415)
• Mohtar, M. A., Hernychova, L., O'Neill, R., Lawrence, M., Murray, E., Vojtesek, B., Hupp, T. R. The sequence-specific peptide-binding activity of the protein sulfide isomerase AGR2 directs its' stable binding to the oncogenic receptor EpCAM. Mol Cell Proteomics 2018;17(4):737-763. (IF2017: 5,232)
• Novak, D., Mojovic, M., Pavicevic, A., Zatloukalova, M., Hernychova, L., Bartosik, M., Vacek, J. Electrochemistry and Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy of Cytochrome c and its Heme-Disrupted Analogs. Bioelectrochemistry 2018;119:136-141. (IF2017: 3,789)
• von Muhlinen, N., Horikawa, I., Alam, F., Isogaya, K., Lissa, D., Vojtesek, B., Lane, D. P., Harris, C. C. p53 isoforms regulate premature aging in human cells. Oncogene 2018;37(18):2379-2393. (IF2017: 6,854)
• Kojan, M., Doležalová, I., Koriťáková, E., Mareček, R., Řehák, Z., Hermanová, M., Brázdil, M., Rektor, I. Predictive value of preoperative statistical parametric mapping of regional glucose metabolism in mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis. Epilepsy Behav 2018;79:46–52. (IF2017: 2,6)
• Muller, P., Chan, J. M., Simoncik, O., Fojta, M., Lane, D. P., Hupp, T., Vojtesek, B. Evidence for allosteric effects on p53 oligomerization induced by phosphorylation. Protein Sci 2018;27(2):523-530. (IF2017: 2,41)
• Sommerová, L., Michalová, E., Hrstka, R. Nové možnosti testování chemosenzitivity u nádorových onemocnění. Klin Onkol 2018;31(2):117-124. (bez IF)
• Adam, Z., Chovancová, Z., Nová, M., Fabián, P., Řehák, Z., Koukalová, R., Slávik, M., Pour, L., Krejčí, M., Čermák, A., Král, Z., Mayer, J. Remise „the disease associated/related with immunoglobulin IgG4“ provázeného mnohočetnou lymfadenopatií po léčbě rituximabem a dexametazonem: kazuistika. Vnitř Lék 2018;64(3):290–299. (bez IF)
• Palecek, E., Bartosik, M. Intrinsic Electrocatalysis in DNA. ChemElectroChem 2018;5(6):936-942. (IF2017: 7,446)
• Baert, A., Machackova, E., Coene, I., Cremin, C., Turner, K., Portigal-Todd, C., Asrat, M. J., Nuk, J., Mindlin, A., Sean, Y., MacMillan, A., Van Maerken, T., Trbusek, M., McKinnon, W., Wood, M. E., Foulkes, W. D., Santamariña, M., de la Hoya, M., Foretova, L., Poppe, B., Vral, A., Rosseel, T., De Leeneer, K., Vega, A., Claes, K. B. M. Thorough in silico and in vitro cDNA analysis of 21 putative BRCA1 and BRCA2 splice variants and a complex tandem duplication in BRCA2, allowing the identification of activated cryptic splice donor sites in BRCA2 exon 11. Hum Mutat 2018;39(4):515-526.(IF2017: 5,359)
• Petersson, F., Martinek, P., Vanecek, T., Pivovarcikova, K., Peckova, K., Ondic, O., Perez-Montiel, D., Skenderi, F., Ulamec, M., Nenutil, R., Hora, M., Svoboda, T., Rotterova, P., Dusek, M., Michal, M., Hes, O. Renal Cell Carcinoma With Leiomyomatous Stroma: A Group of Tumors With Indistinguishable Histopathologic Features, But 2 Distinct Genetic Profiles: Next-Generation Sequencing Analysis of 6 Cases Negative for Aberrations Related to the VHL gene. Appl Immunohistochem Mol Morphol 2018;26(3):192-197. (IF2017: 2,042)

• Streit, L., Dražan, L., Schneiderová, M., Kubek, T., Šín, P., Veselý, K., Coufal, O., Veselý, J. Intraoperative fat grafting into the pectoralis and latissimus dorsi muscles - novel modification of autologous breast reconstruction with extended latissimus dorsi flap. Acta Chir Plast 2017;59(2):72-81. (bez IF)
• Cacek, T., Náležinská, M., Chovanec, J. Klinický význam C-reaktivního proteinu v onkogynekologii. Onkologie2017;11(5):224-226. (bez IF)
• Náležinská, M., Škapa, P., Špaček, P., Chovanec, J. Hladkosvalové nádory děložní nejistého maligního potenciálu. Onkologie 2017;11(5):248-255. (bez IF)
• Náležinská, M., Sláma, O., Chovanec, J. Paliativní péče v gynekologické onkologii -komentované kazuistiky. Onkologie 2017;11(5):236-243. (bez IF)
• Jelenek, G., Chovanec, J. Serózní tubární intraepiteliální karcinomy (STIC). Onkologie 2017;11(5):232-235. (bez IF)
• Feranec, J., Chovanec, J. Role hypertermické intraperitoneální chemoterapie v léčbě pokročilého a recidivujícího ovariálního karcinomu. Onkologie 2017;11(5):220-223. (bez IF)
• Dvořáková, M., Pešová, Z., Náležinská, M., Chovanec, J., Dvořák, J. Ošetřovatelská péče o operační ránu po radikální vulvektomii per secundam – komentovaná kazuistika z pohledu nelékařských zdravotnických pracovníků. Onkologie 2017;11(5):244-247. (bez IF)
• Boldrup, L., Troiano, G., Gu, X., Coates, P., Fåhraeus, R., Wilms, T., Norberg-Spaak, L., Wang, L., Nylander, K. Evidence that circulating proteins are more promising than miRNAs for identification of patients with squamous cell carcinoma of the tongue. Oncotarget 2017;8(61):103437-103448. (IF2016: 5,168)
• Gnanasundram, S. V., Pyndiah, S., Daskalogianni, C., Armfield, K., Nylander, K., Wilson, J. B., Fåhraeus, R. PI3Kδ activates E2F1 synthesis in response to mRNA translation stress. Nat Commun 2017;8(1):2103. (IF2016: 12,124)
• Kužel, F., Novotná, A., Adam, J. Syntéza pet radiofarmaka [18f] fluorocholin, vývoj analytických metoda optimalizace obsahu dimethylaminoethanolu v koncovém produktu. Chem Listy 2017;111(9):604-609. (IF2016: 0,387)
• Bernatsky, S.,…Foretova, L. et al. Lupus-related single nucleotide polymorphisms and risk of diffuse large B-cell lymphoma. Lupus Sci Med 2017;4(1):e000187.
• Kuchenbaecker, K. B., ... Foretova, L. et al. Risks of Breast, Ovarian, and Contralateral Breast Cancer for BRCA1 and BRCA2 Mutation Carriers. JAMA 2017;317(23):2402-2416. (IF2016: 44,405)
• Adam, Z., Skřičková, J., Krtička, M., Řehák, Z., Koukalová, R., Šprláková, A., Pour, L., Adamová, Z., Pourová, E., Král, Z. Remise steroid rezistentní Stillovy nemoci při léčbě anakinrou, dokumentovaná FDG-PET/CT vyšetřením. Vnitř Lék 2017;63(12):987-997. (bez IF)
• Hrabovský, Š., Folber, F., Jurová, B., Řehák, Z., Doubek, M. Akutní lymfoblastická leukemie dospělých – případ dlouhého došetřování bolestí kyčlí s překvapivým závěrem: kazuistika. Vnitř Lék 2017;63(5):348-353. (bez IF)
• Chovanec, J., Selingerova, I., Greplova, K., Leisby Antonsen, S., Nalezinska, M., Høgdall, C., Høgdall, E., Søgaard-Andersen, E., Jochumsen, K. M., Fabian, P., Valik, D., Zdrazilova-Dubska, L. Adjustment of serum HE4 to reduced glomerular filtration and its use in biomarker-based prediction of deep myometrial invasion in endometrial cancer. Oncotarget 2017; 8(64):108213-108222. (IF2016: 5,168)
• Chovanec, J., Feranec, R., Náležinská, M., Cacek, T. Chirurgická léčba ovariálního karcinomu. Rozhl Chir 2017;96(6):237-241. (bez IF)
• Coufal, O., Schneiderová, M., Petráková, K., Babánková, I., Selingerová, I. Magnetická rezonance v předoperační diagnostice invazivních lobulárních karcinomů prsu – analýza 230 případů. Rozhl Chir 2017;96(8):340-345. (bez IF)
• Wilms, T., Khan, G., Coates, P. J., Sgaramella, N., Fåhraeus, R., Hassani, A., Philip, P. S., Norberg Spaak, L., Califano, L., Colella, G., Olofsson, K., Loizou, C., Franco, R., Nylander, K. No evidence for the presence of Epstein-Barr virus in squamous cell carcinoma of the mobile tongue. PLoS One 2017;12(9):e0184201. (IF2016: 2,806)
• Gál, B., Veselý, M., Čolláková, J., Nekulová, M., Jůzová, V., Chmelík, R., Veselý, P. Distinctive behaviour of live biopsy-derived carcinoma cells unveiled using coherence-controlled holographic microscopy. PLoS One 2017;12(8):e0183399. (IF2016: 2,806)
• Sommerova, L., Ondrouskova, E., Vojtesek, B., Hrstka, R. Suppression of AGR2 in a TGF-β-induced Smad regulatory pathway mediates epithelial-mesenchymal transition. BMC Cancer 2017;17(1):546. (IF2016: 3,288)
• Kazda, T., Vrzal, M., Prochazka, T., Dvoracek, P., Burkon, P., Pospisil, P., Dziacky, A., Nikl, T., Jancalek, R., Slampa, P., Lakomy, R. Left hippocampus sparing whole brain radiotherapy (WBRT): A planning study. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2017;89(17):8731-8737. (IF2016: 0,894)
• Hrdý, R., Kynclová, H., Klepáčová, I., Bartosik, M., Neuzil, P. Portable Lock-in Amplifier-based Electrochemical Method to Measure an Array of 64 Sensors for Point-of-care Applications. Anal Chem 2017;89(17):8731-8737. (IF2016: 6,32)
• Roy, A., Bystry, V., Bohn, G., Goudevenou, K., Reigl, T., Papaioannou, M., Krejci, A., O'Byrne, S., Chaidos, A., Grioni, A., Darzentas, N., Roberts, I. A. G., Karadimitris, A. High resolution IgH repertoire analysis reveals fetal liver as the likely origin of life-long, innate B lymphopoiesis in humans. Clin Immunol 2017;183:8-16. (IF2016: 3,99)
• López, I., Tournillon, A. S., Prado Martins, R., Karakostis, K., Malbert-Colas, L., Nylander, K., Fåhraeus, R. p53-mediated suppression of BiP triggers BIK-induced apoptosis during prolonged endoplasmic reticulum stress. Cell Death Differ 2017;24(10):1717-1729. (IF2016: 8,339)
• Hodík, T., Lamač, M., Červenková Šťastná, L., Cuřínová, P., Karban, J., Skoupilová, H., Hrstka, R., Císařová, I., Gyepes, R., Pinkas, J. Improving cytotoxic properties of ferrocenes by incorporation of saturated N-heterocycles. J Organomet Chem 2017;846:141-151. (IF2016: 2,184)
• Coufal, O., Ostřížek, T., Krsička, P., Lžičařová, E., Nenutil, R., Procházková, M., Bencsiková, B., Grell, P., Šefr, R. Focal necrosis mimicking breast cancer following coronary bypass grafting. World J Surg Oncol 2017;15(1):111. (IF2016: 1,6)
• Rehak, Z., Sprlakova-Pukova, A., Kazda, T., Fojtik, Z., Vargova, L., Nemec, P. 18F-FDG PET/CT in polymyalgia rheumatica - a pictorial review. Br J Radiol 2017;90(1076):20170198. (IF2016: 2,05)
• Bartošík, M., Bartáková, D. Stanovení DNA metylace v BRCA2 genu na elektrodových biočipech.  In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S149-S152: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Brychtová, V., Šefr, R., Hrstka, R., Vídeňská, P., Bencsiková, B., Hanáková, B., Zdražilová Dubská, L., Nenutil, R., Budinská, E. Molekulární patologie kolorektálního karcinomu, mikrosatelitová nestabilita – způsob detekce, vztah k patofyziologii a prognóze. In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S153-S155: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Greplová, K., Selingerová, I., Valík, D., Pilátová, K., Češková, M., Zdražilová Dubská, L. Laktátdehydrogenáza – starý nádorový marker ve světle současných poznatků a v preanalytických souvislostech. In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S156-S158: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Hrabal, V., Nekulová, M., Nenutil, R., Holčáková, J., Coates, P. J., Vojtěšek, B. Využití metody PLA pro detekci komplexů p53/p63/p73 in situ v nádorových buňkách a nádorové tkáni. In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S159-S162: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Pilátová, K., Budinská, E., Bencsiková, B., Nenutil, R., Šefr, R., Fědorová, L., Hanáková, B., Brychtová, V., Zdražilová Dubská, L. Cirkulující myeloidní supresorové buňky a jejich úloha v nádorové imunologii. In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S166-S169: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Řiháček, M., Valík, D., Vyzula, R., Zdražilová Dubská, L. Je možné pozorovat etnickou diferenci v základních krevních testech? Údaje z programu onkologické prevence v komplexním onkologickém centru v České republice.In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S170-S173: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Sommerová, L., Ďuríková, H., Podhorec, J., Hrstka, R. Analýza mikroRNA u epiteliálního karcinomu vaječníku.  In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S180-S183: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Stuchlíková, E., Zahradníková, M., Nenutil, R., Valík, D., Vojtěšek, B., Novotný, M. V., Hernychová, L. Ascitická tekutina u nádoru vaječníků může poskytnout informace vhodné pro diagnostiku. In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S187-S190: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Vacek, O., Pastorek, M., Ďurech, M., Vojtěšek, B., Müller, P. Diagnostický a terapeutický potenciál membránového Hsp90.  Diagnostický a terapeutický potenciál membránového Hsp90. In: Klin Onkol 2017;30(Suppl1):S191-S194: Sborník abstrakt: XLI. brněnské onkologické dny, XXXI. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Laboratorní diagnostika v onkologii 2017, 26.-28.4.2017. Brno, Česká republika. ISSN 0862-495X.
• Chovanec, J., Náležinská, M., Buriková, M. Biologická léčka jarcinomu ovaria. Acta Medicinae 2017;1:97-100. (bez IF)
• Kasalová, V., Hrstka, R., Hernychová, L., Coufalová, D., Ostatná, V. Chronopotentiometric sensing of anterior gradient 2 protein. Electrochim Acta 2017;240:250-257. (IF2016: 4,798)
• Adam, Z., Ježová, M., Šlampa, P., Křen, L., Vašků, V., Koukalová, R., Řehák, Z., Pour, L., Krejčí, M., Král, Z., Mayer, J. Histiocytóza z indeterminovaných buněk – vymizení kožní infiltrace po ozáření elektronovým svazkem a aplikace 2-chlorodeoxyadenozinu: kazuistika. Vnitř Lék 2017;63(4):284-288. (bez IF)
• Martinková, V., Pastorek, M., Müller, P. Reakce nádorových buněk na oxidativní stres. Klin Onkol 2017;30(2):155. (bez IF)
• Strindlund, K., Troiano, G., Sgaramella, N., Coates, P. J., Gu, X., Boldrup, L., Califano, L., Fahraeus, R., Muzio, L. L., Ardito, F., Colella, G., Tartaro, G., Franco, R., Norberg-Spaak, L., Saadat, M., Nylander, K. Patients with high c-MYC expressing squamous cell carcinomas of the tongue show better survival than those with low and medium expressing tumours. J Oral Pathol Med 2017;46(10):967-971. (IF2016: 2,043)
• Matoulkova, E., Sommerova, L., Pastorek, M., Vojtesek, B., Hrstka, R. Regulation of AGR2 expression via 3´UTR shortening. Exp Cell Res 2017;356(1):40-47. (IF2016: 3,546)
• Hrstka, R., Podhorec, J., Nenutil, R., Sommerova, L., Obacz, J., Durech, M., Faktor, J., Bouchal, P., Skoupilova, H., Vojtesek, B. Tamoxifen-Dependent Induction of AGR2 Is Associated with Increased Aggressiveness of Endometrial Cancer Cells. Cancer Invest 2017;35(5):313-324. (IF2016: 2,007)
• Svrckova, M., Zatloukalova, M., Dvorakova, P., Coufalova, D., Novak, D., Hernychova, L., Vacek, J. Na+/K+-ATPase Interaction with Methylglyoxal as Reactive Metabolic Side Product. Free Radic Biol Med 2017;108:146-154. (IF2016: 5,606)
• Holcakova, J., Nekulova, M., Orzol, P., Nenutil, R., Podhorec, J., Svoboda, M., Dvorakova, P., Pjechova, M., Hernychova, L., Vojtesek, B., Coates, P. J. ΔNp63 activates EGFR signaling to induce loss of adhesion in triple-negative basal-like breast cancer cells. Breast Cancer Res Treat 2017;163(3):475-484. (IF2016: 3,626)
• O'Neill, J. R., Pak, H. S., Pairo-Castineira, E., Save, V., Paterson-Brown, S., Nenutil, R., Vojtěšek, B., Overton, I., Scherl, A., Hupp, T. R. Quantitative shotgun proteomics unveils candidate novel oesophageal adenocarcinoma-specific proteins. Mol Cell Proteomics 2017;16:1138-1150. (IF2016: 6,54)
• Ondrouskova, E., Sommerova, L., Nenutil, R., Coufal, O., Bouchal, P., Vojtesek, B., Hrstka, R. AGR2 associates with HER2 expression predicting poor outcome in subset of estrogen receptor negative breast cancer patients. Exp Mol Pathol 2017;102(2):280-283. (IF2016: 2,423)
• Birmann, B. M., Andreotti, G., De Roos, A. J., Camp, N. J., Chiu, B. C. H., Spinelli, J. J., Becker, N., Benhaim-Luzon, V., Bhatti, P., Boffetta, P., Brennan, P., Brown, E. E., Cocco, P., Costas, L., Cozen, W., de Sanjosé, S., Foretová, L., Giles, G. G., Maynadié, M., Moysich, K., Nieters, A., Staines, A., Tricot, G., Weisenburger, D., Zhang, Y., Baris, D., Purdue, M. P. Young adult and usual adult body mass index and multiple myeloma risk: a pooled analysis in the International Multiple Myeloma Consortium (IMMC). Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2017;26(6):876-885. (IF2016: 4,142)
• Dudova, Z., Bartosik, M., Fojta, M. Magnetic bead-based electrochemical assay for determination of DNA methyltransferase aktivity. Electrochim Acta 2017;231:575–581. (IF2016: 4,798)
• Vrtělová, P., Coufal, O., Fait, V., Gabrielová, L., Zapletal, O. Lymfedém po operacích na spádových lymfatických uzlinách pro karcinom prsu. Klin Onkol 2017;30(1):34-40. (bez IF)
• Procházková, I., Lenčo, J., Fučíková, A., Dresler, J., Čápková, L., Hrstka, R., Nenutil, R., Bouchal, P. Targeted proteomics driven verification of biomarker candidates associated with breast cancer aggressiveness. BBA-Proteins Proteom 2017;1865(5):488-498. (IF2016: 2,773)
• Fielding, C. A., Weekes, M. P., Nobre, L. V., Ruckova, E., Wilkie, G. S., Paulo, J. A., Chang, C., Suárez, N. M., Davies, J. A., Antrobus, R., Stanton, R. J., Aicheler, R. J., Nichols, H., Vojtesek, B., Trowsdale, J., Davison, A. J., Gygi, S. P., Tomasec, P., Lehner, P. J., Wilkinson, G. W. Control of immune ligands by members of a cytomegalovirus gene expansion suppresses natural killer cell activation. Elife 2017;6:pii:e22206. (IF2016: 7,725)
• Cífková, E., Lísa, M., Hrstka, R., Vrána, D., Gatěk, J., Melichar, B., Holčapek, M. Correlation of lipidomic composition of cell lines and tissues of breast cancer patients using hydrophilic interaction liquid chromatography – electrospray ionization mass spectrometry and multivariate data analysis. Rapid Commun Mass Spectrom 2017;31(3):253-263. (IF2016: 1,998)
• Strmecki, S., Trefulka, M., Zatloukalova, P., Durech, M., Vojtesek, B., Palecek, E. Immunoassays of chemically modified polysaccharides, glycans in glycoproteins and ribose in nucleic acids. Anal Chim Acta 2017;955:108-115. (IF2016: 4,95)
• Rehak, Z., Sprlakova-Pukova, A., Bortlicek, Z., Fojtik, Z., Kazda, T., Joukal, M., Koukalova, R., Vasina, J., Eremiasova, J., Nemec, P. PET/CT imaging in polymyalgia rheumatica: Praepubic 18F-FDG uptake correlates with pectineus and adductor longus muscles enthesitis and with tenosynovitis. Radiol Oncol 2017;51(1):8-14. (IF2016: 1,681)
• Galtsidis, S., Logotheti, S., Pavlopoulou, A., Zampetidis, C. P., Papachristopoulou, G., Scorilas, A., Vojtesek, B., Gorgoulis, V., Zoumpourlis, V. Unravelling a p73-regulated network: the role of a novel p73-dependent target, MIR3158, in cancer cell migration and invasiveness. Cancer Lett 2017;388:96-106. (IF2016: 6,375)
• Knizek, J., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Kuba, M., Pavliska, L., Prochazka, V. Computation of Kovanic’s Expectedness Distributions with the Help of Parallel Computing – Basic Version (with Special References of Health and Environment). Int J Ecol Econ Stat 2017;38(1):96-119. (bez IF) 
• Knizek, J., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Kuba, M., Pavliska, L., Prochazka, V. Computation of Kovanic’s Expectedness Distributions with the Help of Parallel Computing – Extended Versions II. - IV. Int J Eng Fut Technol 2017;14(1):1-23. (bez IF)
• Hamdi, Y… Foretova, L. et al. Association of breast cancer risk in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers with genetic variants showing differential allelic expression: identification of a modifier of breast cancer risk at locus 11q22.3. Breast Cancer Res Treat 2017;161:117–134 (IF2016: 3,626)
• Bystry, V., Reigl, T., Krejci, A., Demko, M., Hanakova, B., Grioni, A., Knecht, H., Schlitt, M., Dreger, P., Sellner, L., Herrmann, D., Pingeon, M., Boudjoghra, M., Rijntjes, J., Pott, C., Langerak, A. W., Groenen, P. J., Davi, F., Brüggemann, M., Darzentas, N.; also on behalf of EuroClonality-NGS. ARResT/Interrogate: an interactive immunoprofiler for IG/TR NGS data. Bioinformatics 2017;33(3):435-437. (IF2016: 7,607)
• Tournillon, A., Lopez, I., Malbert-Colas, L., Findakly, S., Naski, N., Olivares-Illana, V., Karakostis, K., Vojtesek, B., Nylander, K., Fahraeus, R. p53 binds the mdmx mRNA and controls its translation. Oncogene 2017;36(5):723-730. (IF2016: 7,519)
• Faktor, J., Suchá, R., Páralová, V., Liu, Y., Bouchal, P. Comparison of targeted proteomics approaches for detecting and quantifying proteins derived from human cancer tissues. Proteomics 2017;17(5):1600323. (IF2016: 4,041)
• Boldrup, L., Gu, X., Coates, P. J., Norberg-Spaak, L., Fahraeus, R., Laurell, G., Wilms, T., Nylander, K. Gene expression changes in tumor free tongue tissue adjacent to tongue squamous cell carcinoma. Oncotarget 2017;8(12):19389-19402. (IF2016: 5,168) 
• Skoupilova, H., Hrstka, R., Bartosik, M. Titanocenes as anticancer agents: recent insights. Med Chem 2017;13(4):334-344. (IF2016: 2,331)
• Bartosik, M, Hrstka, R. Electrochemistry of nucleic acids for early cancer diagnostics - analysis of DNA methylation and detection of microRNAs. Rev Anal Chem 2017;36(1):20160022. (IF2016: 1,917) 

• Pavlíková, L., Dymáčková, R., Šlampa, P. Paliativní radioterapie nemalobuněčného karcinomu plic. In: Petruželka a kol. Nemalobuněčný karcinom plic. 1. vydání - Farmakon Press, 2016. s. 56-60. ISBN: 978-80-906589-1-2.
• Petráková, K. Léčba HER2-pozitivního metastatického karcinomu prsu v podmínkách České republiky. Farmakoterapie 2016;12(2):301-305. (bez IF)
• Chovanec, J., Náležinská, M., Jelenek, G., Feranec, R. Nová léčiva v terapii ovariálního karcinomu aneb proč zůstává základem primární radikální operační výkon. Postgraduální medicína 2016;18(2):133-139. (bez IF)
• Chovanec, J. Cílená (biologická) léčba a její využití u karcinomu ovaria. Acta medicinae 2016;1(10):13-17. (bez IF)
• Takacova, M., Hlouskova, G., Zatovicova, M., Benej, M., Sedlakova, O., Kopacek, J., Pastorek, J., Lacik, I., Pastorekova, S. Encapsulation of anti-carbonic anhydrase IX antibody in hydrogel microspheres for tumor targeting. J Enzyme Inhib Med Chem 2016;31(sup1):110-118. (IF2015: 3,428)
• Krupa, P., Slampa, P. Moderní radikální radioterapie karcinomu prostaty a její možná rizika. Postgraduální medicína 2016;2:65-68. (bez IF)
• Koukalová, R., Nenutil, R., Řehák, Z. Méně obvyklý způsob diagnostiky karcinomu prsu. Klin Onkol 2016; 29(6: 476-477. (bez IF)
• Faktor, J., Suchá, R., Páralová, V., Liu, Y., Bouchal, P. Comparison of targeted proteomics approaches for detecting and quantifying proteins derived from human cancer tissues.Proteomics 2016 (accepted). (IF2015: 4,079)
• Fabian, P., Nenutil, R. Karcinomy prsu u nosiček mutací BRCA1/2. Cesk Patol 2016; 52(4): 206–209. (bez IF)
• Coufal, O. Možnost eliminace axilárních disekcí u pacientek s karcinomem prsu pomocí neoadjuvantní léčby. Rozhl Chir 2016;95(11):381-385. (bez IF)
• Coufal, O., Fait, V. Use of indocyanine green and the HyperEye system for detecting sentinel lymph nodes in breast cancer within a population of European patients: a pilot study. World J Surg Oncol 2016;14(1):299. (IF2015: 1,286)
• Lujan-Barroso, L., Zhang, W., Olson, S. H., Gao, Y. T., Yu, H., Baghurst, P. A., Bracci, P. M., Bueno-de-Mesquita, H. B., Foretová, L., Gallinger, S., Holcatova, I., Janout, V., Ji, B. T., Kurtz, R. C., La Vecchia, C., Lagiou, P., Li, D., Miller, A. B., Serraino, D., Zatonski, W., Risch, H. A., Duell, E. J. Menstrual and Reproductive Factors, Hormone Use, and Risk of Pancreatic Cancer: Analysis From the International Pancreatic Cancer Case-Control Consortium (PanC4). Pancreas 2016;45(10):1401-1410. (IF2015: 2,738)
• Rebbeck, T. R…. Foretová, L., et al. Inheritance of deleterious mutations at both BRCA1 and BRCA2 in an international sample of 32,295 women. Breast Cancer Res 2016;18:112. (IF2015: 5,211)Petráková, K. Lobulární karcinom prsu. Onkologie 2016; 10(4): 166–169. (bez IF)
• Petráková, K. Lobulární karcinom prsu. Onkologie 2016; 10(4): 166–169. (bez IF)
• Bednaříková, M., Weinberger, V., Minář, L., Bednařík, O., Jandáková, E., Hausnerová, J., Řehák, Z., Bohatá. Š., Valík, D., Ostřížková, L., Brančíková, D. Metastatický primárně neresekabilní karcinom tlustého střeva manifestovaný v graviditě u 38leté pacientky pod klinickým obrazem karcinomu ovaria. Onkologie 2016;10(2):102–106. (bez IF)
• MacLeod, A. K., Acosta-Jimenez, L., Coates, P. J., McMahon, M., Carey, F. A., Honda, T., Henderson, C. J., Wolf, C. R. Aldo-keto reductases are biomarkers of NRF2 activity and are co-ordinately overexpressed in non-small cell lung cancer. Br J Cancer 2016;115(12):1530-1539. (IF2015: 5,569)
• Sommerová, L., Ondroušková, E., Hrstka, R. Cancer Cells as Dynamic System – Molecular and Phenotypic Changes During Tumor Formation, Progression and Dissemination. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S6–4S11. (bez IF)
• Ondroušková, E., Sommerová, L., Hrstka, R. Multistep Process of Establishing Carcinoma Metastases. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S12–4S17. (bez IF)
• Trčka, F., Müller, P., Vojtěšek, B. Mechanisms of Protein Homeostasis Regulation in Cancer Development. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S18–4S24. (bez IF)
• Brychtová, V., Vojtěšek, B. Endoplasmic Reticulum Chaperones at the Tumor Cell Surface and in the Extracellular Space. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S25–4S30. (bez IF)
• Černochová, R., Nekulová, M., Holčáková, J. Rab Proteins, Intracellular Transport and Cancer. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S31–4S39. (bez IF)
• Pastorek, M., Müller, P., Vojtěšek, B. Impact of HSP90 Inhibition on Viability and Cell Cycle in Relation to p53 Status. Klin Onkol 201629 (Suppl 4):4S40–4S45. (bez IF)
• Müllerová, Z., Müller, T., Křivánková, K., Vojtěšek, B., Müller, P. Molecular Mechanisms of Carcinogenesis of Epithelial Ovarian Cancers. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S46–4S53. (bez IF)
• Faktor, J., Bouchal, P. Building Mass Spectrometry Spectral Libraries of Human Cancer Cell Lines. Klin Onkol2016;29(Suppl 4):4S54–4S58. (bez IF)
• Coufalová, D., Vojtěšek, B., Hernychová, L. Utilization of Hydrogen/Deuterium Exchange in Biopharmaceutical Industry. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S59–4S63. (bez IF)
• Bartošík, M., Ondroušková, E. Novel Approaches in DNA Methylation Studies – MS-HRM Analysis and Electrochemistry. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S64–4S71. (bez IF)
• Zatloukalová, P., Pjechová, M., Babčanová, S., Hupp, T. R., Vojtěšek, B. The Role of PD-1/PD-L1 Signaling Pathway in Antitumor Immune Response. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S72–4S77. (bez IF)
• Bílek, O., Bohovicová, L., Demlová, R., Poprach, A., Lakomý, R., Zdražilová-Dubská, L. Non-Small Cell Lung Cancer – from Immunobiology to Immunotherapy. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S78–4S87. (bez IF)
• Hernychová, L., Coufalová, D., Michalová, E., Nenutil, R., Vojtěšek, B. New Technologies for In Vivo Cancer Diagnostics. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S88–4S94. (bez IF)
• Adam, J., Demlová, R., Řehák, Z. Current Progresses in Developing PET Radiopharmaceuticals for Patients in the Czech Republic. Klin Onkol 2016;29(Suppl 4):4S95–4S100. (bez IF)
• Bencsiková, B. Antiproliferační účinek analog somatostatinu – analýza dat a kliniké aplikace v kontextu výsledků studie CLARINET. Klin Onkol 2016;29(4):253-258. (no IF)
• Nekulova, M., Holcakova, J., Gu, X., Hrabal, V., Galtsidis, S., Orzol, P., Liu, Y., Logotheti, S., Zoumpourlis, V., Nylander, K., Coates, P. J., Vojtesek, B.  ΔNp63α expression induces loss of cell adhesion in triple-negative breast cancer cells. BMC Cancer 2016:16(1):782. (IF2015: 3,265)
• Adam, Z., Šedivá, A., Koukalová, R., Řehák, Z., Petrášová, H., Szturz, P., Adamová, Z., Vetešníková, E., Pour, L., Krejčí, M., Sandecká, V., Pourová, E., Čermáková, Z., Ševčíková, S., Král, Z., Mayer, J.  Schnitzlerové syndrom: Diferenciální diagnostika, přehled léčebných možností a popis 5 případů léčených anakinrou. Vnitř Lék2016;62(9):713–727. (no IF)
• Petráková, K., Krásenská, M., Valík, D., Holánek, M., Palácová, M., Demlová, R. Sledování cirkulujících hladin estradiolu u pacientek s karcinomem prsu léčených inhibitory aromatázy – přínos v klinické praxi. Klin Onkol 2016;29(Suppl 3):3S50-3S57. (no IF)
• Petráková, K., Holánek, M. Těhotenství po léčbě karcinomu prsu. Klin Onkol 2016;29(Suppl 3):3S23-3S28. (bez IF)
• Lawrenson K, …Foretova, L. et al. Functional mechanisms underlying pleiotropic risk alleles at the 19p13.1 breast-ovarian cancer susceptibility locus. Nat Commun 2016;7:12675. (IF2015: 11,329)
• Gu, X., Boldrup, L., Coates, P. J., Fahraeus, R., Nylander, E., Loizou, C., Olofsson, K., Norberg-Spaak, L., Gärskog, O., Nylander, K. Epigenetic regulation of OAS2 shows disease-specific DNA methylation profiles at individual CpG sites. Sci Rep 2016;6:32579. (IF2015: 5,228)
• Adam Z, Mašlaň J, Křen L, Kodet R, Koukalová R, Řehák Z, Červinek L, Pour L, Krejčí M, Sandecká V, Král Z, Mayer J. Sinusová histiocytóza s masivní lymfadenopatií: FDG-PET/CT dokumentovaná parciální remise po léčbě 2-chlorodeoxyadenozinem. Vnitř Lék 2016;62(6):491-499. (no IF)
• Rump, A., Benet-Pages, A., Schubert, S., Kuhlmann, J. D., Janavičius, R., Macháčková, E., Foretová, L., Kleibl, Z., Lhota, F., Zemankova, P., Betcheva-Krajcir, E., Mackenroth, L., Hackmann, K., Lehmann, J., Nissen, A., DiDonato, N., Opitz, R., Thiele, H., Kast, K., Wimberger, P., Holinski-Feder, E., Emmert, S., Schröck, E., Klink, B.Identification and Functional Testing of ERCC2 Mutations in a Multi-national Cohort of Patients with Familial Breast- and Ovarian Cancer. PLoS Genet 2016;12(8):e1006248. (IF2015: 6,661)
• Sgaramella, N., Lindell Jonsson, E., Boldrup, L., Califano, L., Coates, P. J., Tartaro, G., Lo Muzio, L., Fåhraeus, R., Colella, G., Dell'Aversana Orabona, G., Loljung, L., Santagata, M., Rossiello, R., Wilms, T., Danielsson, K., Laurell, G., Nylander, K. High expression of podoplanin in squamous cell carcinoma of the tongue occurs predominantly in patients ≤40 years but does not correlate with tumour spread. J Pathol Clin Res 2016;2(1):3-8. (IF2015: 7,381)
• Adam, Z., Starý, K., Kubinyi, J., Zajíčková, K., Řehák, Z., Koukalová, R., Tomíška, M., Doubková, M., Prášek, J., Pourová, E., Čermáková, Z., Pour, L., Krejčí, M., Sandecká, V., Ševčíková, E., Ševčíková, S., Král, Z., Čermák, A. Hyperkalcémie, příznaky, diferenciální diagnostika a léčba anb důležitost vyšetřování kalcia. Vnitř Lék 2016;62(5):370-383. (no IF)
• Behrens, T., Groß, I., Siemiatycki, J., Conway, D. I., Olsson, A., Stücker, I., Guida, F., Jöckel, K. H., Pohlabeln, H., Ahrens, W., Brüske, I., Wichmann, H. E., Gustavsson, P., Consonni, D., Merletti, F., Richiardi, L., Simonato, L., Fortes, C., Parent, M. E., McLaughlin, J., Demers, P., Landi, M. T., Caporaso, N., Zaridze, D., Szeszenia-Dabrowska, N., Rudnai, P., Lissowska, J., Fabianova, E., Tardón, A., Field, J. K., Dumitru, R. S., Bencko, V., Foretova, L., Janout, V., Kromhout, H., Vermeulen, R., Boffetta, P., Straif, K., Schüz, J., Hovanec, J., Kendzia, B., Pesch, B., Brüning, T. Occupational prestige, social mobility and the association with lung cancer in men. BMC Cancer 2016;16(1):395. (IF2015: 3,265)
• Machiela, M. J.,... Foretova, L. et al. Genetically predicted longer telomere length is associated with increased risk of B-cell lymphoma subtypes. Hum Mol Genet 2016;25(8):1663-1676. (IF2015: 5,985)
• Hároníková, L., Coufal, J., Kejnovská, I., Jagelská, E. B., Fojta, M., Dvořáková, P., Muller, P., Vojtesek, B., Brázda, V. IFI16 Preferentially Binds to DNA with Quadruplex Structure and Enhances DNA Quadruplex Formation. PLoS One 2016;11(6):e0157156. (IF2015: 3,057)
• Koukalová, R., Szturz, P., Svobodová, I., Stulík, J., Řehák, Z. Ložisková amyloidóza v dutině nosní. Klin Onkol2016;29(3):216-219. (no IF)
• Nenutil, R. Karcinom prsu s aktivní imunoeditací a aktivací imunitní kontrolní dráhy PD-L1/ PD-1. Klin Onkol2016;29(3):238-239. (no IF)
• Nenutil, R. Sekvence adenom-karcinom v polypu tlustého střeva s mutací p53. Klin Onkol 2016;29(2):155-156. (bez IF)
• Way L, Faktor J, Dvorakova P, Nicholson J, Vojtesek B, Graham D, Ball KL, Hupp T. Rearrangement of Mitochondrial Pyruvate Dehydrogenase Subunit Dihydrolipoamide Dehydrogenase Protein-Protein Interactions by the MDM2 Ligand Nutlin-3. Proteomics 2016 [Epub ahead of print] (IF2015: 4,079)
• Apcher, S., Prado Martins, R., Fåhraeus, R. The source of MHC class I presented peptides and its implications.Curr Opin Immunol 2016;40:117-122. (IF2015: 7,126)
• Knizek, J., Bouchal, P., Pernikarova, V., Vojtesek, B., Nenutil, R., Beranek, L., Kuba, M. Tests of Hypotheses in a Set of LC-MS Profiles. International Journal of Engineering and Future Technology 2016;2(1):45-54. (no IF)
• Jancekova, B., Ondrouskova, E., Knopfova, L., Smarda, J., Benes, P. Enzymatically active cathepsin D sensitizes breast carcinoma cells to TRAIL. Tumour Biol 2016;37(8):10685-10696. (IF2015: 2,926)
• Turnquist, C., Horikawa, I., Foran, E., Major, E. O., Vojtesek, B., Lane, D. P., Lu, X., Harris, B. T., Harris, C. C. p53 isoforms regulate astrocyte-mediated neuroprotection and neurodegeneration. Cell Death Differ 2016;23(9):1515-1528. (IF2015: 8,218)
• Rehak, Z., Vasina, J., Ptacek, J., Kazda, T., Fojtik, Z., Nemec, P. PET/CT in giant cell arteritis: High 18F-FDG uptake in the temporal, occipital and vertebral arteries. Rev Esp Med Nucl Imagen Mol 2016;35(6):398–401. (IF2015: 0,983)
• Horník, Š., Červenková Šťastná, L., Cuřínová, P., Sýkora, J., Káňová, K., Hrstka, R., Císařová, I., Dračínský, M., Karban, J. Synthesis and in vitro cytotoxicity of acetylated 3-fluoro, 4-fluoro and 3,4-difluoro analogs of D-glucosamine and D-galactosamine. Beilstein J Org Chem 2016;12:750–759. (IF2015: 2,697)
• Bartosik, M., Durikova, H., Vojtesek, B., Anton, M., Jandakova, E., Hrstka, R. Electrochemical chip-based genomagnetic assay for detection of high-risk human papillomavirus DNA. Biosens Bioelectron 2016;83:300-305. (IF2015: 7,476)
• Berndt, S. I.,…Foretova, L., et al. Meta-analysis of genome-wide association studies discovers multiple loci for chronic lymphocytic leukemia. Nat Commun 2016;7:10933. (IF2015: 11,329)
• Krupa, P., Ticha, H., Kazda, T., Dymackova, R., Zitterbartova, J., Odlozilikova, A., Kominek, L., Bobek, L., Kudlacek, A., Slampa, P. Early toxicity of hypofractionated radiotherapy for prostate cancer. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2016;160(3):435-441. (IF2015: 0,924)
• Vidlickova, I., Dequiedt, F., Jelenska, L., Sedlakova, O., Pastorek, M., Stuchlik, S., Pastorek, J., Zatovicova, M., Pastorekova, S. Apoptosis-induced ectodomain shedding of hypoxia-regulated carbonic anhydrase IX from tumor cells: a double-edged response to chemotherapy. BMC Cancer 2016;16(1):239. (IF2015: 3,265)
• Gibadulinova, A., Pastorek, M., Filipcik, P., Radvak, P., Csaderova, L., Vojtesek, B., Pastorekova, S. Cancer-associated S100P protein binds and inactivates p53, permits therapy-induced senescence and supports chemoresistance. Oncotarget 2016;7(16):22508-22522. (IF2015: 5,008)
• Durech, M., Trcka, F., Man, P., Blackburn, E. A., Hernychova, L., Dvorakova, P., Coufalova, D., Kavan, D., Vojtesek, B., Muller, P. Novel entropically driven conformation-specific interactions with Tomm34 modulate Hsp70 folding and ATPase activities. Mol Cell Proteomics 2016;15(5):1710-1727. (IF2015: 5,912)
• Rehak, Z., Bencsikova, B., Zambo, I., Kazda, T. Fibrous Dysplasia Presenting as a Cold Spot in 18F-FLT PET/CT Imaging. Clin Nucl Med 2016;41(6):510-511. (IF2015: 4,278)
• Šlampa, P., Smilek, P. et al. Nádory hlavy a krku. Mladá fronta a.s., 2016, s. 261. ISBN 978-80-204-3743-3.
• Silvestr, i V., ... Foretova, L., et al. Male breast cancer in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers: pathology data from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2. Breast Cancer Res 2016;18(1):15. (IF2015: 5,211)
• Clarke, D. J., Murray, E., Faktor, J., Mohtar, A., Vojtesek, B., MacKay, C. L., Smith, P. L., Hupp, T. R. Mass spectrometry analysis of the oxidation states of the pro-oncogenic protein anterior gradient-2 reveals covalent dimerization via an intermolecular disulphide bond. Biochim Biophys Acta 2016;1864(5):551-561. (IF2015: 3,016)
• Jain, S., Aresu, L., Comazzi, S., Shi, J., Worrall, E., Clayton, J., Humphries, W., Hemmington, S., Davis, P., Murray, E., Limeneh, A. A., Ball, K., Ruckova, E., Muller, P., Vojtesek, B., Fahraeus, R., Argyle, D., Hupp, T. R.The Development of a Recombinant scFv Monoclonal Antibody Targeting Canine CD20 for Use in Comparative Medicine. PLoS One 2016;11(2):e0148366. (IF2015: 3,057)
• Selingerová, I., Doleželová, H., Horová, I., Katina, S., Zelinka, J. Survival of Patients with Primary Brain Tumors: Comparison of Two Statistical Approaches. PLoS One 2016;11(2):e0148733. (IF2015: 3,057)
• Orzol, P., Nekulova, M., Holcakova, J., Muller, P., Vojtesek, B., Coates, P. J. ΔNp63 regulates cell proliferation, differentiation, adhesion, and migration in the BL2 subtype of basal-like breast cancer. Tumor Biol 2016;37(8):10133-10140. (IF2015: 2,926)
• Kontsekova, S., Polcicova, K., Takacova, M., Pastorekova, S. Endosialin: molecular and functional links to tumor angiogenesis. Neoplasma 2016;63(2):183-192. (IF2015: 1,961)
• Hajduskova, E., Litera, I., Papousek, I., Costa, F. C., Novakova, M., Labruna, M. B., Zdrazilova-Dubska, L. ‘Candidatus Rickettsia mendelii’, a novel basal group rickettsia detected in Ixodes ricinus ticks in the Czech Republic. Ticks Tick-Borne Dis 2016;7(3):482-486. (IF2015: 2,690)
• Karakostis, K., Ponnuswamy, A., Fusée, L. T., Bailly, X., Laguerre, L., Worall, E., Vojtesek, B., Nylander, K., Fåhraeus, R. p53 mRNA and p53 protein structures have evolved independently to interact with MDM2. Mol Biol Evol 2016;33(5):1280-1292. (IF2015: 13,649)
• Costas, L., Lambert, B. H., Birmann, B. M., Moysich, K. B., De Roos, A. J., Hofmann, J. N., Baris, D., Wang, S. S., Camp, N. J., Tricot, G., Atanackovic, D., Brennan, P., Cocco, P., Nieters, A., Becker, N., Maynadie, M., Foretova, L., Boffetta, P., Staines, A., Brown, E. E., de Sanjose, S. A pooled analysis of reproductive factors, exogenous hormone use and risk of multiple myeloma among women in the International Multiple Myeloma Consortium. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2016;25(1):217-221. (IF2015: 3,622)
• Knizek, J., Sindelar, J., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Beranek, L., Kuba, M. Tests of Hypotheses in a Set of Spectral Courses Alias Marker Statistics. Int J Stat Econ 2016;17(1):50-72. (no IF)
• Novakova, V., Sandhu, G. S., Dragomir-Daescu, D., Klabusay, M. Apelinergic system in endothelial cells and its role in angiogenesis in myocardial ischemia. Vasc Pharmacol 2016;76:1–10. (IF2014: 3,635) 
• Macháčková, E., Házová, J., Sťahlová Hrabincová, E., Vašíčková, P., Navrátilová, M., Svoboda, M., Foretová, L. Retrospective NGS Study in High-risk Hereditary Cancer Patients at Masaryk Memorial Cancer Institute. Klin Onkol 2016;29(Suppl1):S35-S45. (no IF)
• Dvořáková, M., Jeřábková, J., Procházková, I., Lenčo, J., Nenutil, R., Bouchal, P. Transgelin is upregulated in stromal cells of lymph node positive breast cancer. J Proteomics 2016;132:103-111. (IF2015: 2,500)
• Pavliska, L., Knizek, J., Prochazka, V., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Beranek, L. Gnostical “t-tests” - Promising Evaluation Method of Some Medicine and Biological Data. Int J Ecol Econ Stat 2016;37(1):80-94. (no IF)
• Krejci, A., Hupp, T., Lexa, M., Vojtesek, B., Muller, P. Hammock: a hidden Markov model-based peptide clustering algorithm to identify 5 protein-interaction consensus motifs in large datasets. Bioinformatics 2016;32(1):9-16. (IF2015: 5,766)
• Kratochvíla, J., Jiřík, R., Bartoš, M., Standara, M., Starčuk, Z. Jr, Taxt, T. Distributed capillary adiabatic tissue homogeneity model in parametric multi-channel blind AIF estimation using DCE-MRI. Magn Reson Med 2016;75(3):1355-1365. (IF2015: 3,782)
• Hrstka, R., Bouchalova, P., Michalova, E., Matoulkova, E., Muller, P., Coates, P. J., Vojtesek, B. AGR2 oncoprotein inhibits p38MAPK and p53 activation through a DUSP10-mediated regulatory pathway. Mol Oncol 2016;10(5):652–662. (IF2015: 5,367)
• Fåhraeus, R., Marin, M., Olivares-Illana, V. Whisper mutations: cryptic messages within the genetic code. Oncogene 2016;35(29):3753-3759. (IF2015: 7,932)

• Justan, I., Coufal, O., Gabrielová, L., Zapletal, O., Hýža, P., Krsička, P. Patient satisfaction after two stage immediate breast reconstruction – retrospective study. Acta Chir Plast 2015 Winter;57(3-4):69. (bez IF)
• Justan, I., Coufal, O., Gabrielová, L. Complication of immediate two stage breast reconstruction after mastectomy. Acta Chir Plast 2015 Winter;57(3-4):70-71. (bez IF)
• Obermannová, R., Melichárková, K., Vyzula, R. New agents for treatment of gastric cancer. Onkologie2015;9(6):277-281. (no IF)
• Klabusay, M. Úloha regulačních T buněk v protinádorové imunitní odpovědi. Klin Onkol 2015; 28(Suppl4):4S23-4S27. (no IF)
• Justan, I., Coufal, O. Estetická operace prsu. Onkologická revue 2015;Květen 2015:41-43. ISBN 978-80-905979-3-8. (no IF)
• Lordick, F., Obermannová, R. Novel targets and treatment of advanced gastrin cancer: chat exists and chat comes next. Onkologická Revue 2015;září 2015:38-43. ISBN 978-80-905979-7-6. (no IF)
• Obermannová, R. Paliativní systémová léčba u karcinomu žaludku a gastroezofageální junkce. Onkologická Revue 2015;září 2015:32-37. ISBN 978-80-905979-7-6. (no IF)
• Bencsiková, B. Perioperační chemoterapie a neadjuvantní léčba lokálně pokročilých nádorů žaludku a gastroezofageální junkce. Onkologická Revue 2015;září 2015:20-25. ISBN 978-80-905979-7-6. (no IF) 
• Coufal, O., Palácová, M., Petráková, K., Žaloudík, J. Nádory prsu v období senia. In: Matějovská Kubešová, H., Kiss., I. (eds): Geriatrická onkologie. Mladá fronta a.s., Praha 2015, s. 190-205, ISBN 978-80-204-3738-9.
• Valík, D., Zdražilová Dubská, L. Klinické využití solubilních nádorových markerů. In: Tomášek, J. a kol.: Onkologie - minimum pro praxi. 1. vyd. Praha; Axonite CZ 2015, ISBN 978-80-88046-01-1, s. 39–43.
• Chovanec, J. Nejčastější gynekologické nádory. In: Tomášek, J. a kol.: Onkologie - minimum pro praxi. 1. vyd. Praha; Axonite CZ 2015, ISBN 978-80-88046-01-1, s. 298–310.
• López, I., Tournillon, A. S, Fåhraeus, R. p53-mediated control of gene expression via mRNA translation during Endoplasmic Reticulum stress. Cell Cycle 2015;14(21):3373-3378. (IF2014: 4,565)
• Chovanec, J. Olaparib v léčbě karcinomu vaječníků. Farmakoterapie 2015;11(5):642-644. (no IF)
• Chovanec, J. Nová léčebná modalita karcinomu ovaria. Acta medicinae 2015;4(1):19-21. (no IF)
• Coufalova, D., Michalova, E., Vojtesek, B., Hernychova, L. Hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry and its utilization. Mil Med Sci Lett (Voj Zdrav Listy) 2015;84(4):146-151. (no IF)
• Pavlová, T., Novák, J., Bienertová-Vašků, J. The role of visfatin (PBEF/Nampt) in pregnancy complications. J Reprod Immunol 2015;112:102-110. (IF2014: 2,815)
• Apcher, S., Daskalogianni, C., Fahraeus, R. Pioneer translation products as an alternative source for MHC-I antigenic peptides. Mol Immunol 2015;68(2 Pt A):68-71. (IF2014: 2,973)
• Rehak, Z., Vasina, J., Nemec, P., Fojtik, Z., Koukalova, R., Bortlicek, Z., Rehakova, D., Adam, J., Vavrusova, A., Adam, Z. Various forms of 18F-FDG PET and PET/CT findings in patients with polymyalgia rheumatica.Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2015;159(4):629-636. (IF2014: 1,661)
• Mikulenkova, E., Neradil, J., Zitterbart, K., Sterba, J., Veselska, R. Overexpression of the ∆Np73 isoform is associated with centrosome amplification in brain tumor cell lines. Tumour Biol 2015;36(10):7483-7491. (IF2014: 3,611)
• Neradil, J., Veselska, R. Nestin as a marker of cancer stem cells. Cancer Sci 806(7):803-811. (IF2014: 3,523)
• Costas, L., Lambert, B. H., Birmann, B. M., Moysich, K. B., De Roos, A. J., Hofmann, J. N., Baris, D., Wang, S. S., Camp, N. J., Tricot, G., Atanackovic, D., Brennan, P., Cocco, P., Nieters, A., Becker, N., Maynadie, M., Foretova, L., Boffetta, P., Staines, A., Brown, E. E., de Sanjose, S. A pooled analysis of reproductive factors, exogenous hormone use and risk of multiple myeloma among women in the International Multiple Myeloma Consortium.Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2015. [Epub ahead of print] (IF2014: 4,125)
• Obermannova, R., Dusek, L., Greplova, K., Jarkovsky, J., Sterba, J., Vyzula, R., Demlova, R., Zdrazilova-Dubska, L., Valik, D. Time-course pattern of blood 25-hydroxycholecalciferol is a significant predictor of survival outcome in metastatic colorectal cancer: a clinical practice-based study. Neoplasma 2015;62(6):958-965. (IF2014: 1,865)
• Nenutil, R. A revolution postponed indefinitely. WHO classification of tumors of the breast 2012: the main changes compared to the 3rd edition (2003). Cesk Patol 2015;51(1):23-25. (bez IF)
• Pernikářová, V., Bouchal, P. Targeted proteomics of solid cancers: From quantification of known biomarkers towards reading the digital proteome maps. Expert Rev Proteomics 2015;12(6):651-667. (IF2014: 2,896)
• Coufal, O., Fait, V., Lžičařová, E., Chrenko, V., Žaloudík, J. SentiMag – the magnetic detection system of sentinel lymph nodes in breast cancer. Rozhl Chir 2015;94(7):283-288. (no IF)
• Narayan, V., Landré, V., Ning, J., Hernychova, L., Muller, P., Verma, C., Walkinshaw, M. D., Blackburn, E. A., Ball, K. L. Protein:protein Interactions Modulate the Docking-­Dependent E3-Ubiquitin Ligase Activity of CHIP. Mol Cell Proteomics 2015;14(11):2973-2987. (IF2014: 6,564)
• Coufalová, D., Vojtěšek, B., Hernychová, L. Co může přinést studium oligomerizace proteinů v procesu onkogeneze? Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S6-2S10. (no IF)
• Dvořáková, P., Nekulová, M., Holčáková, J., Vojtěšek, B., Hernychová, L. Analýza změn fosfoproteomu nádorové buněčné linie MDA-MB-468 v odpovědi na expresi izoforem p63 pomocí hmotnostní spektrometrie. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S11-2S19. (no IF)
• Zahradníková, M., Vojtěšek, B., Hernychová, L. „Cukry zasahují“ aneb glykomika na poli nádorových biomarkerů. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S20-2S25. (no IF)
• Pastorek, M., Müller, P., Vojtěšek, B. Nrf2 – dve tváre regulátora antioxidačného systému. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S26-2S31. (no IF)
• Procházková, I., Vojtěšek, B. Polo-like kináza 1 jako cíl protinádorové terapie. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S32-2S39. (no IF)
• Maryáš, J., Bouchal, P PDLIM2 a jeho role v onkogenezi – tumor supresor nebo onkoprotein? Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S40-2S46. (bez IF)
• Melichárková, K., Neradil, J., Múdry, P., Zitterbart, K., Obermannová, R., Skotáková, J., Veselská, R., Štěrba, J.Profil aktivace receptorových tyrozinkináz a mitogenem aktivovaných proteinkináz v terapii Maffucciho syndromu. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S47-2S51. (no IF)
• Růčková, E., Müller, P., Vojtěšek, B. Rekombinantní protilátky a jejich využití v protinádorové terapii. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S52-2S59. (no IF)
• Cibulka, M., Selingerová, I., Fědorová, L., Zdražilová-Dubská, L. Imunologické aspekty v onkologii – cirkulující γδ T lymfocyty. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S60-2S68. (no IF)
• Ondroušková, E., Hrstka, R. Cirkulující nádorová DNA v krvi a její využití jako potenciálního bio markeru nádorových onemocnění. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S69-2S74. (no IF)
• Pjechová, M., Hernychová, L., Tomašec, P., Wilkinson, G. W., Vojtěšek, B. Adenovírusové vektory v génovej terapii. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S75-2S80. (no IF)
• Bajčiová, V., Onderčová Z., Kodytková D. Nádory u adolescentů. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S81-2S90.  (no IF)
• Krejčí, A., Müller, P., Vojtěšek, B. Bioinformatika a sekvenování nové generace. Klin Onkol 2015;28(Suppl 2):2S91-2S96. (no IF)
• Knizek, J., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Beranek, L. Gnostical p-Value and Gnostical Power of Test – Promising Evaluation Method of Some Medicine and Biological Data. Int J Ecol Econ Stat 2015;36(3):49-67. (no IF)
• Bartošík, M., Koubková, L., Karban, J., Červenková Šťastná, L., Hodík, T., Lamač, M., Pinkas, J., Hrstka, R.Electrochemical analysis of novel ferrocene derivative as a potential antitumor drug. Analyst 2015;140(17):5864-5867. (IF2014: 4,107)
• Koubkova, L., Vyzula, R., Karban, J., Pinkas, J., Ondrouskova, E., Vojtesek, B., Hrstka, R. Evaluation of cytotoxic activity of titanocene difluorides and determination of their mechanism of action in ovarian cancer cells. Invest New Drugs 2015;33(5):1123-1132. (IF2014: 2,919)
• Pernikářová, V., Sedláček, V., Potěšil, D., Procházková, I., Zdráhal, Z., Bouchal, P., Kučera, I. Proteome-wide dataset generated by iTRAQ-3DLCMS/MS technique for studying the role of FerB protein in oxidative stress inParacoccus denitrificans. Data in Brief 2015:4:390-394. (bez IF)
• Rihacek, M., Bienertova-Vasku, J., Valik, D., Sterba, J., Pilatova, K., Zdrazilova-Dubska, L. Cell Activating Factor as a Cancer Biomarker and Its Implications in Cancer-Related Cachexia. BioMed Res Int 2015;2015:792187. (IF2014: 1,579)
• Řiháček, M., Pilátová, K., Štěrba, J., Pilný, R., Valík, D. Nové poznatky ve farmakologii methotrexátu – diagnostické možnosti a klinický význam. Klin Onkol 2015;28(3):163-170. (bez IF)
• Takáčová, M., Pastoreková, S. Nádorová hypoxia – molekulárne mechanizmy a klinický význam. Klin Onkol2015;28(3):183-190. (bez IF)
• Sgaramella, N., Coates, P. J., Strindlund, K., Loljung, L., Colella, G., Laurell, G., Rossiello, R., Muzio, L. L., Loizou, C., Tartaro, G., Olofsson, K., Danielsson, K., Fåhraeus, R., Nylander, K. Expression of p16 in squamous cell carcinoma of the mobile tongue is independent of HPV infection despite presence of the HPV-receptor syndecan-1.Br J Cancer 2015;113(2):321-326. (IF2014: 4,836)
• Obacz, J., Brychtova, V., Podhorec, J., Fabian, P., Dobes, P., Vojtesek, B., Hrstka, R. Anterior gradient protein 3 (AGR3) is associated with less aggressive tumors and better outcome of breast cancer patients. Oncotargets Ther 2015;8:1523-1532. (IF2014: 2,311)
• Brychtova, V., Mohtar, A., Vojtesek, B., Hupp, T. Mechanisms of anterior gradient-2 regulation and function in cancer. Semin Cancer Biol 2015;33:16-24. (IF2014: 9,330)
• Bienertova-Vasku, J., Zlamal, F., Tomandl, J., Hodicka, Z., Novak, J., Splichal, Z., Ventruba, P., Thon, V., Vasku, A. The presence of B-cell activating factor (BAFF) in umbilical cord blood in both healthy and pre-eclamptic pregnancies and in human breast milk. J Reprod Immunol 2015;109:89-93. (IF2014: 2,815)
• Pajtler, K. W., ... Zitterbart, K. et al. Molecular Classification of Ependymal Tumors across All CNS Compartments, Histopathological Grades, and Age Groups. Cancer Cell 2015;27(5):728-743. (IF2014: 23,532)
• Hrabovský, Š., Řehák, Z., Stulík, J., Prášek J., Mayer, J. Raritní případ mnohočetného myelomu: vícečetný solitární plazmocytom kostí bérců a předloktí. Vnitř Lék 2015;61(2):161-165. (bez IF)
• Adam, Z., Szturz, P., Koukalová, R., Řehák, Z., Pour, L., Krejčí, M., Šmardová, L., Eid, M., Volfová, P., Čermáková, Z., Křen, L., Sokol, F., Hanke, I., Michalková, E., Král, Z., Mayer, J. PET-CT dokumentovaná remise multicentrické formy Castlemanovy choroby po léčbě rituximabem: Popis případu a přehled literatury. Vnitř Lék2015;61(3):251–259. (bez IF)
• Splichal, Z., Bienertova-Vasku, J., Novak, J., Zlamal, F., Tomandl, J., Tomandlova, M., Forejt, M., Havlenova, S., Jackowska, A., Vasku, A. The common polymorphism Val109Asp in the omentin gene is associated with daily energy intake in the Central-European population. Nutr Neurosci 2015;18(1):41-48. (IF2014: 2,274)
• Pernikářová, V., Sedláček, V., Potěšil, D., Struhárová, I., Zdráhal, Z., Bouchal, P., Kučera, I. Proteomic responses to a methyl viologen-induced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans. J Proteomics 2015;125:68-75. (IF2014: 3,888)
• Costas, L., Infante-Rivard, C., Zock, J. P., Van Tongeren, M., Boffetta, P., Cusson, A., Robles, C., Casabonne, D., Benavente, Y., Becker, N., Brennan, P., Foretova, L., Maynadié, M., Staines, A., Nieters, A., Cocco, P., de Sanjosé, S. Occupational exposure to endocrine disruptors and lymphoma risk in a multi-centric European study.Br J Cancer 2015;112(Suppl):1251-1256. (IF2014: 4,836)
• Blanco, I.,…Foretová, L. et al. Assessing Associations between the AURKA-HMMR-TPX2-TUBG1 Functional Module and Breast Cancer Risk in BRCA1/2 Mutation Carriers. PLoS One 2015;10(4):e0120020. (IF2014: 3,234)
• Řehák, Z., Lakomý, R., Fait, V. Onkologie v obrazech. Rozmanitost 18F- FDG PET obrazů pacientů s maligním melanomem. Klin Onkol 2015;28(2):143-144. (bez IF)
• Hsu, J-L., van den Boomen, D. J. H., Tomasec, P., Weekes, M. P., Antrobus, R., Stanton, R. J., Ruckova, E., Sugrue, D., Wilkie, G. S., Davison, A. J., Wilkinson, G. W. G., Lehner, P. J. Plasma Membrane Profiling Defines an Expanded Class of Cell Surface Proteins Selectively Targeted for Degradation by HCMV US2 in Cooperation with UL141. PLoS Pathog 2015;11(4):e1004811. (IF2014: 7,560)
• Bouchal, P., Dvorakova, M., Roumeliotis, T., Bortlicek, Z., Ihnatova, I., Struharova, I., Ho, J. T. C., Maryas, J., Imrichova, H., Budinska, E., Vyzula, R., Garbis, S. D., Vojtesek, B., Nenutil, R. Combined proteomics and transcriptomics identifies carboxypeptidase B1 and NF-κB associated proteins as putative biomarkers of metastasis in low grade breast cancer. Mol Cell Proteomics 2015;14(7):1814-1830. (IF2014: 6,564)
• Řezníčková, E., Popa, A., Gucký, T., Zatloukal, M., Havlíček, L., Bazgier, V., Berka, K., Jorda, R., Popa, I, Nasereddin A, Jaffe Ch, Kryštof V, Strnad, M. 2,6,9-Trisubstituted purines as CRK3 kinase inhibitors with antileishmanial activity in vitro. Bioorg Med Chem Lett 2015;25(11):2298-2301. (IF2014: 2,420)
• Bencsikova, B., Bortlicek, Z., Halamkova, J., Ostrizkova, L., Kiss, I., Melichar, B., Pavlik, T., Dusek, L., Valik, D., Vyzula, R., Zdrazilova-Dubska, L. Efficacy of bevacizumab and chemotherapy in the first-line treatment of metastatic colorectal cancer: broadening KRAS-focused clinical view. BMC Gastroenterol 2015;15(1):37. (IF2014: 2,365)
• Healy, A. R., Houston, D. R., Remnant, L., Huart, A., Brychtova, V., Maslon, M. M., Meers, O., Muller, P., Krejci, A., Blackburn, E. A., Vojtesek, B., Hernychova, L., Walkinshaw, M. D., Westwood, N. J., Hupp, T. R. Discovery 1 of a novel ligand that modulates the protein–protein interactions of the AAA+ superfamily oncoprotein reptin. Chem Sci 2015;6:3109-3116. (IF2014: 9,211)
• Jorda, R., Schütznerová, E., Cankař, P., Brychtová, V., Navrátilová, J., Kryštof, V. Novel arylazopyrazole inhibitors of cyclin-dependent kinases. Bioorg Med Chem 2015;23:1975–1981. (IF2014: 2,793)
• Cefalu, S., Lena, A. M., Vojtesek, B., Musaro, A., Melino, G., Candi, E. TAp63gamma is required for the late stages of myogenesis. Cell Cycle 2015;14(6):894-901. (IF2014: 4,565)
• Coufal, O., Zapletal, O., Vrtělová, P., Vašina, J., Řehák, Z. Neúspěšná lymfoscintigrafie před sentinelovou biopsií u karcinomu prsu, možné příčiny a důsledky pro chirurgický výkon – analýza výsledků 3014 vyšetření. Rozhl Chir 2015;94(3):126-130. (bez IF)
• Andreotti, G., …Foretova, L. et al. A Pooled Analysis of Cigarette Smoking and Risk of Multiple Myeloma from the International Multiple Myeloma Consortium. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2015;24(3):631-634. (IF2014: 4,125)
• Paleček, E., Tkáč, J., Bartošík, M., Bertók, T., Ostatná, V. Paleček, J. Electrochemistry of non-conjugated proteins and glycoproteins. Towards sensors for biomedicine and glycomics. Chem Rev 2015;115(5):2045-2108.(IF2014: 46,568)
• Obacz, J., Takacova, M., Brychtova, V., Dobes, P., Pastorekova, S., Vojtesek, B., Hrstka, R. The role of AGR2 and AGR3 in cancer: similar but not identical. Eur J Cell Biol 2015;94:139-147. (IF2014: 3,825)
• Orzol, P., Holcakova, J., Nekulova, M., Nenutil, R., Vojtesek, B., Coates, P. J. The diverse oncogenic and tumour suppressor roles of p63 and p73 in cancer: a review by cancer site. Histol Histopathol 2015;30:503-521. (IF2014: 2,096)
• Reichl, P., Fang, M., Starlinger, P., Staufer, K., Nenutil, R., Muller, P., Greplova, K., Valik, D., Dooley, S., Brostjan, C., Gruenberger, T., Shen, J., Man, K., Trauner, M., Yu, J., Gao, C. F., Mikulits, W. Multicenter analysis of soluble Axl reveals diagnostic value for very early stage hepatocellular carcinoma. Int J Cancer 2015;137(2):385-394. (IF2014: 5,085)
• Fraser, J. A., Worrall, E. G., Lin Y., Landre, V., Pettersson, S., Blackburn, E., Walkinshaw, M., Muller, P., Vojtesek, B., Ball, K., Hupp, T. R. Phospohomimetic mutation of the N-terminal lid of MDM2 enhances the polyubiquitination of p53 through stimulation of E2-ubiquitin thioester hydrolysis.J Mol Biol 2015;427(8):1728-1747.(IF2014: 4,333)
• Vijai, J., …Foretova, L., et al. A genome-wide association study of marginal zone lymphoma shows association to the HLA region. Nat Commun 2015;6:5751. (IF2014: 11,470)
• Pastorek, M., Simko, V., Takacova, M., Barathova, M., Bartosova, M., Hunakova, L., Sedlakova, O., Hudecova, S., Krizanova, O., Dequiedt, F., Pastorekova, S., Sedlak, J. Sulforaphane reduces molecular response to hypoxia in ovarian tumor cells independently of their resistance to chemotherapy. Int J Oncol 2015;47(1):51-60. (IF2014: 3,025) 

• Slavik, M., Burkon, P., Kazda, T., Budikova, M., Slavikova, M., Dvorakova, E., Pospisil, P., Gombosova, J., Navratilova, P., Slampa, P. Toxicity and survival outcomes of adjuvant chemoradiation for gastric and gastroesophageal junction cancer patients treated in period 2006-2009: an institutional experience. Neoplasma 2014;61(6):739-746. (IF2013: 1,642)
• Zhukova, N., Ramaswamy, V., Remke, M., Martin, D. C., Castelo-Branco, P., Zhang, C. H., Fraser, M., Tse, K., Poon, R., Shih, D., Baskin, B., Ray, P. N., Bouffet, E., Dirks, P., von Bueren, A. O., Pfaff, E., Korshunov, A., Jones, D., Northcott, P. A., Kool, M., Pugh, T. J., Pomeroy, S. L., Cho, Y., Pietsch, T., Gessi, M., Rutkowski, S., Bognár, L., Cho, B., Eberhart, C. G., Conter, C., Fouladi, M., French, P. J., Grajkowska, W. A., Gupta N, Hauser P, Jabado N, Vasiljevic A, Jung S, Kim S, Klekner A, Kumabe T, Lach, B., Leonard, J. R., Liau, L. M., Massimi, L., Pollack, I. F., Ra, Y., Rubin, J. B., Van Meir, E. G., Wang, K., Weiss, W. A., Zitterbart, K., Bristow, R. G., Alman, B., Hawkins, C. E., Malkin, D., Clifford, S. C., Pfister, S. M., Taylor, M. D., Tabori, U. WNT activation by lithium abrogates TP53 mutation associated radiation resistance in medulloblastoma. Acta Neuropathol Commun 2014;2(1):174. (bez IF)
• Demlova, R., Melicharkova, K., Rehak, Z., Kren, L,, Oslejskova, H., Sterba, J. Successful use of metronomic vinblastine and fluorothymidine pet imaging for the management of intramedullary spinal cord anaplastic oligoastrocytoma in a child. Curr Oncol 2014;21(6):e790-e793. (IF2013: 1,643)
• Paleček, E., Ostatná, V., Pechan, Z. Fifty Five Years of Nucleic Acid Electrochemistry . Chem listy 2014;108:490-499. (IF2013: 0,196)
• Trefulka, M., Paleček, E.Direct chemical modification and voltammetric detection of glycans in glycoproteins.Electrochem Commun 2014;48:52–55. (IF2013: 4,287)
• Trefulka, M., Paleček, E. Can voltammetry distinguish glycan isomers? Chem Pap 2014;69(1):241-244. (IF2013: 1,193)
• Krzyzankova, M., Chovanova, S., Chlapek, P., Radsetoulal, M., Neradil, J., Zitterbart, K., Sterba, J., Veselska, R.LOX/COX inhibitors enhance the antineoplastic effects of all-trans retinoic acid in osteosarcoma cell lines. Tumour Biol 2014;35:7617-7627. (IF2013:2,84)
• Coufal, O., Justan, I., Gabrielová, L., Zapletal, O., Krsička, P. Okamžité rekonstrukce prsu u onkologických pacientek: naše zkušenosti. Prakt Gyn 2014;18(1):35-40. (no IF)
• Chovanec, J., Náležinská, M. Overview of the diagnostics and treatment of the cervical cancer. Onkologie 2014;8(6):269-274. (no IF)
• Chovanec, J. Karcinom ovaria – současnost a novinky v léčbě. Acta medicinae 2014;3(8):56-59. (no IF)
• Chovanec, J. Farmakologická léčba karcinomu děložního hrdla. Acta medicinae 2014;3(2):26-28. (no IF)
• Chovanec, J. Bevacizumab v léčbě karcinomu vaječníku. Farmakoterapie 2014;10(2):168-170. (no IF)
• Chovanec, J., Bláhová, V. Cílená biologická léčba karcinomu ovaria. Acta medicinae 2014;3(1):30-32. (no IF)
• Foretová, L., Svoboda, M., Slabý, O. a kol. Molekulární genetika v onkologii. Mladá fronta a.s. 2014, Praha, ČR. Počet stran: 184. ISBN: 978-80-204-3236-0.
• Bosetti, C., …, Foretova, L., et al. Diabetes, antidiabetic medications, and pancreatic cancer risk: an analysis from the International Pancreatic Cancer Case-Control Consortium. Ann Oncol 2014;25(10):2065-2072. (IF2013: 6,578)
• Cerhan, J. R., …, Foretova, L., et al. Genome-wide association study identifies multiple susceptibility loci for diffuse large B cell lymphoma. Nat Genet 2014;46(11):1233-1238. (IF2013: 29,648)
• Skibola, C. F., …, Foretova, L., et al. Genome-wide Association Study Identifies Five Susceptibility Loci for Follicular Lymphoma outside the HLA Region. Am J Hum Genet 2014;95(4):462-471. (IF2013: 10,987)
• Scelo, G., …, Foretova, L., et al. Variation in genomic landscape of clear cell renal cell carcinoma across Europe.Nat Commun 2014;5:5135. (IF2013: 10,742)
• Zitterbart, K. Subependymal Giant Cell Astrocytoma Associated with Tuberous Sclerosis Complex – Pharmacological Treatment using mTOR Inhibitors. Klin Onkol 2014;27(6):401-405.(no IF)
• Štěrba, J., Štěrbová, S., Kodytková, D, Valík, D., Demlová, R. Klinické hodnocení nových léčiv u vzácných diagnóz v onkologii – současná situace v Evropě a u nás. Vnitř Lék 2014;60(Suppl 2):80-85. (no IF)
• Szturz, P., Řehák, Z., Koukalová, R., Adam, Z., Mayer, J. FDG-PET positive pilomatrixoma — reconsidering multicentricity in Langerhans cell histiocytosis. Nucl Med Rev Cent East Eur 2014;17(2):94-96. (no IF)
• Szturz, P., Plank, L., Křístek, J., Řehák, Z., Koukalová, R., Pípal, R., Tesař, J., Čermáková, Z., Gottwaldová, J., Vaníček, J., Šlaisová, R., Škorpík, M., Adam, Z., Šmardová, L., Mayer, J. Castlemanova choroba v obrazech.Postgraduální medicína 2014;16(1):81-88. (bez IF)
• Nehybova, T., Smarda, J., Benes, P. Plant Coumestans: recent Advances And Future Perspectives in Cancer Therapy. Anticancer Agents Med Chem 2014;14(10):1351-1362. (IF2013: 2,939)
• Ostatná, V., Vargová, V., Hrstka, R., Ďurech, M., Vojtěšek, B., Paleček, E. Effect of His6-tagging of anterior gradient 2 protein on its electro-oxidation. Electrochim Acta 2014;150:218-222. (IF:2013: 4,086)
• Coufal, O., Gabrielová, L., Justan, I., Zapletal, O., Selingerová, I., Krsička, P. Breast Cancer Patient Satisfaction with Immediate Two-stage Implant-based Breast Reconstruction. Klin Onkol 2014:27(5):353-360. (no IF)
• Zitterbart, K.mTOR inhibice: nové možnosti farmakologické léčby nádorů u pacientů s tuberózní sklerózou. Postgraduální medicína 2014;16(8):880-886. (no IF)
• Bartosik, M., Hrstka, R., Palecek, E., Vojtesek, B. Adsorptive Transfer Stripping for Quick Electrochemical Determination of microRNAs in Total RNA Samples. Electroanalysis 2014 (accepted) (IF2013: 2,502)
• Řiháček, M., Řiháček, I., Zdražilová Dubská, L., Pilátová, K. Methotrexate update 2014: 70 years in autoimmunity and cancer treatment. Česk Pediatr 2014;69(3):161-167. (no IF)
• Mlynarczyk, C., Fåhraeus, R. Endoplasmic reticulum stress sensitizes cells to DNA damage-induced apoptosis through p53-dependent suppression of p21CDKN1A. Nat Commun 2014;5:5067. (IF2013: 10,742)
• Anantharaman, D.,... Foretova, L., et al. No causal association identified for human papillomavirus infections in lung cancer. Cancer Res 2014;74(13):3525-3234. (IF2013: 9,284)
• Wang, Y.,... Foretova, L., et al. Rare variants of large effect in BRCA2 and CHEK2 affect risk of lung cancer. Nat Genet 2014;46(7):736-741. (IF2013: 29,648)
• Drtinova, L., Dobes, P., Pohanka, M. Low molecular weight precursor applicable for Alzheimer disease drugs synthesis (AChE and BChE inhibition, BACE inhibition, antioxidant properties and in silico modulation). J Appl Biomed 2014;12(4):285-290. (IF2013: 1,775)
• Coufal, O., Selingerová, I., Vrtělová, P., Krsička, P., Gabrielová, L., Fabian, P., Stískalová, K., Schneiderová, M., Poprach, A., Justan, I. A simple model to assess the probability of invasion in ductal carcinoma in situ of the breast diagnosed by needle biopsy. Biomed Res Int 2014;2014:480840. (IF2013: 2,706)
• Kim, C. H., ... Foretova, L., et al. Exposure to secondhand tobacco smoke and lung cancer by histological type: A pooled analysis of the International Lung Cancer Consortium (ILCCO). Int J Cancer 2014;135(8):1918-1930. (IF2013: 5,007)
• Stanton, R. J., Prod'homme, V., Purbhoo, M. A., Moore, M., Aicheler, R. J., Heinzmann, M., Bailer, S. M., Haas, J., Antrobus, R., Weekes, M. P., Lehner, P. J., Vojtesek, B., Miners, K. L., Man, S., Wilkie, G. S., Davison, A. J., Wang, E. C., Tomasec, P., Wilkinson, G. W. HCMV pUL135 Remodels the Actin Cytoskeleton to Impair Immune Recognition of Infected Cells. Cell Host Microbe 2014;16(2):201-214. (IF2013: 12,194)
• Hamanová, M., Zdražilová Dubská, L., Valík, D., Lokaj, J. Natural antibodies against α(1,3) galactosyl epitope in the serum of cancer patients. Epidemiol Mikrobiol Imunol 2014;63(2):130-133. (IF2012: 0,306)
• Chlapek, P., Neradil, J., Redova, M., Zitterbart, K., Sterba, J., Veselska, R. The ATRA-induced differentiation of medulloblastoma cells is enhanced with LOX/COX inhibitors: an analysis of gene expression. Cancer Cell Int 2014;14:51. (IF2013: 1,989) 
• Horikawa, I., Fujita, K., Jenkins, L., Hiyoshi, Y., Mondal, A., Vojtesek, B., Lane, D., Appella, E., Harris, C. Autophagic degradation of the inhibitory p53 isoform Δ133p53α as a regulatory mechanism for p53-mediated senescence. Nat Commun 2014;5:4706. (IF2013: 10,742)
• Adamová, E., Lišková, M., Matalová, E., Klepárník, K. A miniaturized device for bioluminescence analysis of caspase-3/7 activity in a single apoptotic cell. Anal Bioanal Chem 2014;406(22):5389-5394. (IF2013: 3,578)
• Adam, Z., Krejčí, M., Pour, L., Ševčíková, E., Křivanová, A., Řehák, Z., Koukalová, R., Čermáková, Z. Monoklonální gamapatie nejistého významu a asymptomatický mnohočetný myelom z pohledu roku 2014. Vnitř Lék 2014;60(10):871-889. (no IF)
• Řehák, Z., Fojtík, Z., Fryšáková, L., Šimíková, J., Kielkowská, I., Němec, P., Eberová, E., Obrovská, M., Křivanová, A., Staníček, J., Eremiášová, J., Vašina, J., Řeháková, D., Šnelerová, M., Tichý, T., Křen, L. 18F-FDG PET and PET/CT examination in patients with giant cell arteritis – a practical view from a PET center. Česk Revmatol 2014;22(2):91-98. (no IF)
• Adam, Z., Řehák, Z., Koukalová, R., Bortlíček, Z., Krejčí, M., Pour, L., Szturz, P., Prášek, J., Nebeský, T., Adamová, Z., Král, Z., Mayer, J. PET-CT documented complete remission of Erdheim-Chester disease, lasting more than 4 years from treatment initiation with cladribine. Vnitř Lék 2014;60(5-6):499-511. (no IF)
• Szturz, P., Adam, Z., Řehák, Z., Koukalová, R. Xantelasma palpebrarum responding to interleukin-1 blockade.Intern Med J 2014;44(6):617-618. (IF2013: 1,699)
• Szturz, P., Prášek, M., Řehák, Z., Fabian, P. Unicentric Castleman disease: from screening mammography to PET/CT imaging. Nuklearmedizin 2014;53(5):N41-N43. (IF2013: 1,671)
• Bartošík, M. Current trends in nucleic acid electrochemistry. Chem Listy 2014;108(5):500–506. (IF2013: 0,196)
• Ondroušková, E., Vojtěšek, B. Programmed cell death in cancer cells. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S7–S14. (No IF)
• Pekarčíková, L., Knopfová, L., Ondroušková, E., Šmarda, J. The Use of Flow Cytometry for Analysis of the Mitochondrial Cell Death. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S15–S21. (No IF)
• Kovaříková, P., Michalová, E., Knopfová, L., Bouchal, P. Methods for Studying Tumor Cell Migration and Invasiveness. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S22–S27. (No IF)
• Knopfová, L., Bouchal, P., Šmarda, J. Techniques to Study Transendothelial Migration In Vitro. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S28–S33. (No IF)
• Holčáková, J., Nekulová, M., Orzol, P., Vojtěšek, B. Mechanisms of Drug Resistance and Cancer Stem Cells. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S34–S41. (No IF)
• Škoda, J., Neradil, J., Veselská, R. Functional Assays for Detection of Cancer Stem Cells. Klin Onkol2014;27(Suppl1):S42–S47. (No IF)
• Chlapek, P., Chovanová, S., Sláviková, V., Veselská, R. Tumor Microenvironment – Possibilities of the Research Under In Vitro Conditions. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S48–S52. (No IF)
• Bartošík, M., Paleček, E., Vojtěšek, B. Electrochemical Analysis of Nucleic Acids, Proteins and Polysaccharides in Biomedicine. Klin Onkol 2014;27(Suppl 1):S53–S60. (No IF)
• Koubková, L., Vojtěšek, B., Vyzula, R. Next Generation Sequencing – Application in Clinical Practice. Klin Onkol2014;27(Suppl1):S61–S68. (No IF)
• Hrstka, R., Kolářová, T., Michalová, E., Vojtěšek, B. Development of PCR Methods and Their Applications in Oncological Research and Practice. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S69–S74. (No IF)
• Ďurech, M., Trčka, F., Vojtěšek, B., Müller, P. Methods for Analysis of Protein-protein and Protein-ligand Interactions. Klin Onkol 2014; 7(Suppl1):S75–S81. (No IF)
• Matoulková, E., Vojtěšek. B. Detection of Protein-protein Interactions by FRET and BRET Methods. Klin Onkol2014;27(Suppl 1):S82–S86. (No IF)
• Brychtová, V., Vojtěšek. B. In Situ Proximity Ligation Assay for Detection of Proteins, Th eir Interactions and Modifications. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S87–S91. (No IF)
• Růčková, E., Müller, P., Vojtěšek, B. Protein Expression and Purification. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):92–97. (No IF)
• Hernychová, L., Dvořáková, P., Michalová, E., Vojtěšek, B. Quantitative Mass Spectrometry and Its Utilization in Oncology. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S98–S103. (No IF)
• Dvořáková, P., Hernychová, L., Vojtěšek, B. Analysis of Protein Using Mass Spectrometry. Klin Onkol2014;27(Suppl1):104–109. (No IF)
• Faktor, J., Michalová, E., Bouchal, P. p-SRM, SWATH and HRM – Targeted Proteomics Approaches on TripleTOF 5600+ Mass Spectrometer and Th eir Applications in Oncology Research. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S110–S115. (No IF)
• Pjechová, M., Hernychová, L., Tomašec, P., Wilkinson, G. W., Vojtěšek, B. Analysis of Phosphoproteins and Signalling Pathways by Quantitative Proteomics. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S116–S120. (No IF)
• Zahradníková, M., Hernychová, L., Vojtěšek, B., Novotný, M. V. New Trends in the Study of Protein Glycosylation in Oncological Diseases. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S121–S128. (No IF)
• Adam, J., Kadeřávek, J., Kužel, F., Vašina, J., Řehák, Z. Current Trends in Using PET Radiopharmaceuticals for Diagnostics in Oncology. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S129–S136. (No IF)
• Adam, J., Kadeřávek, J., Kužel, F., Vašina, J., Řehák, Z. „Technetium Crisis“ – Causes, Possible Solutions and Consequences for Planar Scintigraphy and SPECT Diagnostics. Klin Onkol 2014;27(Suppl1):S137–S142. (No IF)
• Obermannová, R., Demlová, R., Drábová, K., Melichárková, K., Greplová, K., Mrkvicová, M., Zdražilová Dubská, L., Vyzula, R., Valík, D. Vitamin D as an Important Steroid Hormone in Breast Cancer. Klin Onkol2014;27(Suppl1):S143–S149. (No IF)
• Dobes, P., Podhorec, J., Coufal, O., Jureckova, A., Petrakova, K., Vojtesek, B., Hrstka, R.Influence of mutation type on prognostic and predictive values of TP53 status in primary breast cancer patients. Oncol Rep 2014;32:1695-1702. (IF2013: 2,191)
• Jorda, R., Navrátilová, J., Hušková, Z., Schütznerová, E., Cankař, P., Strnad, M., Kryštof, V. Arylazopyrazole AAP1742 Inhibits CDKs and Induces Apoptosis in Multiple Myeloma Cells via Mcl-1 Downregulation. Chem Biol Drug Des 2014;84(4):402-408. (IF2013: 2,507)
• Večerková, R., Hernychová, L., Dobeš, P., Vrba, J., Josypčuk, B., Bartošík, M., Vacek, J. Investigation of protein FTT1103 electroactivity using carbon and mercury electrodes. Surface-inhibition approach for disulfide oxidoreductases using silver amalgam powder. Anal Chim Acta 2014;830:23-31. (IF2013: 4,517)
• Malbert-Colas, L., Ponnuswamy, A., Olivares-Illana, V., Tournillon, A., Naski, N., Fåhraeus, R. HDMX folds the nascent p53 mRNA following activation by the ATM kinase. Mol Cell 2014;54(3):500-511. (IF2013: 14,464)
• Kuricova, K., Pacal. L., Dvorakova, V., Kankova, K. Association of the Arg72Pro Polymorphism in p53 with Progression of Diabetic Nephropathy in T2DM Subjects. J Nephrol Ther 2014;4(2):153. (no IF)
• Brychtova, V., Zampachova, V., Hrstka, R., Fabian, P., Novak., J., Hermanova, M., Vojtesek., B. Differential expression of anterior gradient protein 3 in intrahepatic cholangiocarcinoma and hepatocellular carcinoma. Exp Mol Pathol 2014;96(3):375-381. (IF2013: 2,881)
• Bencsiková, B., Greplová, K., Pilátová, K., Volejníková, Z., Valík, D., Lakka Klement, G., Zdražilová Dubská, L.Krevní destičky v patogenezi a léčbě solidních nádorů. Cas Lek Cesk 2014;153(2):78-85. (no IF)
• Hodík, T., Lamač, M., Červenková Šťastná, L., Karban, J., Koubková, L., Hrstka, R., Císařová, I., Pinkas, J.Titanocene Dihalides and Ferrocenes Bearing a Pendant α-D-Xylofuranos-5-yl or α-D-Ribofuranos-5-yl Moiety. Synthesis, Characterization, and Cytotoxic Activity. Organometallics 2014;33(8):2059–2070. (IF2013: 4,253)
• Bouchalova, P., Nenutil, R., Muller, P., Hrstka, R., Appleyard, M. V., Murray, K., Jordan, L. B., Purdie, C. A., Quinlan, P., Thompson, A. M., Vojtesek, B., Coates, P. J. Mutant p53 accumulation in human breast cancer is not an intrinsic property nor dependent on structural or functional disruption but is regulated by exogenous stress and receptor status. J Pathol 2014;233(3):238–246. (IF2013: 7,330)
• Hodická, Z., Bienertová-Vašků, J., Novák, J., Vašků, A. Double Heterozygotes For Ace Id And Agt M235t Polymorphisms Are In Lower Risk Of Developing Non-Syndromic Intrauterine Growth Restriction: A Possible Role Of Appetite? In: Bienertová-Vašků, J. (Ed.) Appetite: Regulation, Use of Stimulants and Cultural and Biological Influences. Nova Science Publishers, Inc. 2014. ISBN: 978-1-63117-241-0, ISBN: 978-1-63117-243-4 (eBook). p. 177-187. (no IF)
• Bienertová-Vašků, J., Vavrina, M., Dobrovolny, J., Kudelkova, J., Zlamal, F., Forej, M., Jackowska, A., Vašků, A. Two Common Ghrelin Gene Polymorphisms Linked to Anthropometric and Dietary Characteristics of the Central European Population. In: Bienertová-Vašků, J. (Ed.) Appetite: Regulation, Use of Stimulants and Cultural and Biological Influences. Nova Science Publishers, Inc. 2014. ISBN: 978-1-63117-241-0, ISBN: 978-1-63117-243-4 (eBook). p. 189-202. (no IF)
• Murray, E., Hernychova, L., Scigelova, M., Ho., J., Nekulova, M., O´Neill, J. R., Nenutil, R., Vesely, K., Dundas, S. R., Dhaliwal, C., Henderson, H., Hayward, R. L., Salter, D. M., Vojtesek., B., Hupp, T. R. Quantitative Proteomic Profiling of Pleiomorphic Human Sarcoma Identifies CLIC1 as a Dominant Pro-oncogenic Receptor Expressed in Diverse Sarcoma Types. J Proteome Res 2014;13(5):2543–2559. (IF2013: 5,001)
• Sheard, M. A., Zdražilová Dubská, L. Knowledge Transfer at the RECAMO Summer School of 2013. Klin onkol 2014;27(1):60-63. (no IF)
• Demlová, R. Biosimilars (ne)jen v onkologii – dnešní realita i budoucnost. Klin onkol 2014;27(1):64-66. (no IF)
• Trcka, F., Durech, M., Man, P., Hernychova, L., Muller, P., Vojtesek, B. The assembly and intermolecular properties of the Hsp70-Tomm34-Hsp90 molecular chaperone complex. J Biol Chem, 2014;289(14):9887-9901.(IF2013: 4,6)
• Liu, Y., Nenutil, R., Appleyard, M. V., Murray, K., Boylan, M., Thompson, A. M., Coates, P. J. Lack of correlation of stem cell markers in breast cancer stem cells. Br J Cancer 2014;289(14):9887-9901. (IF2013: 4,817)
• Koubkova, L., Hrstka, R., Dobes, P., Vojtesek, B., Vyzula, R. Second Primary Cancers – Causes, Incidence and the Future. Klin onkol 2014;27(1):11-17. (no IF)
• Holcakova, J., Muller, P., Tomasec, P., Hrstka, R., Nekulova, M., Krystof, V., Strnad, M., Wilkinson, G. W. G., Vojtesek, B. Inhibition of post-transcriptional RNA processing by CDK inhibitors and its implication in anti-viral therapy. Plos One 2014;9(2):e89228. (IF2013: 3,534) 
• Bienertová-Vašků, J., Nečesánek, I., Novák, J., Vinklárek, J., Zlámal, F."Stress entropic load" as a transgenerational epigenetic response trigger. Med Hypotheses 2014;82(3):271-274.  (IF2013: 1,152)
• Demlova, R., Mrkvicova, M., Sterba, J., Bernatikova, H., Stary, J., Sukova, M., Mikuskova, A., Chocholova, A., Mladosievicova, B., Soltysova, A., Behulova, D., Pilatova, K., Zdrazilova Dubska, L., Valik, D. Augmenting clinical interpretability of thiopurine methyltransferase laboratory evaluation. Oncology 2014;86(3):152-158. (IF2013: 2,613)
• Maryáš, J., Faktor, J., Dvořáková, M., Struhárová, I., Grell, P., Bouchal, P. Proteomics in investigation of cancer metastasis: Functional and clinical consequences and methodological challenges. Proteomics 2014;14(4-5):426-440. (IF2013: 3,973)
• Dvorakova, M., Nenutil, R., Bouchal, P. Transgelins, cytoskeletal proteins implicated in different aspects of cancer development. Expert Rev Proteom 2014;11(2):149-165. (IF2013: 3,542)
• Bartosik, M., Hrstka, R., Palecek, E., Vojtesek, B. Magnetic bead-based hybridization assay for electrochemical detection of microRNAs. Anal Chim Acta 2014;813:35–40. (IF2013: 4,517)
• Loljung, L., Coates, P. J., Nekulova, M., Laurell, G., Wahlgren, M., Wilms, T., Widlöf, M., Hansel, A., Nylander, K. High expression of p63 is correlated to poor prognosis in squamous cell carcinoma of the tongue. J Oral Pathol Med 2014;43(1):14-19. (IF2013: 1,87)
• Knizek, J., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Tomsik, P. Dependences´ tests with respect to the total vertical physical scale. International Journal of Mathematics and Computation 2014;24(3):25-32. (no IF)
• Knizek, J., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Beranek, L., Kuba, M., Tomsik, P. Resgression algorithm for identification of biomarker areas in SELDI-TOF mass spectra. Int J Imag Robot 2014;13(2):40-57.(no IF)
• Brychtova, V., Hermanova, M., Karasek, P., Lenz, J., Selingerova, I., Vojtesek, B., Kala, Z., Hrstka, R. Anterior gradient 2 and Mucin 4 expression mirrors tumor cell differentiation in pancreatic adenocarcinomas, but aberrant Anterior gradient 2 expression predicts worse patient outcome in poorly differentiated tumors. Pancreas2014;43(1):75-81. (IF2013: 3,008)
• Skoda, J., Neradil, J., Zitterbart, K., Sterba, J., Veselska, R. EGFR signaling in the HGG-02 glioblastoma cell line with an unusual loss of EGFR gene copy. Oncol Rep 2014;31(1):480-487. (IF2013: 2,191)

• Wozniak, M. B., Le Calvez-Kelm, F., Abedi-Ardekani, B., Byrnes, G., Durand, G., Carreira, C., Michelon, J., Janout, V., Holcatova, I., Foretova, L., Brisuda, A., Lesueur, F., McKay, J., Brennan, P., Scelo, G. Integrative genome-wide gene expression profiling of clear cell renal cell carcinoma in Czech Republic and in the United States. PLoS One 2013;8(3):e57886. (IF2012: 3,73)
• Doleželová, H., Šlampa, P. Stereotaktická radioterapie a radiochirurgie v léčbě recidivujícího glioblastoma multiforme. In: Šlampa, P. a kol. (Eds.): Gliomy. Současná diagnostika a léčba. Maxdorf, 2013. Praha, Česká republika. s.71-77. ISBN 978-80-7345-321-3.
• Bartosik, M., Vojtesek, B. A brief history of DNA electrochemistry. Folia Mendeliana 2013;49(2):39-43. (Bez IF) 
• Brychtova, V., Vojtesek, B. Anterior gradient proteins and their evolutionarily conserved roles from Xenopus to human. Folia Mendeliana 2013;49(2):45-48. (Bez IF)
• Hernychova, L., Michalova, E., Vojtesek, B. Proteome analysis in biology. Folia Mendeliana 2013;49(2):49-52. (Bez IF)
• Koubkova, L., Vyzula, R., Vojtesek, B., Hrstka, R. A mini review of organometallic compounds and their anticancer properties. Folia Mendeliana 2013;49(2):53-57. (Bez IF)
• Matoulkova, E., Vojtesek, B., Valik, D. Dendritic cell-based anticancer vaccination in immunotherapy of metastatic renal carcinoma. Folia Mendeliana 2013;49(2):59-62. (Bez IF)
• Nekulova, M., Holcakova, J., Vojtesek, B. Regulation of human reproduction by p53 members. Folia Mendeliana 2013;49(2):63-67. (Bez IF)
• Obacz, J., Hrstka, R., Vojtesek, B., Pastorekova, S. Tumor hypoxia and its clinical significance. Folia Mendeliana 2013;49(2):69-73. (Bez IF)
• Pilatova, K., Mrkvicova, M., Zdrazilova-Dubska, L., Obermannova, R., Valik, D. Detection of DPYD*2A allele in dihydropyrimidine dehydrogenase gene: perspective for fluoropyrimidine-treated patients. Folia Mendeliana 2013;49(2):75-80. (Bez IF)
• Trcka, F., Vojtesek, B., Muller, P. Chaperones and evolution. Folia Mendeliana 2013;49(2):81-84. (Bez IF)
• Knizek, J., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Tomsik, P. Summary of algorithmic fragments for statistical identification of markers form as et of spectral courses. Clinician and Technology 2013;43(3):30-35. (bez IF)
• Kazda, T., Pospíšil, P., Doleželová, H., Jančálek, R., Šlampa, P.Whole brain radiotherapy: Consequence for personalized medicine. Rep Pract Oncol Radiother 2013;18(3):133-138.
• Doleželová H., Pospíšil, P., Šlampa, P., Čoupková, I., Garčic, J., Fadrus, P., Svoboda, T., Selingerová, I., Horová, I. Stereotaktická radioterapie a radiochirurgie primárních tumorů mozku. Onkologie 2013;7(6):281-285. (bez IF) 
• Andreotti, G., …, Foretova, L. et al. Pooled Analysis of Alcohol Consumption and Risk of Multiple Myeloma in the International Multiple Myeloma Consortium. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2013;22(9):1620-1627. (IF2012: 4,559)
• Phillips, KA, …Foretova, L. et al. Tamoxifen and risk of contralateral breast cancer for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. J Clin Oncol 2013;31(25):3091-3099. (IF2012: 18,038)
• Monnereau, A., Glaser, S. L., Schupp, C. W., Ekström Smedby, K., de Sanjosé, S., Kane, E., Melbye, M., Forétova, L., Maynadié, M., Staines, A., Becker, N., Nieters, A., Brennan, P., Boffetta, P., Cocco, P., Glimelius, I., Clavel, J., Hjalgrim, H., Chang, E. T. Exposure to UV radiation and risk of Hodgkin lymphoma: a pooled analysis. Blood2013;122(20):3492-3499. (IF2012: 9,06)
• Chovanec, J. Léčebné modality karcinomu ovaria. Acta medicinae 2013;2(4):26–30. (bez IF)
• Krsička, P., Coufal, O., Zapletal, O. Pozitivní sentinelová uzlina u karcinomu prsu – kdy a proč doplňovat axilární disekci? Rozhl Chir 2013;92(12):684-689. (no IF)
• Coufal, O. Otázky adekvátní chirurgické radikality v léčbě mamárního karcinomu. Farmakoterapie 2013;9(Speciální příloha: Léčba pokročilého karcinomu prsu):13-18. (no IF)
• Petráková, K. Precursors of Breast Cancer. Klin Onkol 2013;26(Suppl):7-12. (no IF)
• Chovanec, J., Mouková, L., Feranec, R. Preinvasive Lesions in Gynecology – Vulva. Klin Onkol 2013;26(Suppl):44-46. (no IF)
• Navrátilová, J., Hankeová, T., Beneš, P., Smarda, J. Low-glucose conditions of tumor microenvironment enhance cytotoxicity of tetrathiomolybdate to neuroblastoma cells. Nutr Cancer 2013;65(5):702-10. (IF2012: 2.695)
• Bartošík, M., Trefulka, M., Paleček, E. Novel Electrochemical Assays for MicroRNA Detection Using Electroactive Complex of Six-Valent Osmium and Magnetic Beads. In Sborník přednášek: XXXIII. Moderní elektrochemické metody. 20.5.-24.5.2013, Jetřichovice, Czech Republic. ISBN: 978-80-905221-1-4. str.19-23. (article in abstractbook, czech, no IF)
• Lízal, F., Jedelský, J., Adam, J., Bělka, M., Jícha, M. Application of Positron Emission Tomography to Aerosol Transport Research in a Model of Human Lungs. EPJ Web of Conferences 2013;45:01060. (no IF)
• Mondal, A. M., Horikawa, I., Pine, S. R., Fujita, K., Morgan, K. M., Vera, E., Mazur, S. J., Appella, E., Vojtesek, B., Blasco, M. A., Lane, D. P., Harris, C. C.p53 isoforms regulate aging- and tumor-associated replicative senescence in T lymphocytes. J Clin Invest 2013;123(12):5247-5257. (IF2012: 12,812)
• Vargova, V., Zivanović, M., Dorčák, V., Paleček, E., Ostatná, V. Catalysis of Hydrogen Evolution by Polylysine, Polyarginine and Polyhistidine at Mercury Electrodes. Electroanalysis 2013;25(9):2130–2135. (IF2012: 2.817)
• Springer, D., Valík, D., Topolčan, O., Nekulová, M., Zdražilová Dubská, L., Malbohan, I., Fuchsová, R., Svobodová, Š., Zima, T. Nádorové markery v klinické praxi. Postgraduální medicína 2013;15(příloha č.3):40-49. (bez IF)
• Imramovský, A., Jorda, R., Pauk, K., Řezníčková, E., Dušek, J., Hanusek, J., Kryštof, V. Substituted 2-hydroxy-N-(arylalkyl)benzamides induce apoptosis in cancer cell lines. Eur J Med Chem 2013;14;68C:253-259. (IF2012: 3,499)
• Hrstka, R., Brychtova, V., Fabian, P., Vojtesek, B., Svoboda, M. AGR2 Predicts Tamoxifen Resistance in Postmenopausal Breast Cancer Patients. Dis Markers 2013;35(4):207-212. (IF2012: 2,140) 
• Huart, A. S., Saxty, B., Merritt, A., Nekulova, M., Lewis, S., Huang, Y., Vojtesek, B., Kettleborough, C., Hupp, T. R. A Casein kinase 1/Checkpoint kinase 1 pyrazolo-pyridine protein kinase inhibitor as novel activator of the p53 pathway. Bioorg Med Chem Lett 2013;23(20):5578-5585.(IF2012: 2,338)
• Cernocka, H., Ostatna, V., Palecek, E.Enzymatic activity and catalytic hydrogen evolution in reduced and oxidized urease at mercury surfaces. Anal Chim Acta 2013;789:41–46. (IF2012: 4,387)
• Obacz, J., Pastorekova, S., Vojtesek, B., Hrstka, R. Cross-talk between HIF and p53 as mediators of molecular responses to physiological and genotoxic stresses. Mol Cancer 2013;12(1):93. (IF2012: 5,13)
• Nekulova, M., Holcakova, J., Nenutil, R., Stratmann, R., Bouchalova, P., Müller, P., Moukova, L., Coates, P. J., Vojtesek, B. Characterization of specific p63 and p63-N-terminal isoform antibodies and their application for immunohistochemistry.Virchows Arch 2013:463:415–425. (IF2012: 2,676)
• Bienertova-Vasku, J., Mazanek, P., Hezova, R., Curdova, A., Nekvindova, J., Kren, L., Sterba, J., Slaby, O. Extension of microRNA expression pattern associated with high-risk neuroblastoma. Tumour Biol 2013;34(4):2315-2319. (IF2012: 2,518)
• Trčka, F., Šmarda, J., Knopfová, L., Kuziaková, K., Beneš, P.Nuclear factor of activated T-cells 1 increases sensitivity of v-myb transformed monoblasts to all-trans retinoic acid. Cell Signal 2013;25(7):1546-1555. (IF2012: 4,304)
• Gray, T. A., Murray, E., Nowicky, M. W., Remnant L., Scherl, A., Muller, P., Vojtesek, B. Hupp, T. R. Development of a fluorescent monoclonal antibody-based assay to measure the allosteric effects of synthetic peptides on self-oligomerization of AGR2 protein. Protein Sci 2013;22(9):1266-1278. (IF2012: 2,735)
• Michalova, E., Vojtesek, B., Hrstka, R. Impaired pre-mRNA processing and altered architecture of 3'untranslated regions contribute to the development of human disorders. Int J Mol Sci 2013;14(8):15681-15694. (IF2012: 2,464)
• Zapletal, O., Coufal, O., Selingerová, I., Krsička, P., Vrtělová, P. The number of removed axillary sentinel lymph nodes and its impact on the diagnostic accuracy of sentinel lymph node biopsy in breast cancer. Rozhl Chir2013;92(1):21-26. (no IF)
• Pilatova, K., Greplova, K., Demlova, R., Bencsikova, B., Lakka Klement, G., Zdrazilova-Dubska, L. Role of platelet chemokines, PF-4 and CTAP-III, in cancer biology. J Hematol Oncol 2013;6:42. (IF2012: 4,458)
• Muller, P., Ruckova, E., Halada, P., Coates, P, J., Hrstka, R., Lane, D. P., Vojtesek, B. C-terminal phosphorylation of Hsp70 and Hsp90 regulates alternate binding to co-chaperones CHIP and HOP to determine cellular protein folding/degradation balances. Oncogene 2013;32(25):3101–3110. (IF 2012: 7,357)
• Kurzatkowska, K., Ostatna, V., Hamley, I. A., Doneux, T.,Palecek, E. Electrochemical sensing of 2D condensation in amyloid peptides. Electrochim Acta 2013;10:43-48. (IF2012: 4,088)
• Bartosik, M., Trefulka, M., Hrstka, R., Vojtesek, B., Palecek, E. Os(VI)bipy-based electrochemical assay for detection of specific microRNAs as potential cancer biomarkers. Electrochem Commun 2013;33:55-58. (IF2012: 4,425)
• Hernychova, L., Man, P., Verma, C., Nicholson, J., Sharma C. A., Ruckova, E., Teo, J. Y., Ball, K., Vojtesek, B., Hupp, T. R. Identification of a second Nutlin-3 responsive interaction site in the N-terminal domain of MDM2 using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry. Proteomics 2013;13(16):2512-2525. (IF2012: 4,132).
• Chevet, E., Fessart, D., Delom, F., Mulot, A., Vojtesek, B., Hrstka, R., Murray, E., Gray, T., Hupp, T. Emerging roles for the pro-oncogenic anterior gradient-2 in cancer development. Oncogene 2013; 32(20):2499-2509. (IF2012: 7,357)
• Pohanka, M., Dobes, P. Caffeine Inhibits Acetylcholinesterase, But Not Butyrylcholinesterase. Int J Mol Sci 2013; 14(5):9873-9882. (IF2012: 2,464)
• Bienertova-Vasku, J., Bienert, P., Zlamal, F., Splichal, Z., Tomandl, J., Tomandlova, M., Hodicka, Z., Ventruba, P., Vasku, A. Brain-derived neurotrophic factor and ciliary neurotrophic factor in maternal plasma and umbilical cord blood from pre-eclamptic and physiological pregnancies. J Obstet Gynaecol 2013;33:359–363. (IF2012:0,546)
• Dorčák, V., Ostatná, V., Paleček, E. Electrochemical reduction and oxidation signals of angiotensin peptides. Role of individual amino acid residues. Electrochemi Commun 2013;31:80-83. (IF2012: 4,425).
• Brazdova, M., Navratilova, Tichy, V., Nemcova, K., Lexa, M., Hrstka, R., Pecinka, P., Adamik, M., Vojtesek, B., Palecek, E., Deppert, W., Fojta, M. Preferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells.  PLoS ONE 2013;8(3):e59567. (IF2012: 3,730)
• Smith, W., Tomasec, P., Aicheler, R., Loewendorf, A., Nemčovičová, I., Wang, E. C. Y., Stanton, R. J., Macauley, M., Norris. P., Willen, L., Ruckova, E., Nomoto, A., Schneider, P., Hahn, G., Zajonc, D. M., Ware, C. F., Wilkinson, G. W. G., Benedict, C. A. Human Cytomegalovirus Glycoprotein UL141 Targets the TRAIL Death Receptors to Thwart Host Innate Antiviral Defenses. Cell Host & Microbe 2013;13(3):324-335. (IF2012: 12,609) (Comment on Smith et al., 2013: David., R. UL141 keeps HCMV in charge. Nat Rev Microbiol 2013;11(5):297.)
• Drábová, K., Bienertová-Vašků, J., Lokaj, P., Dubská, L., Obermannová, R., Greplová, K., Demlová, R., Valík, D., Štěrba, J. Vitamin D: Its physiology, pathophysiology and significance in etiopathogenesis of malignant diseases. Čas Lék Čes 2013;152:20-30. (no IF)
• Smardova, J., Liskova, K., Ravcuková, B., Kubiczkova, L., Sevcikova, S., Michalek, J., Svitakova, M., Vybiha, l V., Kren, L., Šmarda, J. High frequency of temperature-sensitive mutants of p53 in glioblastoma. Pathol Oncol Res2013;19(3):421-428. (IF2012: 1,560)
• Hrstka, R., Murray, E., Brychtova, V., Fabian, P., Hupp, T. R., Vojtesek, B. Identification of an AKT-dependent signalling pathway that mediates tamoxifen-dependent induction of the pro-metastatic protein anterior gradient-2. Cancer Lett 2013;333(2):187-193. (IF2012: 4,258)
• Brychtova, V., Hrstka, R. Hormones in Breast Carcinogenesis.In: Simonsen D. (Ed.) Hormones and Behavior. 2013, p.121-134. ISBN: 978-1-62417-768-2. 
• Veselska, R., Neradil, J., Nekulova, M., Dobrucka, L., Vojtesek, B., Sterba, J., Zitterbart, K. Intracellular distribution of the DeltaNp73 protein isoform in medulloblastoma cells: a study with newly generated rabbit polyclonal antibodies. Histol Histopathol 2013;28:913-924. (IF2011: 2,281)
• Kucera, J., Bouchal, P., Lochman, J., Potesil, D., Janiczek, O., Zdrahal, Z., Mandl, M. Ferrous iron oxidation by sulfur-oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans and analysis of the process at the levels of transcription and protein synthesis. Antonie Van Leeuwenhoek 2013;103:905–919. (IF2012: 2,072)
• Knizek, J., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Tomsik, P. Gnostic solution of the marker statistics´problem with occurence of tested phenomena´s outlying bahaior. Int J Ecol Econ Stat 2013;29(2):34-60. (no IF) 
• Logotheti, S., Pavlopoulou, A., Galtsidis, S., Vojtesek, B., Zoumpourlis, V. Functions, divergence and clinical value of TAp73 isoforms in cancer. Cancer Metastasis Rev 2013;32(3-4):511-534. (IF2012: 7,787
• Knizek, J., Beranek, L., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Tomsik, P. Extended paired dependences´ test. Int J Appl Math Stat 2013;37(7):1-17. (no IF) 
• Bouchal, P., Dvorakova, M., Scherl, A., Garbis, S. D., Nenutil, R., Vojtesek, B. Intact protein profiling in breast cancer biomarker discovery: Protein identification issue and the solutions based on 3D protein separation, bottom-up and top-down mass spectrometry. Proteomics 2013;13(7):1053-1058. (IF2012: 4,132)
• Odraska, P., Dolezalova, L., Kuta, J., Oravec, M., Piler, P., Blaha, L. Evaluation of the Efficacy of Additional Measures Introduced for the Protection of Healthcare Personnel Handling Antineoplastic Drugs. Ann Occup Hyg2013;57(2):240-250. (IF2012: 2,157)

• Adámková Krákorová, D. Aspects of ortopedical oncology. Onkologie, 2012;6(4):190-194. (bez IF)
• Bajčiová, V. a kol. Vybrané kazuistiky nádorů u adolescentů a mladých dospělých. Mladá fronta, Praha, Česká republika. p.206. ISBN: 978-80-204-2567-6.
• Kane EV, Roman E, Becker N, Bernstein L, Boffetta P, Bracci PM, Cerhan JR, Chiu BC, Cocco P, Costas L, Foretova L, Holly EA, La Vecchia C, Matsuo K, Maynadie M, Sanjose S, Spinelli JJ, Staines A, Talamini R, Wang SS, Zhang Y, Zheng T, Kricker A; InterLymph Consortium. Menstrual and reproductive factors, and hormonal contraception use: associations with non-Hodgkin lymphoma in a pooled analysis of InterLymph case-control studies. Ann Oncol 2012;23(9):2362-2374. (IF2011: 6,425)
• Chovanec, J. Karcinom ovaria. Postgraduální medicína 2012;14(9):995–1001. (no IF)
• Bienertova-Vasku, J., Bienert, P. Adipokines as an Important Factor Related to the Prenatal Programming of Nutritional Behaviour. In: Berhardt, L. V. (Ed.) Advances in Medicine and Biology. Volume 43. Nova Science Publishers, 2012. Hauppauge NY, USA. p. 263-272. ISBN: 978-1-62100-843-9.
• Bienertova-Vasku, J., Bienert, P., Kodytkova, D., Zlamal, F., Tomandl, J., Tomandlova, M., Vasku, A., Sterba, J. BAFF Levels Are Elevated in Paediatric Patients With Acute Lymphoblastic Leukaemia Compared to Other B-Lineage Neoplasms. J Hematol 2012;1(1):20-22. (no IF)
• Hynková, L., Šlampa, P., Červená, R., Novotný, T., Syptáková, B. Mukozitida dutiny ústní u onkologických pacientů.Remedia 2012;22(1):26-30. (no IF)
• Komínek, L., Zitterbartová, J., Šlampa, P. Radioterapie zhoubných muskuloskeletálních nádorů. Ortopedie 2012;6(2):74-77. (no IF)
• Múdry, P., Štěrba, J. Pokroky v systémové léčbě kostních sarkomů. Ortopedie 2012;6(2):85-88. (no IF)
• Zdražilová Dubská, L. Telomeres, telomerase, and immortality. Folia Mendeliana 2012;48(1):35-39. (no IF)
• Doleželová, H., Hynková, L., Pospíšil, P., Kazda, T., Šlampa, P., Čoupková, I., Šiková, I., Fadrus, P., Svoboda, T., Garčic, J., Vrzal, M., Selingerová I., Horová, I. Therapeutic Results of the Treatment Brain Tumors Using Radiosurgery and Stereotactic Radiotherapy. Klin Onkol 2012;25(6):445-451. (no IF)
• Hrstka, R., Muller, P., Coates, P. J., Vojtesek, B. Hypoxia and p53. In: Pastorekova S, Kopacek, J. (Eds.) Tumour Hypoxia: Molecular Mechanism and Clinical Implications. VEDA, SAS Publishing House, Slovak Academy of Sciencees, Bratislava 2012, ISBN: 978-80-224-1261-2 ve spolupráci s Peter Lang GmbH, International Academic Publishers, Frankfurt am Main 2012, ISBN: 978-631-63991-7, p. 235-258.
• Orzol, P., Nekulova, M., Vojtesek, B., Holcakova, J. p63 - an important player in epidermal and tumour development. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S11–2S15. (no IF)
• Veselska, R., Skoda, J., Neradil, J. Detection of cancer stem cell markers in sarcomas. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S16–2S20. (no IF)
• Zdrazilova-Dubska, L., Valik, D., Budinska, E., Frgala, T., Bacikova, L., Demlova, R. NKT-like cells are expanded in solid tumour patients. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S21–2S25. (no IF)
• Kankova, K., Hrstka, R. Cancer as a metabolic disease and diabetes as a precancerosis? Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S26–2S31. (no IF)
• Ponnuswamy, A., Fahraeus, R. The regulation of p53 synthesis. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S32–2S37. (no IF)
• Trcka, F., Vojtesek, B., Muller, P. Protein quality control and cancerogenesis. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S38–2S44. (no IF)
• Durech, M., Vojtesek, B., Muller, P. The many roles of molecular chaperones and co-chaperones in tumour biology. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S45–2S49. (no IF)
• Pilatova, K., Zdrazilova-Dubska, L., Lakka Klement, G. The role of platelets in tumour growth. Klin Onkol 2012; (Suppl 2):2S50– 2S57. (no IF)
• Bienertova-Vasku, J., Lungova, A., Bienert, P., Zlámal, F., Tomandl, J., Tomandlova, M., Splichal, Z., Sterba, J. Circulating levels of B-cell activating factor in paediatric patients with malignancy with or without cancer-related cachexia. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S58– 2S63. (no IF)
• Hernychova, L., Nekulova, M., Potesil, D., Michalova, E., Zdrahal, Z., Vojtesesk, B., Holcakova, J. A combined immunoprecipitation and mass spectrometric approach to determine ΔNp63-interacting partners. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S64–2S69. (no IF)
• Faktor, J., Dvorakova, M., Maryas, J., Struharova, I., Bouchal, P. Identification and characterisation of pro-metastatic targets, pathways and molecular complexes using a toolbox of proteomic technologies. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S70–2S77. (no IF)
• Holub, P., Greplova, K., Knoflickova, D., Nenutil, R., Valik, D. The Biobanking Research Infrastructure BBMRI_CZ: A Critical Tool to Enhance Translational Cancer Research. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S78–2S81. (no IF)
• Adam, J., Bolcak, K., Kaderavek, J., Kuzel, F. Development and use of non-FDG PET radiopharmaceuticals at the Masaryk Memorial Cancer Institute. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S82–2S86. (no IF)
• Neradil, J., Pavlasova, G., Veselska, R. New mechanisms for an old drug; DHFR- and non-DHFR-mediated effects of methotrexate in cancer cells. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S87–2S92. (no IF)
• Burkon, P., Slampa, P., Kazda, T., Slavik, M., Prochazka, T., Vrzal, M. Stereotactic Body Radiation Therapy for Colorectal Cancer Liver Metastases; Early Results. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S93–2S97. (no IF)
• Demlova, R., Obermannova, R., Valik, D., Vyzula, R. Phase I Trial in Oncology – theory and practice. Klin Onkol 2012;25(Suppl 2):2S98–2S101. (no IF)
• Chlastakova, I., Liskova, M., Kudelova, J., Dubska, L., Kleparnik, K., Matalova, E. Dynamics of caspase-3 activation and inhibition in embryonic micromasses evaluated by a photon-counting chemiluminescence approach.In Vitro Cell Dev Biol Anim 2012;48(9):545-549. (IF2011: 1,312)
• Dolejska, M., Brhelova, E., Dobiasova, H., Krivdova, J., Jurankova, J., Sevcikova, A., Dubska, L., Literak, I., Cizek, A., Vavrina, M., Kutnikova, L., Sterba, J. Dissemination of IncFII(K)-type plasmids in multiresistant CTX-M-15-producing Enterobacteriaceae isolates from children in hospital paediatric oncology wards. Int J Antimicrob Agents2012;40(6):510-515. (IF2011: 3,598)
• Heczková, M., Macháčková, E., Jirsa, M., Spičák, J., Foretová, L., Hucl, T. [Evaluation of variants of unknown significance in the BRCA2 gene]. Klin Onkol 2012;25(Suppl):S87-95. (Czech). (no IF) 
• Dražan, L., Veselý, J., Hýža, P., Kubek, T., Foretová, L., Coufal, O. [Surgical prevention of breast carcinoma in patients with hereditary risk]. Klin Onkol 2012;25(Suppl):S78-83. (Czech). (no IF) 
• Pohlreich, P., Kleibl, Z., Kleiblová, P., Janatová, M., Soukupová, J., Macháčková, E., Házová, J., Vašíčková, P., Sťahlová Hrabincová, E., Navrátilová, M., Svoboda, M., Foretová, L. [The clinical importance of a genetic analysis of moderate-risk cancer susceptibility genes in breast and other cancer patients from the Czech Republic]. Klin Onkol 2012;25(Suppl):S59-66. (Czech). (no IF)
• Foretová, L., Stěrba, J., Opletal, P., Mach, V., Lisý, J., Petráková, K., Palácová, M., Navrátilová, M., Gaillyová, R., Puchmajerová, A., Křepelová, A., Macháčková, E. [Li-Fraumeni syndrome - a proposal of complex prevention care for carriers of TP53 mutation with total-body MRI]. Klin Onkol 2012;25(Suppl):S49-54. (Czech). (no IF)
• Puchmajerová, A., Vasovčák, P., Macháčková, E., Foretová, L., Křepelová, A. [Hereditary diffuse gastric cancer]. Klin Onkol 2012;25(Suppl):S30-33. (Czech). (no IF)
• Vasovčák, P., Foretová, L., Puchmajerová, A., Křepelová, A. [Juvenile polyposis syndrome]. Klin Onkol2012;25(Suppl):S16-17. (Czech). (no IF)
• Hupp, T. R., Hayward, R. L., Vojtesek, B. Strategies for p53 Reactivation in Human Sarcoma. Cancer Cell2012;22(3):283-285. (IF 2011: 26,566)
• Opletal, P., Standara, M. CT kolonografie – přehled vývoje metodiky a indikací. Klin Onkol. 2012;25(4):241-245. (no IF)
• Timofeeva, M. N. et al. Influence of common genetic variation on lung cancer risk: meta-analysis of 14 900 cases and 29 485 controls. Hum Mol Genet 2012;21(22):4980-4995. (IF2011: 7,636)
• Kudelova, J., Tucker, A. S., Dubska, L., Chlastakova, I., Doubek, J., Matalova, E. The effect of caspase-3 inhibition on interdigital tissue regression in explant cultures of developing mouse limbs. Animal Cells Syst 2012;16(4):295-301. (IF2011: 0,222)
• Zapletalova, D., André, N., Deak, L., Kyr, M., Bajciova, V., Mudry, P., Dubska, L., Demlova, R., Pavelka, Z., Zitterbart, K., Skotakova, J., Husek, K., Martincekova, A., Mazanek, P., Kepak, T., Doubek, M., Kutnikova, L., Valik, D., Sterba, J. Metronomic Chemotherapy with the COMBAT Regimen in Advanced Pediatric Malignancies: A Multicenter Experience. Oncology 2012;82(5):249-260. (IF2011: 2,267)
• Bartošík, M., Fojta, M., Paleček, E. Electrochemical detection of 5-methylcytosine in bisulfite-treated DNA. Electrochim Acta 2012;78:75-81. (IF2011: 3,832)
• Coufal, O., Vrtělová, P., Krsička, P. Operace mízních uzlin u karcinomů prsu - současný pohled. Postgraduální medicína 2012;14(4):376-383. (no IF)
• Ponnuswamy, A., Hupp, T., Fåhraeus, R. Concepts in MDM2 Signaling: Allosteric Regulation and Feedback Loops.Genes Cancer 2012;3(3-4):291-297. (no IF)
• Chovanec, J. Současná léčba karcinomu ovaria. Acta Medicinae 2012;2:54-56.(no IF)
• Matoulkova, E., Michalova, E., Vojtesek, B., Hrstka, R. The role of the 3' untranslated region in post-transcriptional regulation of protein expression in mammalian cells. RNA Biol 2012;9(5):563-576. (IF 2011: 4,933)
• Horák, D., Balonová, L., Mann, B. F., Plichta, Z., Hernychová, L., Novotny, M. V., Stulík, J. Use of magnetic hydrazide-modified polymer microspheres for enrichment of Francisella tularensis glycoproteins. Soft Matter2012;8(9):2775-2786. (IF2011: 4,39)
• Gray, T., Maclaine, N. J., Michie, C., Bouchalova, P., Murray, E., Howie, J., Hrstka, R., Maslon, M. M., Nenutil, R., Vojtesek, B., Langdon, S., Hayward, L., Gourley, C., Hupp, T. R. Anterior Gradient-3: A novel biomarker for ovarian cancer that mediates cisplatin resistance in xenograft models. J Immunol Methods 2012;378(1-2):20-32. (IF2011: 2,203)
• Dubská, L., Vyskočilová, M., Minaříková, D., Jelínek, P., Tejkalová, R., Valík, D. LightCycler SeptiFast technology in patients with solid malignancies: clinical utility for rapid etiologic diagnosis of sepsis. Crit Care 2012;16(1):404. (IF2011: 4,61)
• Bouchal, P., Stein, R., Zdráhal, Z., Jungblut, P. R., Kučera, I. 2D-PAGE Database for Studies on Energetic Metabolism of the Denitrifying Bacterium Paracoccus denitrificans. In: Hon-Chiu Leung (Ed.).
• Integrative Proteomics. InTech, Rijeka, Croatia, 2012; 141-156. ISBN 978-953-51-0070-6. 
• Knizek, J., Sindelar, J., Bouchal, P., Vojtesek, B., Nenutil, R., Beranek, L. The Marker Statistics´ Problem with Occurence of Tested Phenomena´s Outlying Behavior. Int. J. Stat. Econ 2012;9(12):83-89. (no IF)
• Kupcik, R., Rehulka, P., Jankovicova, B., Svobodova, Z., Hernychova, L., Klimentova, J., Stulik, J., Bilkova, Z. Microchip isolation combined with MS-identification of hosphoproteins of Francisella tularensis; In sborník abstaktů: CECE 2012, 9th International Interdisciplinary Meeting on Bioanalysis; 01.11.–02.11.2012; Brno, Czech Republic. Brno: Institute of Analytical Chemistry AS CR v.v.i. 2012; str. 69-73. ISBN: 978-80-904959-1-3.
• Jankovičová, B., Řehulka, P., Kupčík, R., Tichý, A., Řehulková, H., Kroupa, T., Mann, B. F., Špidlová, P., Klimentová, J., Hernychová, L., Horák, D., Stulík, J., Novotný, M. V., Bílková, Z. Metody použité pro analýzu fosfoproteinů bakterie Francisella tularensis. In Sborník: Tomáškovy dny 2012, XXI. Konference mladých mikrobiologů, 7.6.–8.6.2012, Brno, Česká republika. Brno: Masarykova univerzita 2012; str. 87-88. ISBN: 978-80-210-5874-3.
• Frostová, T., Pilátová, K., Budinská, E., Dolejská, M., Brhelová, E., Valík, D., Štěrba, J., Zdražilová-Dubská, L. Studium antibiotické rezistence pomocí proteomového profilování: analýza kmenů Klebsiella pneumoniae izolovaných z dětských onkologických pacientů. In: Sborník. Tomáškovy dny 2012, XXI. Konference mladých mikrobiologů, 7.6.–8.6.2012, Brno, Česká republika. Brno: Masarykova univerzita 2012; str. 83-84. ISBN: 978-80-210-5874-3.

• Bienertova-Vasku, J., Tomandl, J., Bienert, P., Chovanec, J., Dostalova, Z., Vasku, A., Valik, D. Circulating Levels of Agouti-Related Peptide in Endometrial Cancer Survivors. World J Oncol 2011;2(5):232-237. (no IF)
• Bouchal, P., Jarkovsky, J., Hrazdilova, K., Dvorakova, M., Struharova, I., Hernychova, L., Damborsky, J., Sova, P., Vojtesek, B. The new platinum-based anticancer agent LA-12 induces Retinol-Binding Protein 4 in vivo. Proteome Sci 2011;9(1):68. (IF2011: 2,328)
• Senitkova, I., Spidlova, P., Hernychova, L., Stulik, J. The disulfide bond formation and its relationship to bacterial pathogenicity of three important gram-negative bacteria. Mil Med Sci Lett (Voj Zdrav Listy) 2011;80:118-128. (no IF)
• Faktor, J., Struhárová, I., Fučíková, A., Hubálek, M., Vojtěšek, B., Bouchal, P. Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí. Chem Listy2011;105(11):846-850. (IF2011: 0,529)
• Chovanec J. Cílená – biologická léčba karcinomu ovaria. Prakt Gyn 2011;15(3-4):158-161. (no IF)
• Ruckova, E., Muller, P., Vojtesek, B. Hsp90 - cíl protinádorové terapie. Klin Onkol 2011;24(5):329-337. (no IF)
• Bienertová-Vašků, J., Bienert, P., Valík. D., Vašků, A. Melanocortin system in cancer-related cachexia. Cent Eur J Med 2011;6(5):550-557. (IF2011: 0,312)
• Dubska, L., Pilatova, K., Dolejska, M., Bortlicek, Z., Frostova, T., Literak, I., Valik, D. Surface-enhanced laser desorption ionization/time-of-flight (SELDI-TOF) mass spectrometry (MS) as a phenotypic method for rapid identification of antibiotic resistance. Anaerobe 2011;17(6):444-447. (IF2011: 2,409)
• Brychtova, V., Vojtesek, B., Hrstka, R. Anterior Gradient 2: a novel player in tumor cell biology. Cancer Lett2011;304(1):1–7. (IF 2011: 4,238)
• Dubská, L., Vyskočilová, M., Nenutil, R., Valík, D., Knoflíčková, D., Fabian, P., Kocáková, I., Demlová, R., Beránek, M., Drastíková, M., Vošmiková, H., Bóday, A., Horká, K., Šímová, J., Drábek, J., Ehrmann, J., Hajdúch, M., Matějčková, M., Šíma, R., Tvrdík, D., Povýšil, C., Ryška, A. Vyšetření mutačního statutu genu KRAS jako součást algoritmu léčby metastatického kolorektálního karcinomu. Čas Lék Česk 2011;150(6):321-326. (no IF)
• Gorná, L., Odráška, P., Doležalová, L., Piler, P., Oravec, M., Bláha, L. Sledování přítomnosti cyklofosfamidu ve vnitřním ovzduší a na povrchu materiálního vybavení Masarykova onkologického ústavu. Čes Slov Farm 2011;60:25-31. (no IF)
• Nekulova, M., Holcakova, J., Coates, P., Vojtesek, B. The role of p63 in cancer, stem cells and cancer stem cells.Cell Mol Biol Lett 2011;16(2):296-327. (IF2011: 1,505)
• Narayan, V., Halada, P., Hernychova, L., Chong, Y. P., Zakova, J., Hupp, T. R., Vojtesek, B., Ball. K. L. A multi-protein binding interface in an intrinsically disordered region of the tumour suppressor protein Interferon Regulatory Factor-1. J Biol Chem 2011;286(16):14291-14303. (IF2011: 4,773)
• Ondrák, M., Šefr, R., Eber, Z. Transanální endoskopická mikrochirurgie a její postavení v chirurgii rekta – review.Rozhl Chir 2011;90(8):450-456. (no IF)

• Maslon, M. M., Hrstka, R., Vojtesek, B., Hupp, T. R. A Divergent Substrate-Binding Loop within the Pro-oncogenic Protein Anterior Gradient-2 Forms a Docking Site for Reptin. J Mol Biol 2010;404(3):418–438. (IF2011: 4,001)