Úsek banky biologického materiálu (ÚsBBM)

Banka biologického materiálu (BBM) uchovává dlouhodobě zamražené nebo jinak zpracované tkáně a další humánní biologický materiál onkologických pacientů MOÚ a poskytuje jej, včetně klinických informací, především pro výzkumné projekty onkologického výzkumu MOÚ. Využití lidských nádorových vzorků umožňuje průkaz vhodných biomarkerů primárně testovaných v experimentálních výzkumných studiích. Přístup k takto archivovanému materiálu a jeho klinickým datům může usnadnit a urychlit translaci laboratorních poznatků do klinické praxe.

Provoz BBM splňuje základní metodické i etické principy pro práci s humánním materiálem.  Vývoj a využití BBM vyžaduje aktivní institucionální podporu a týmovou spolupráci pracovníků patologie, chirurgie, laboratoře a kliniků. 

Od založení BBM v roce 2000 byly veškeré vzorky archivovány v hlubokomrazicím zařízení při teplotě -80°C. V roce 2007 došlo k vybudování nových prostor určených pro BBM, umožňujících archivaci vzorků v parách kapalného dusíku při teplotě -160°C či za jiných specifických podmínek (-20°C, -80°C).

V současné době se banka biologického materiálu se skládá ze 2 základních modulů:

Long term storage modulu (LTS)a Short term storage modulu (STS).

LTS modul zahrnuje uložení tkání (primární nádorové tkáně, metastázy, tkáně nenádorové), krevních sér odebíraných při operacích, tkání uložených v RNA Lateru a genomové DNA. STS modul zahrnuje uložení krevních sér.

Nyní jsou v bance biologického materiálu v parách kapalného dusíku archivovány vzorky tkání cca od 10 680 pacientů (tj. více než 46 000 alikvotů tkání) a vzorky sér cca od 6 200 pacientů (tj. přes 18 000 alikvotů sér).

Databáze BBM je vedena v nemocničním informačním systému GreyFox, což umožňuje dohledat biologickou charakterizaci vzorku a klinický vývoj onemocnění jednotlivého pacienta. Dohledání klinických dat nutno pro každou sestavu individuálně dohodnout s lékaři klinických oddělení MOÚ.